RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021288.9

Usp43-201, Transcript of Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Usp43, Length 4,462 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp43-201ENSMUST00000021288 Stau1Q9Z108 487 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Scn7aB1AYL1 1681 aa15.6■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Nlrp1bA1Z198 1177 aa15.6■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 TpteG5E8H5 664 aa15.6■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Lhx5P61375 402 aa15.6■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Igsf9Q05BQ1 1179 aa15.6■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Satb1Q60611 764 aa15.6■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Tpd52Q62393 224 aa15.6■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Rbm12b1Q80YR9 836 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Ppme1Q8BVQ5 386 aa15.6■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Lmo3Q8BZL8 145 aa15.6■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Mrpl58Q8R035 206 aa15.6■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Kdm4bQ91VY5 1086 aa15.6■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Pcdhb13Q91Y06 796 aa15.6■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Zswim7Q9CWQ2 152 aa15.6■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Gm6408J3QNG1 320 aa15.6■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Scamp3O35609 349 aa15.6■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Scp2P32020 547 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 IdsQ08890 552 aa15.6■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Stt3bQ3TDQ1 823 aa15.6■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Mvb12bQ6KAU4 317 aa15.6■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Pramel7Q810Y8 479 aa15.6■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Zfp120Q8BZW4 436 aa15.6■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 PalmdQ9JHU2 551 aa15.6■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Map3k6Q9WTR2 1291 aa15.6■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Tnfsf13bQ9WU72 309 aa15.6■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Gys1Q9Z1E4 738 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 CitP49025 2055 aa15.6■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Zbed6D2EAC2 980 aa15.6■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Hsd17b14E9Q3D4 273 aa15.6■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Akap11E9Q777 1895 aa15.6■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Apoa4P06728 395 aa15.6■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Smpdl3bP58242 456 aa15.6■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Cpne3Q8BT60 533 aa15.6■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Pacs1Q8K212 961 aa15.6■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Haus3Q8QZX2 570 aa15.6■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Olfr1353Q8VGU8 309 aa15.6■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Tsga13Q9DA17 273 aa15.6■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Cab39lQ9DB16 337 aa15.6■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Rpn2Q9DBG6 631 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Bcl10Q9Z0H7 233 aa15.6■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Hoxc6P10629 235 aa15.59■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Wnt7bP28047 349 aa15.59■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Abce1P61222 599 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Mbtd1Q6P5G3 631 aa15.59■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Tas2r115Q7M719 310 aa15.59■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Ankrd52Q8BTI7 1076 aa15.59■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 HnrnplQ8R081 586 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Spon1Q8VCC9 807 aa15.59■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Nmd3Q99L48 503 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Chchd3Q9CRB9 227 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Pin4Q9CWW6 131 aa15.59■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 DgkeQ9R1C6 564 aa15.59■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Nrf1Q9WU00 503 aa15.59■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Phlpp1Q8CHE4 1687 aa15.59■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Casz1Q9CWL2 1761 aa15.59■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Vmn2r27D3YUK6 857 aa15.59■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 MylpfP97457 169 aa15.59■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Ntrk1Q3UFB7 799 aa15.59■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Nat9Q3UG98 241 aa15.59■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Lrrc47Q505F5 581 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 RhocQ62159 193 aa15.59■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Olfr1505Q7TQQ2 316 aa15.59■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Thoc5Q8BKT7 683 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Nipal4Q8BZF2 406 aa15.59■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Uroc1Q8VC12 676 aa15.59■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Olfr1414Q8VGU5 312 aa15.59■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Pcdhac2Q91Y09 1006 aa15.59■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Rnf181Q9CY62 165 aa15.59■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Fam227aQ9D3V8 625 aa15.59■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Fundc1Q9DB70 155 aa15.59■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Ttc7bE9Q6P5 843 aa15.59■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Rgs4O08899 205 aa15.59■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Psmb9P28076 219 aa15.59■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Rab17P35292 214 aa15.59■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Ulk3Q3U3Q1 472 aa15.59■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 2700097O09RikQ6PGK3 301 aa15.59■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Ssxb3Q6XAS4 170 aa15.59■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Vps37aQ8CHS8 397 aa15.59■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Stx19Q8R1Q0 292 aa15.59■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Ca9Q8VHB5 437 aa15.59■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Syt12Q920N7 421 aa15.59■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Q9CQC3 228 aa15.59■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Snx29Q9D3S3 818 aa15.59■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Gid8Q9D7M1 228 aa15.59■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Mta2Q9R190 668 aa15.59■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Casp7P97864 303 aa15.58■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Fam83hQ148V8 1209 aa15.58■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Aarsd1Q3THG9 412 aa15.58■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Gm1604bQ3TRG0 118 aa15.58■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Scara3Q8C850 606 aa15.58■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Spdye4bQ8CDE8 236 aa15.58■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Exd2Q8VEG4 650 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Rhobtb1Q9DAK3 695 aa15.58■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Ern2Q9Z2E3 911 aa15.58■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Gm28168A0A087WNP1 180 aa15.58■□□□□ 0.08
Usp43-201ENSMUST00000021288 Kdelc2G5E897 503 aa15.58■□□□□ 0.08
Usp43-201ENSMUST00000021288 Slc1a6O35544 561 aa15.58■□□□□ 0.08
Usp43-201ENSMUST00000021288 Fmo3P97501 534 aa15.58■□□□□ 0.08
Usp43-201ENSMUST00000021288 Ddx55Q6ZPL9 600 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35.9 ms