RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 GFRA2O00451 464 aa20.62■□□□□ 0.89
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ODC1-202ENST00000405333 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa20.62■□□□□ 0.89
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ODC1-202ENST00000405333 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP20.62■□□□□ 0.89
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ODC1-202ENST00000405333 LINC00597Q9H2U6 94 aa20.59■□□□□ 0.89
ODC1-202ENST00000405333 EPB41L4BQ9H329 900 aa20.59■□□□□ 0.89
ODC1-202ENST00000405333 TTLL3Q9Y4R7 772 aa20.59■□□□□ 0.89
ODC1-202ENST00000405333 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 ARHGAP42A6NI28 874 aa20.58■□□□□ 0.88
ODC1-202ENST00000405333 MATN3O15232 486 aa20.58■□□□□ 0.88
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