RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 VPS45Q9NRW7 570 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 ADPRHL2Q9NX46 363 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 TSPAN16Q9UKR8 245 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC154A6NI56 674 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 TNFRSF21O75509 655 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 CXCL8P10145 99 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 ITGAXP20702 1163 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 MGAT1P26572 445 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 TKTP29401 623 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 RAP1GAPP47736 663 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 PLK1P53350 603 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 TSNQ15631 228 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 VPS72Q15906 364 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 LZTR1Q8N653 840 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 ITFG1Q8TB96 612 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 ACTRT2Q8TDY3 377 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 PDCD2LQ9BRP1 358 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 VPS51Q9UID3 782 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 BTBD3Q9Y2F9 522 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 SNX8Q9Y5X2 465 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP11.19□□□□□ -0.622e-10■■□□□ 11.7
EFTUD2-202ENST00000426333 PDE9AO76083 593 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 PGAM1P18669 254 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 ADARP55265 1226 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC45A4Q5BKX6 768 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 FGD3Q5JSP0 725 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF280DQ6N043 979 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 TTC27Q6P3X3 843 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 KIAA0895Q8NCT3 520 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 LPCAT1Q8NF37 534 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 MCOLN3Q8TDD5 553 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 FNIP1Q8TF40 1166 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 DLG3Q92796 817 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 RIBC2Q9H4K1 309 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A087WZ62 844 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 EFCAB10A6NFE3 127 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 PIGNO95427 931 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP6V1C1P21283 382 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 S100A3P33764 101 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 GPR15P49685 360 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 SEC23AQ15436 765 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 KLHL17Q6TDP4 642 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 FLCNQ8NFG4 579 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 UBASH3BQ8TF42 649 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 SYT15Q9BQS2 421 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 KLHL1Q9NR64 748 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 DNPEPQ9ULA0 475 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 UTRNP46939 3433 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 MYL12BO14950 172 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 KLHL18O94889 574 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 RPS12P25398 132 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 RXRGP48443 463 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 NR2C2P49116 596 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 RARRES1P49788 294 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 HK2P52789 917 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 NFIAQ12857 509 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 EPS8Q12929 822 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 SPANXN3Q5MJ09 141 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 SAMD7Q7Z3H4 446 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 MILR1Q7Z6M3 343 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 CDH24Q86UP0 819 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 TXNRD3Q86VQ6 643 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 CAMK1DQ8IU85 385 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 EDEM1Q92611 657 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 SEMA4DQ92854 862 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 ASB2Q96Q27 587 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 CPNE1Q99829 537 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 LRP5O75197 1615 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 C4AP0C0L4 1744 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 C4BP0C0L5 1744 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM205AQ6ZU69 1335 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 WDR27A2RRH5 827 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 HOXA2O43364 376 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 VTNP04004 478 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 ALADP13716 330 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 CYP2A7P20853 494 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 FGFR2P21802 821 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 AMPD1P23109 780 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 HUNKP57058 714 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 ACSM2AQ08AH3 577 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 DGCR6Q14129 220 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 TAF5Q15542 800 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 NTRK3Q16288 839 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 ACSM2BQ68CK6 577 aa11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms