Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36,92■■■■□ 3,5
Fundc1Q9DB70 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,77■■■■□ 3,32
Fundc1Q9DB70 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,65■■■■□ 3,14
Fundc1Q9DB70 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,52■■■■□ 3,12
Fundc1Q9DB70 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33,79■■■■□ 3
Fundc1Q9DB70 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33,4■■■□□ 2,94
Fundc1Q9DB70 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,37■■■□□ 2,93
Fundc1Q9DB70 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,04■■■□□ 2,88
Fundc1Q9DB70 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32,94■■■□□ 2,86
Fundc1Q9DB70 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,6■■■□□ 2,81
Fundc1Q9DB70 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32,41■■■□□ 2,78
Fundc1Q9DB70 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,4■■■□□ 2,78
Fundc1Q9DB70 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,31■■■□□ 2,76
Fundc1Q9DB70 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32,23■■■□□ 2,75
Fundc1Q9DB70 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
Fundc1Q9DB70 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,98■■■□□ 2,71
Fundc1Q9DB70 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,97■■■□□ 2,71
Fundc1Q9DB70 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,97■■■□□ 2,71
Fundc1Q9DB70 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31,73■■■□□ 2,67
Fundc1Q9DB70 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,69■■■□□ 2,66
Fundc1Q9DB70 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,62■■■□□ 2,65
Fundc1Q9DB70 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,63
Fundc1Q9DB70 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,63
Fundc1Q9DB70 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,43■■■□□ 2,62
Fundc1Q9DB70 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
Fundc1Q9DB70 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31,32■■■□□ 2,6
Fundc1Q9DB70 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,6
Fundc1Q9DB70 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Fundc1Q9DB70 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Fundc1Q9DB70 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
Fundc1Q9DB70 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31,04■■■□□ 2,56
Fundc1Q9DB70 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Fundc1Q9DB70 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Fundc1Q9DB70 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,55
Fundc1Q9DB70 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,53
Fundc1Q9DB70 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30,88■■■□□ 2,53
Fundc1Q9DB70 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
Fundc1Q9DB70 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Fundc1Q9DB70 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Fundc1Q9DB70 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30,67■■■□□ 2,5
Fundc1Q9DB70 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30,6■■■□□ 2,49
Fundc1Q9DB70 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
Fundc1Q9DB70 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,46
Fundc1Q9DB70 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30,44■■■□□ 2,46
Fundc1Q9DB70 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Fundc1Q9DB70 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30,36■■■□□ 2,45
Fundc1Q9DB70 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Fundc1Q9DB70 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30,28■■■□□ 2,44
Fundc1Q9DB70 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30,28■■■□□ 2,44
Fundc1Q9DB70 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Fundc1Q9DB70 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Fundc1Q9DB70 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29,92■■■□□ 2,38
Fundc1Q9DB70 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Fundc1Q9DB70 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Fundc1Q9DB70 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Fundc1Q9DB70 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Fundc1Q9DB70 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29,66■■■□□ 2,34
Fundc1Q9DB70 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Fundc1Q9DB70 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Fundc1Q9DB70 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,57■■■□□ 2,32
Fundc1Q9DB70 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Fundc1Q9DB70 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Fundc1Q9DB70 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Fundc1Q9DB70 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,3
Fundc1Q9DB70 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Fundc1Q9DB70 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,41■■■□□ 2,3
Fundc1Q9DB70 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29,38■■■□□ 2,29
Fundc1Q9DB70 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Fundc1Q9DB70 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,38■■■□□ 2,29
Fundc1Q9DB70 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,37■■■□□ 2,29
Fundc1Q9DB70 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Fundc1Q9DB70 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29,27■■■□□ 2,28
Fundc1Q9DB70 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Fundc1Q9DB70 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Fundc1Q9DB70 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Fundc1Q9DB70 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29,12■■■□□ 2,25
Fundc1Q9DB70 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Fundc1Q9DB70 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Fundc1Q9DB70 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29,04■■■□□ 2,24
Fundc1Q9DB70 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Fundc1Q9DB70 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28,95■■■□□ 2,22
Fundc1Q9DB70 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Fundc1Q9DB70 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Fundc1Q9DB70 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Fundc1Q9DB70 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Fundc1Q9DB70 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Fundc1Q9DB70 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Fundc1Q9DB70 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Fundc1Q9DB70 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,77■■■□□ 2,2
Fundc1Q9DB70 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Fundc1Q9DB70 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Fundc1Q9DB70 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Fundc1Q9DB70 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,73■■■□□ 2,19
Fundc1Q9DB70 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28,72■■■□□ 2,19
Fundc1Q9DB70 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Fundc1Q9DB70 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Fundc1Q9DB70 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Fundc1Q9DB70 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28,68■■■□□ 2,18
Fundc1Q9DB70 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Fundc1Q9DB70 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,2 ms