Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,85■■■□□ 2,85
Rab17P35292 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,87■■■□□ 2,69
Rab17P35292 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,65■■■□□ 2,66
Rab17P35292 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
Rab17P35292 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,25■■■□□ 2,59
Rab17P35292 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31,15■■■□□ 2,58
Rab17P35292 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Rab17P35292 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Rab17P35292 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Rab17P35292 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Rab17P35292 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Rab17P35292 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Rab17P35292 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Rab17P35292 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29,32■■■□□ 2,28
Rab17P35292 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Rab17P35292 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Rab17P35292 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Rab17P35292 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Rab17P35292 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Rab17P35292 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28,69■■■□□ 2,18
Rab17P35292 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Rab17P35292 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Rab17P35292 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28,48■■■□□ 2,15
Rab17P35292 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Rab17P35292 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Rab17P35292 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28,22■■■□□ 2,11
Rab17P35292 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Rab17P35292 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Rab17P35292 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,1■■■□□ 2,09
Rab17P35292 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Rab17P35292 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Rab17P35292 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28,04■■■□□ 2,08
Rab17P35292 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Rab17P35292 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Rab17P35292 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,74■■■□□ 2,03
Rab17P35292 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Rab17P35292 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27,55■■■□□ 2
Rab17P35292 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,53■■■□□ 2
Rab17P35292 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Rab17P35292 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Rab17P35292 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Rab17P35292 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Rab17P35292 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,34■■□□□ 1,97
Rab17P35292 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Rab17P35292 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27,14■■□□□ 1,94
Rab17P35292 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Rab17P35292 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Rab17P35292 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,05■■□□□ 1,92
Rab17P35292 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,92
Rab17P35292 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Rab17P35292 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26,96■■□□□ 1,91
Rab17P35292 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Rab17P35292 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,91■■□□□ 1,9
Rab17P35292 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26,89■■□□□ 1,89
Rab17P35292 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,88■■□□□ 1,89
Rab17P35292 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Rab17P35292 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26,87■■□□□ 1,89
Rab17P35292 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Rab17P35292 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26,84■■□□□ 1,89
Rab17P35292 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Rab17P35292 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26,8■■□□□ 1,88
Rab17P35292 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Rab17P35292 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Rab17P35292 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Rab17P35292 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Rab17P35292 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26,71■■□□□ 1,87
Rab17P35292 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Rab17P35292 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Rab17P35292 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Rab17P35292 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Rab17P35292 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Rab17P35292 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Rab17P35292 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Rab17P35292 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26,52■■□□□ 1,84
Rab17P35292 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Rab17P35292 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Rab17P35292 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Rab17P35292 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Rab17P35292 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Rab17P35292 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Rab17P35292 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,8
Rab17P35292 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Rab17P35292 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26,31■■□□□ 1,8
Rab17P35292 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Rab17P35292 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Rab17P35292 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26,21■■□□□ 1,79
Rab17P35292 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26,2■■□□□ 1,78
Rab17P35292 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Rab17P35292 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,77
Rab17P35292 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,13■■□□□ 1,77
Rab17P35292 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Rab17P35292 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Rab17P35292 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Rab17P35292 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Rab17P35292 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Rab17P35292 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Rab17P35292 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Rab17P35292 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26,05■■□□□ 1,76
Rab17P35292 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Rab17P35292 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26,03■■□□□ 1,76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16,9 ms