RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	CRABP2	P29373	138 aa		18.79	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	HK2	P52789	917 aa		18.79	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	BTK	Q06187	659 aa		18.79	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	MPP3	Q13368	585 aa		18.79	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	PRPSAP1	Q14558	356 aa		18.79	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		18.79	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	EPGN	Q6UW88	154 aa		18.79	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	KCNMB4	Q86W47	210 aa		18.79	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		18.79	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	RNF169	Q8NCN4	708 aa		18.79	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	RDH11	Q8TC12	318 aa		18.79	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	TTC1	Q99614	292 aa		18.79	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	VCX3B	Q9H321	246 aa		18.79	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	NMRAL1	Q9HBL8	299 aa		18.79	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	DDIT4	Q9NX09	232 aa		18.79	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		18.79	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	AP1G2	O75843	785 aa		18.79	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	BAG2	O95816	211 aa		18.79	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	NCAM1	P13591	858 aa		18.79	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	ARRB2	P32121	409 aa		18.79	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	PRKAA2	P54646	552 aa		18.79	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF33A	Q06730	810 aa		18.79	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		18.79	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	LINC00523	Q86TU6	105 aa		18.79	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	RSPH3	Q86UC2	560 aa		18.79	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	TNS4	Q8IZW8	715 aa		18.79	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		18.79	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	AGAP2	Q99490	1192 aa		18.79	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		18.79	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	COG4	Q9H9E3	785 aa		18.79	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	S100A14	Q9HCY8	104 aa		18.79	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF358	Q9NW07	568 aa		18.79	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		18.79	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559		G3V2L1	256 aa		18.78	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	LTF	P02788	710 aa		18.78	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	18.78	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	PSEN2	P49810	448 aa		18.78	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	RAB41	Q5JT25	222 aa		18.78	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		18.78	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	PLD6	Q8N2A8	252 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		18.78	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		18.78	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	UCMA	Q8WVF2	138 aa		18.78	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	GATA6	Q92908	595 aa		18.78	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	TSNARE1	Q96NA8	513 aa		18.78	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		18.78	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		18.78	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	18.78	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		18.78	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	PTGES	O14684	152 aa		18.77	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	TREH	O43280	583 aa		18.77	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	C2	P06681	752 aa		18.77	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	18.77	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	PSEN1	P49768	467 aa		18.77	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	COG7	P83436	770 aa		18.77	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	CDH17	Q12864	832 aa		18.77	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	OLIG2	Q13516	323 aa		18.77	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		18.77	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		18.77	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		18.77	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	FAM35A	Q86V20	835 aa		18.77	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		18.77	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	ADAM32	Q8TC27	787 aa		18.77	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	MFSD3	Q96ES6	412 aa		18.77	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		18.77	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	SENP8	Q96LD8	212 aa		18.77	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	TEKT5	Q96M29	485 aa		18.77	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		18.77	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	18.77	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	18.77	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	18.77	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	WDCP	Q9H6R7	721 aa		18.77	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	CDH22	Q9UJ99	828 aa		18.77	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	HAS3	O00219	553 aa		18.77	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	ATP9B	O43861	1147 aa		18.77	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	DNAJB1	P25685	340 aa		18.77	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	ANO4	Q32M45	955 aa		18.77	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		18.77	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	TLK2	Q86UE8	772 aa		18.77	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	NPW	Q8N729	165 aa		18.77	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		18.77	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		18.77	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	VPS39	Q96JC1	886 aa		18.77	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		18.77	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	OXSM	Q9NWU1	459 aa		18.77	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	OR12D3	Q9UGF7	316 aa		18.77	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	TLK1	Q9UKI8	766 aa		18.77	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		18.77	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	SCN4A	P35499	1836 aa		18.76	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	GNAT1	P11488	350 aa		18.76	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	NFKB1	P19838	968 aa		18.76	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	CXCR3	P49682	368 aa		18.76	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	CPT1A	P50416	773 aa		18.76	■□□□□ 0.59
RRN3-205	ENST00000563559	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	18.76	■□□□□ 0.59

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