Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34,19■■■■□ 3,06
Ulk3Q3U3Q1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,34■■■□□ 2,77
Ulk3Q3U3Q1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,46■■■□□ 2,63
Ulk3Q3U3Q1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Ulk3Q3U3Q1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,28■■■□□ 2,6
Ulk3Q3U3Q1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Ulk3Q3U3Q1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30,45■■■□□ 2,47
Ulk3Q3U3Q1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30,08■■■□□ 2,41
Ulk3Q3U3Q1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Ulk3Q3U3Q1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29,87■■■□□ 2,37
Ulk3Q3U3Q1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Ulk3Q3U3Q1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Ulk3Q3U3Q1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Ulk3Q3U3Q1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29,44■■■□□ 2,3
Ulk3Q3U3Q1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29,36■■■□□ 2,29
Ulk3Q3U3Q1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Ulk3Q3U3Q1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Ulk3Q3U3Q1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Ulk3Q3U3Q1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Ulk3Q3U3Q1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Ulk3Q3U3Q1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Ulk3Q3U3Q1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Ulk3Q3U3Q1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Ulk3Q3U3Q1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Ulk3Q3U3Q1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Ulk3Q3U3Q1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28,67■■■□□ 2,18
Ulk3Q3U3Q1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Ulk3Q3U3Q1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28,66■■■□□ 2,18
Ulk3Q3U3Q1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Ulk3Q3U3Q1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Ulk3Q3U3Q1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Ulk3Q3U3Q1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,39■■■□□ 2,13
Ulk3Q3U3Q1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Ulk3Q3U3Q1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Ulk3Q3U3Q1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Ulk3Q3U3Q1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Ulk3Q3U3Q1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28,03■■■□□ 2,08
Ulk3Q3U3Q1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Ulk3Q3U3Q1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27,96■■■□□ 2,07
Ulk3Q3U3Q1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Ulk3Q3U3Q1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Ulk3Q3U3Q1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,9■■■□□ 2,06
Ulk3Q3U3Q1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Ulk3Q3U3Q1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27,69■■■□□ 2,02
Ulk3Q3U3Q1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,66■■■□□ 2,02
Ulk3Q3U3Q1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Ulk3Q3U3Q1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Ulk3Q3U3Q1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Ulk3Q3U3Q1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,52■■■□□ 2
Ulk3Q3U3Q1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,99
Ulk3Q3U3Q1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Ulk3Q3U3Q1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,26■■□□□ 1,96
Ulk3Q3U3Q1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Ulk3Q3U3Q1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Ulk3Q3U3Q1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27,1■■□□□ 1,93
Ulk3Q3U3Q1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Ulk3Q3U3Q1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Ulk3Q3U3Q1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,05■■□□□ 1,92
Ulk3Q3U3Q1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27,05■■□□□ 1,92
Ulk3Q3U3Q1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Ulk3Q3U3Q1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Ulk3Q3U3Q1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Ulk3Q3U3Q1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,91
Ulk3Q3U3Q1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26,94■■□□□ 1,9
Ulk3Q3U3Q1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Ulk3Q3U3Q1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,92■■□□□ 1,9
Ulk3Q3U3Q1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26,89■■□□□ 1,9
Ulk3Q3U3Q1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Ulk3Q3U3Q1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Ulk3Q3U3Q1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26,82■■□□□ 1,88
Ulk3Q3U3Q1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,8■■□□□ 1,88
Ulk3Q3U3Q1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26,8■■□□□ 1,88
Ulk3Q3U3Q1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,79■■□□□ 1,88
Ulk3Q3U3Q1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26,79■■□□□ 1,88
Ulk3Q3U3Q1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Ulk3Q3U3Q1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26,75■■□□□ 1,87
Ulk3Q3U3Q1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Ulk3Q3U3Q1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Ulk3Q3U3Q1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Ulk3Q3U3Q1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Ulk3Q3U3Q1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Ulk3Q3U3Q1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26,56■■□□□ 1,84
Ulk3Q3U3Q1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Ulk3Q3U3Q1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,54■■□□□ 1,84
Ulk3Q3U3Q1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Ulk3Q3U3Q1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Ulk3Q3U3Q1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Ulk3Q3U3Q1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,48■■□□□ 1,83
Ulk3Q3U3Q1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Ulk3Q3U3Q1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Ulk3Q3U3Q1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Ulk3Q3U3Q1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Ulk3Q3U3Q1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Ulk3Q3U3Q1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Ulk3Q3U3Q1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26,36■■□□□ 1,81
Ulk3Q3U3Q1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Ulk3Q3U3Q1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Ulk3Q3U3Q1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Ulk3Q3U3Q1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26,26■■□□□ 1,79
Ulk3Q3U3Q1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
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