RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020163.6

Nedd1-201, Transcript of Protein NEDD1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nedd1, Length 3,534 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm13040A2A8C4 496 aa10.15□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm13101A2ASJ0 481 aa10.15□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rabgap1A2AWA9 1064 aa10.15□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm13119B1ARV5 481 aa10.15□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mkrn2osD3Z393 217 aa10.15□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm13128L7MU96 475 aa10.15□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cyp4a14O35728 507 aa10.15□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Axin2O88566 840 aa10.15□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Krt13P08730 437 aa10.15□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sesn2P58043 480 aa10.15□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nsun2Q1HFZ0 757 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ptbp3Q8BHD7 523 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 MtbpQ8BJS8 894 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 6820408C15RikQ8BJX2 354 aa10.15□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 PdhxQ8BKZ9 501 aa10.15□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 TiparpQ8C1B2 657 aa10.15□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Adamts2Q8C9W3 1213 aa10.15□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 NeproQ8R2U2 564 aa10.15□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tmem98Q91X86 226 aa10.15□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Polr3fQ921X6 316 aa10.15□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mcrs1Q99L90 462 aa10.15□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pex6Q99LC9 981 aa10.15□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tmed10Q9D1D4 219 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cdkl2Q9QUK0 568 aa10.15□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 PigqQ9QYT7 581 aa10.15□□□□□ -0.78
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sult2a6B2RVI8 285 aa10.15□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Svs3aF2Z472 265 aa10.15□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 RapsnP12672 412 aa10.15□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Psmd3P14685 530 aa10.15□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Emilin3P59900 758 aa10.15□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Trafd1Q3UDK1 580 aa10.15□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mylk4Q5SUV5 386 aa10.15□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Trim38Q5SZ99 471 aa10.15□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Samhd1Q60710 627 aa10.15□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Thnsl1Q8BH55 747 aa10.15□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tcaf1Q8BNE1 924 aa10.15□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gpn2Q8VEJ1 310 aa10.15□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gprc5bQ923Z0 410 aa10.15□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 PudpQ9D5U5 234 aa10.15□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cyp4f14Q9EP75 524 aa10.15□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 CtsrQ9JIA9 334 aa10.15□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mtmr2Q9Z2D1 643 aa10.15□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sbf2E9PXF8 1872 aa10.14□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm15448F6PZL4 682 aa10.14□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Acvr2bP27040 536 aa10.14□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 RxraP28700 467 aa10.14□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 NfibP97863 570 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfml2bQ3V1G4 746 aa10.14□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Myo1gQ5SUA5 1024 aa10.14□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Myl6Q60605 151 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Il15raQ60819 263 aa10.14□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cspg5Q71M36 566 aa10.14□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Btnl1Q7TST0 509 aa10.14□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rap2cQ8BU31 183 aa10.14□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tmem62Q8BXJ9 643 aa10.14□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tmc7Q8C428 726 aa10.14□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Q8CD60 292 aa10.14□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cabcoco1Q8CDT7 208 aa10.14□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gbp5Q8CFB4 590 aa10.14□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Aqp12Q8CHJ2 290 aa10.14□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Plcl2Q8K394 1128 aa10.14□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dennd2dQ91VV4 469 aa10.14□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tdrd3Q91W18 743 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pcdhgc3Q91XX1 934 aa10.14□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Prmt3Q922H1 532 aa10.14□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mageb3Q9D2H4 330 aa10.14□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mybpc1D3YU50 1127 aa10.14□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Taf4E9QAP7 1042 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Alas2P08680 587 aa10.14□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Myf6P15375 242 aa10.14□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Alox12eP55249 662 aa10.14□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Taf1bP97358 586 aa10.14□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gpd1lQ3ULJ0 351 aa10.14□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Adamts18Q4VC17 1219 aa10.14□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Znf148Q61624 794 aa10.14□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Hsph1Q61699 858 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Krt72Q6IME9 520 aa10.14□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Znf513Q6PD29 541 aa10.14□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc39a14Q75N73 489 aa10.14□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sel1l3Q80TS8 1137 aa10.14□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pak5Q8C015 719 aa10.14□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 TbccQ8VCN9 341 aa10.14□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr784Q8VFZ9 319 aa10.14□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Med7Q9CZB6 233 aa10.14□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tmbim6Q9D2C7 237 aa10.14□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Spata9Q9D9R3 252 aa10.14□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gpc6Q9R087 555 aa10.14□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ap4b1Q9WV76 738 aa10.14□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 AadatQ9WVM8 425 aa10.14□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Shcbp1Q9Z179 668 aa10.14□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fem1bQ9Z2G0 627 aa10.14□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 1700011I03RikE9PYL8 271 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Il4i1O09046 630 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cyp2j6O54750 501 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Bcat1P24288 386 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Glud1P26443 558 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Map3k7clP58500 142 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Grm1P97772 1199 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Micall2Q3TN34 1009 aa10.13□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Hspa1aQ61696 641 aa10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 43.4 ms