RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 IRX4P78413 519 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 EFHC2Q5JST6 749 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 SCYL2Q6P3W7 929 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 PYROXD2Q8N2H3 581 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 TBC1D31Q96DN5 1066 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIM7Q9C029 511 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 NDFIP2Q9NV92 336 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM248Q9NWD8 314 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 SERGEFQ9UGK8 458 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 FZD10Q9ULW2 581 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 SCML1Q9UN30 329 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM191CA6NGB0 347 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 MID1O15344 667 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 CBFA2T2O43439 604 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 MT-CO1P00395 513 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYBL1P10243 752 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 RHOQP17081 205 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 PSMA2P25787 234 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAPKAPK2P49137 400 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 GNA12Q03113 381 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 DLG2Q15700 870 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 WDR45BQ5MNZ6 344 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 STPG1Q5TH74 334 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 DCAF12L1Q5VU92 463 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC23A3Q6PIS1 610 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 Q6ZVU0 165 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 USP30Q70CQ3 517 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIM11Q96F44 468 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP20.03■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 BTBD1Q9H0C5 482 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCED1AQ9H1Q7 454 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP20.03■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 METTL12A8MUP2 240 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 K7ERQ8 282 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZMPSTE24O75844 475 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 SEMA4FO95754 770 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 CFIP05156 583 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 DESP17661 470 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAOBP27338 520 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 L1CAMP32004 1257 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 AIF1P55008 147 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 SEMA3BQ13214 749 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 DUOXA1Q1HG43 343 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACCSLQ4AC99 568 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 SYCP2LQ5T4T6 812 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 LINGO4Q6UY18 593 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 RGL4Q8IZJ4 473 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 AADATQ8N5Z0 425 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 CEP76Q8TAP6 659 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 FNIP1Q8TF40 1166 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNASE2BQ8WZ79 361 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 RETREG1Q9H6L5 497 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 SGK2Q9HBY8 427 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 CAPN10Q9HC96 672 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATP13A1Q9HD20 1204 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 FBXL12Q9NXK8 326 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 SCINQ9Y6U3 715 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A087X0T9 212 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A1W2PP55 124 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADH1BP00325 375 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM228BP0C875 321 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC8A1P32418 973 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARF5P84085 180 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 RABEPKQ7Z6M1 372 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 VPS36Q86VN1 386 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 VSTM4Q8IW00 320 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATP11CQ8NB49 1132 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR8D1Q8WZ84 308 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 PEBP4Q96S96 227 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPON2Q9BUD6 331 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 FSCN3Q9NQT6 498 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYO1AQ9UBC5 1043 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNAI1Q9UI46 699 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 NENFQ9UMX5 172 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC6A14Q9UN76 642 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 DCDC2BA2VCK2 349 aa20■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 CBX4O00257 560 aa20■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 ALOX15BO15296 676 aa20■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 IL1BP01584 269 aa20■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 SERPINF2P08697 491 aa20■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 ENGP17813 658 aa20■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 C5AR1P21730 350 aa20■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACVRL1P37023 503 aa20■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLCN6P51797 869 aa20■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 METAP1P53582 386 aa20■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 C22orf39Q6P5X5 142 aa20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms