RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 GRIA1P42261 906 aa20.78■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 WASHC5Q12768 1159 aa20.78■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP20.78■□□□□ 0.927e-8■□□□□ 11.2
PACSIN3-211ENST00000539589 MGAT5BQ3V5L5 792 aa20.78■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM240Q5SV17 173 aa20.78■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa20.78■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 LRRC8CQ8TDW0 803 aa20.78■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 OR12D3Q9UGF7 316 aa20.78■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa20.78■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa20.78■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 GOLGA8RI6L899 631 aa20.77■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 GJB5O95377 273 aa20.77■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 DSG1Q02413 1049 aa20.77■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 FPGSQ05932 587 aa20.77■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 SMARCB1Q12824 385 aa20.77■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 LRRC8BQ6P9F7 803 aa20.77■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF567Q8N184 647 aa20.77■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 RNF34Q969K3 372 aa20.77■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa20.77■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 ABCC13Q9NSE7 274 aa20.77■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 SPG21Q9NZD8 308 aa20.77■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 NUDT5Q9UKK9 219 aa20.77■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 GRID1Q9ULK0 1009 aa20.77■□□□□ 0.92
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM92AA1XBS5 289 aa20.77■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 ATF6P18850 670 aa20.77■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 MX2P20592 715 aa20.77■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 BTBD8Q5XKL5 378 aa20.77■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 KIAA1841Q6NSI8 718 aa20.77■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 C7orf61Q8IZ16 206 aa20.77■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 MPP5Q8N3R9 675 aa20.77■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 TCP10LQ8TDR4 215 aa20.77■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa20.77■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa20.77■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 IGSF9Q9P2J2 1179 aa20.77■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa20.77■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 SDR42E2A6NKP2 422 aa20.76■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 F5H423 210 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 H0YHG0 523 aa20.76■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 LPXNO60711 386 aa20.76■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 SERPINB6P35237 376 aa20.76■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC18A2Q05940 514 aa20.76■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 DNAJC3Q13217 504 aa20.76■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM47EQ6ZV65 393 aa20.76■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 CYS1Q717R9 158 aa20.76■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 PID1Q7Z2X4 250 aa20.76■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 AUTS2Q8WXX7 1259 aa20.76■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 CASP10Q92851 521 aa20.76■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 CEP41Q9BYV8 373 aa20.76■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 GMIPQ9P107 970 aa20.76■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 PRKAG3Q9UGI9 489 aa20.76■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 STARD13Q9Y3M8 1113 aa20.76■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 MTSS1O43312 755 aa20.75■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 SEC24AO95486 1093 aa20.75■□□□□ 0.91
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PACSIN3-211ENST00000539589 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 MON1AQ86VX9 555 aa20.75■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 CCNJLQ8IV13 435 aa20.75■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 TP53INP2Q8IXH6 220 aa20.75■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 GIPC2Q8TF65 315 aa20.75■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 APOPT1Q96IL0 206 aa20.75■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 SERAC1Q96JX3 654 aa20.75■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 SPATA17Q96L03 361 aa20.75■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 FBXO44Q9H4M3 255 aa20.75■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 KLHL14Q9P2G3 628 aa20.75■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa20.75■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM159BA6NKW6 160 aa20.75■□□□□ 0.91
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PACSIN3-211ENST00000539589 SYN1P17600 705 aa20.75■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 EPHB2P29323 1055 aa20.75■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 SCTRP47872 440 aa20.75■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 OSBPL2Q9H1P3 480 aa20.75■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 VPS11Q9H270 941 aa20.75■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 PHTF1Q9UMS5 762 aa20.75■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 SNX10Q9Y5X0 201 aa20.75■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 NUP205Q92621 2012 aa20.74■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 TRIM49D1C9J1S8 452 aa20.74■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 IRAK2O43187 625 aa20.74■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM155BO75949 473 aa20.74■□□□□ 0.91
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PACSIN3-211ENST00000539589 LRIG2O94898 1065 aa20.74■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 ABLIM3O94929 683 aa20.74■□□□□ 0.91
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PACSIN3-211ENST00000539589 ADRA1DP25100 572 aa20.74■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 PTPN3P26045 913 aa20.74■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 SPRED3Q2MJR0 410 aa20.74■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 STEAP4Q687X5 459 aa20.74■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 CGB2Q6NT52 195 aa20.74■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 CASC4Q6P4E1 433 aa20.74■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 SH2D5Q6ZV89 423 aa20.74■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 NPWQ8N729 165 aa20.74■□□□□ 0.91
PACSIN3-211ENST00000539589 MTBPQ96DY7 904 aa20.74■□□□□ 0.91
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