RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000432547.7

TTR-202, Transcript of transthyretin, humanhuman

TSL 2

Gene TTR, Length 745 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTR-202ENST00000432547 SPAG1Q07617 926 aa6.86□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 ADCY1Q08828 1119 aa6.86□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 SURF1Q15526 300 aa6.86□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 KYAT1Q16773 422 aa6.86□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 ZNF528Q3MIS6 628 aa6.86□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 TANGO2Q6ICL3 276 aa6.86□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 ZNF585AQ6P3V2 769 aa6.86□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 STRA8Q7Z7C7 330 aa6.86□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 PALM2Q8IXS6 379 aa6.86□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa6.86□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 LEMD2Q8NC56 503 aa6.86□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 BVESQ8NE79 360 aa6.86□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 BEST2Q8NFU1 509 aa6.86□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 HPS3Q969F9 1004 aa6.86□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 CLDN23Q96B33 292 aa6.86□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 TCEAL4Q96EI5 215 aa6.86□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 TSPAN18Q96SJ8 248 aa6.86□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 STRA6Q9BX79 667 aa6.86□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 TBC1D7Q9P0N9 293 aa6.86□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 CEP72Q9P209 647 aa6.86□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 FBXO4Q9UKT5 387 aa6.86□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 TBX20Q9UMR3 447 aa6.86□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa6.86□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 A0A0B4J269 797 aa6.85□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 A0A1B0GVL5 298 aa6.85□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 PATE3B3GLJ2 98 aa6.85□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 ANKRD63C9JTQ0 380 aa6.85□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 XPOTO43592 962 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 RFPL3O75679 317 aa6.85□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 IDEP14735 1019 aa6.85□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 PFKFB1P16118 471 aa6.85□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 CD72P21854 359 aa6.85□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 ABCD1P33897 745 aa6.85□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 BCL6P41182 706 aa6.85□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 RPS9P46781 194 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 LIG4P49917 911 aa6.85□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 GTF2BQ00403 316 aa6.85□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 TWF1Q12792 350 aa6.85□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 GPR17Q13304 367 aa6.85□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 UBXN2BQ14CS0 331 aa6.85□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 FAM78AQ5JUQ0 283 aa6.85□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa6.85□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 MROH9Q5TGP6 573 aa6.85□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 SPATA1Q5VX52 437 aa6.85□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 VHLLQ6RSH7 139 aa6.85□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 VITQ6UXI7 678 aa6.85□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 TPRG1Q6ZUI0 275 aa6.85□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 ZNF720Q7Z2F6 126 aa6.85□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 TMC8Q8IU68 726 aa6.85□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 TRIM59Q8IWR1 403 aa6.85□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 ELMOD1Q8N336 334 aa6.85□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 NELL1Q92832 810 aa6.85□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 SMARCD2Q92925 531 aa6.85□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 BICD1Q96G01 975 aa6.85□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 NELL2Q99435 816 aa6.85□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 SPATA9Q9BWV2 254 aa6.85□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 TRIM9Q9C026 710 aa6.85□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.85□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 BLZF1Q9H2G9 400 aa6.85□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 TNMDQ9H2S6 317 aa6.85□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa6.85□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa6.85□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 TRPV4Q9HBA0 871 aa6.85□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 ZFP14Q9HCL3 533 aa6.85□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 TRPV5Q9NQA5 729 aa6.85□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 ASAH2Q9NR71 780 aa6.85□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 HEBP1Q9NRV9 189 aa6.85□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 INTUQ9ULD6 942 aa6.85□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 HPSEQ9Y251 543 aa6.85□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 YIPF1Q9Y548 306 aa6.85□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 THADAQ6YHU6 1953 aa6.84□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 ANO9A1A5B4 782 aa6.84□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 OR6C75A6NL08 312 aa6.84□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 LACTBL1A8MY62 500 aa6.84□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 PIRO00625 290 aa6.84□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 PPEF2O14830 753 aa6.84□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 NCAM2O15394 837 aa6.84□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 TBX1O43435 398 aa6.84□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 FZD7O75084 574 aa6.84□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 OR4Q2P0C623 313 aa6.84□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 PSMC3P17980 439 aa6.84□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 TYMPP19971 482 aa6.84□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 CMA1P23946 247 aa6.84□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 NDUFA8P51970 172 aa6.84□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 LILRA4P59901 499 aa6.84□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 PPP2CBP62714 309 aa6.84□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 PPP2CAP67775 309 aa6.84□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 KLF10Q13118 480 aa6.84□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 PLD1Q13393 1074 aa6.84□□□□□ -1.31
TTR-202ENST00000432547 CUL4BQ13620 913 aa6.84□□□□□ -1.31
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