Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Ulk3Q3U3Q1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ulk3Q3U3Q1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ulk3Q3U3Q1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ulk3Q3U3Q1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Ulk3Q3U3Q1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ulk3Q3U3Q1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Ulk3Q3U3Q1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Ulk3Q3U3Q1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ulk3Q3U3Q1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Ulk3Q3U3Q1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ulk3Q3U3Q1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ulk3Q3U3Q1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ulk3Q3U3Q1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Ulk3Q3U3Q1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Ulk3Q3U3Q1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ulk3Q3U3Q1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ulk3Q3U3Q1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ulk3Q3U3Q1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ulk3Q3U3Q1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ulk3Q3U3Q1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ulk3Q3U3Q1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ulk3Q3U3Q1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ulk3Q3U3Q1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ulk3Q3U3Q1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ulk3Q3U3Q1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Ulk3Q3U3Q1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ulk3Q3U3Q1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Ulk3Q3U3Q1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ulk3Q3U3Q1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ulk3Q3U3Q1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ulk3Q3U3Q1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ulk3Q3U3Q1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ulk3Q3U3Q1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ulk3Q3U3Q1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ulk3Q3U3Q1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ulk3Q3U3Q1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ulk3Q3U3Q1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ulk3Q3U3Q1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Ulk3Q3U3Q1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ulk3Q3U3Q1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ulk3Q3U3Q1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ulk3Q3U3Q1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ulk3Q3U3Q1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ulk3Q3U3Q1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Ulk3Q3U3Q1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ulk3Q3U3Q1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ulk3Q3U3Q1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ulk3Q3U3Q1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Ulk3Q3U3Q1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ulk3Q3U3Q1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ulk3Q3U3Q1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Ulk3Q3U3Q1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ulk3Q3U3Q1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ulk3Q3U3Q1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ulk3Q3U3Q1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ulk3Q3U3Q1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ulk3Q3U3Q1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ulk3Q3U3Q1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ulk3Q3U3Q1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ulk3Q3U3Q1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ulk3Q3U3Q1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ulk3Q3U3Q1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ulk3Q3U3Q1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ulk3Q3U3Q1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ulk3Q3U3Q1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ulk3Q3U3Q1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Ulk3Q3U3Q1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ulk3Q3U3Q1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ulk3Q3U3Q1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ulk3Q3U3Q1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ulk3Q3U3Q1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Ulk3Q3U3Q1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ulk3Q3U3Q1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ulk3Q3U3Q1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ulk3Q3U3Q1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ulk3Q3U3Q1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ulk3Q3U3Q1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ulk3Q3U3Q1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ulk3Q3U3Q1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ulk3Q3U3Q1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ulk3Q3U3Q1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ulk3Q3U3Q1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ulk3Q3U3Q1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ulk3Q3U3Q1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ulk3Q3U3Q1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ulk3Q3U3Q1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ulk3Q3U3Q1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ulk3Q3U3Q1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ulk3Q3U3Q1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ulk3Q3U3Q1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ulk3Q3U3Q1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ulk3Q3U3Q1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ulk3Q3U3Q1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ulk3Q3U3Q1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ulk3Q3U3Q1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ulk3Q3U3Q1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ulk3Q3U3Q1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ulk3Q3U3Q1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ulk3Q3U3Q1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
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