Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF8

Sbf2, SET-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbf2E9PXF8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC43,76■■■■■ 4,6
Sbf2E9PXF8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40,65■■■■■ 4,1
Sbf2E9PXF8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,69■■■■□ 3,94
Sbf2E9PXF8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38,26■■■■□ 3,72
Sbf2E9PXF8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38,12■■■■□ 3,69
Sbf2E9PXF8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,77■■■■□ 3,64
Sbf2E9PXF8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37,76■■■■□ 3,64
Sbf2E9PXF8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,14■■■■□ 3,54
Sbf2E9PXF8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,07■■■■□ 3,52
Sbf2E9PXF8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,93■■■■□ 3,5
Sbf2E9PXF8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36,64■■■■□ 3,46
Sbf2E9PXF8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,5■■■■□ 3,43
Sbf2E9PXF8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,5■■■■□ 3,43
Sbf2E9PXF8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36,45■■■■□ 3,43
Sbf2E9PXF8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,77■■■■□ 3,32
Sbf2E9PXF8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35,59■■■■□ 3,29
Sbf2E9PXF8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,55■■■■□ 3,28
Sbf2E9PXF8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35,44■■■■□ 3,26
Sbf2E9PXF8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,31■■■■□ 3,24
Sbf2E9PXF8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,25■■■■□ 3,23
Sbf2E9PXF8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35,11■■■■□ 3,21
Sbf2E9PXF8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35,07■■■■□ 3,21
Sbf2E9PXF8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,07■■■■□ 3,2
Sbf2E9PXF8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3,19
Sbf2E9PXF8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34,95■■■■□ 3,19
Sbf2E9PXF8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,91■■■■□ 3,18
Sbf2E9PXF8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,89■■■■□ 3,18
Sbf2E9PXF8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
Sbf2E9PXF8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,83■■■■□ 3,17
Sbf2E9PXF8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34,81■■■■□ 3,16
Sbf2E9PXF8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34,77■■■■□ 3,16
Sbf2E9PXF8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,7■■■■□ 3,15
Sbf2E9PXF8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,69■■■■□ 3,14
Sbf2E9PXF8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,65■■■■□ 3,14
Sbf2E9PXF8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34,54■■■■□ 3,12
Sbf2E9PXF8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34,5■■■■□ 3,11
Sbf2E9PXF8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
Sbf2E9PXF8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34,26■■■■□ 3,07
Sbf2E9PXF8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33,87■■■■□ 3,01
Sbf2E9PXF8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,76■■■□□ 2,99
Sbf2E9PXF8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,71■■■□□ 2,99
Sbf2E9PXF8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33,7■■■□□ 2,99
Sbf2E9PXF8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33,7■■■□□ 2,99
Sbf2E9PXF8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,67■■■□□ 2,98
Sbf2E9PXF8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33,62■■■□□ 2,97
Sbf2E9PXF8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,62■■■□□ 2,97
Sbf2E9PXF8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,61■■■□□ 2,97
Sbf2E9PXF8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33,6■■■□□ 2,97
Sbf2E9PXF8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,55■■■□□ 2,96
Sbf2E9PXF8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,52■■■□□ 2,96
Sbf2E9PXF8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33,45■■■□□ 2,95
Sbf2E9PXF8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,34■■■□□ 2,93
Sbf2E9PXF8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33,27■■■□□ 2,92
Sbf2E9PXF8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33,25■■■□□ 2,91
Sbf2E9PXF8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,23■■■□□ 2,91
Sbf2E9PXF8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33,18■■■□□ 2,9
Sbf2E9PXF8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33,16■■■□□ 2,9
Sbf2E9PXF8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,14■■■□□ 2,9
Sbf2E9PXF8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,08■■■□□ 2,89
Sbf2E9PXF8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,96■■■□□ 2,87
Sbf2E9PXF8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32,92■■■□□ 2,86
Sbf2E9PXF8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32,9■■■□□ 2,86
Sbf2E9PXF8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,83■■■□□ 2,85
Sbf2E9PXF8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32,83■■■□□ 2,85
Sbf2E9PXF8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32,82■■■□□ 2,85
Sbf2E9PXF8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,81■■■□□ 2,84
Sbf2E9PXF8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,77■■■□□ 2,84
Sbf2E9PXF8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,76■■■□□ 2,83
Sbf2E9PXF8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32,73■■■□□ 2,83
Sbf2E9PXF8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32,68■■■□□ 2,82
Sbf2E9PXF8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32,57■■■□□ 2,8
Sbf2E9PXF8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,55■■■□□ 2,8
Sbf2E9PXF8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Sbf2E9PXF8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Sbf2E9PXF8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Sbf2E9PXF8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,49■■■□□ 2,79
Sbf2E9PXF8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32,46■■■□□ 2,79
Sbf2E9PXF8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC32,46■■■□□ 2,79
Sbf2E9PXF8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,44■■■□□ 2,78
Sbf2E9PXF8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,43■■■□□ 2,78
Sbf2E9PXF8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,43■■■□□ 2,78
Sbf2E9PXF8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,41■■■□□ 2,78
Sbf2E9PXF8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32,41■■■□□ 2,78
Sbf2E9PXF8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC32,4■■■□□ 2,78
Sbf2E9PXF8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32,4■■■□□ 2,78
Sbf2E9PXF8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32,38■■■□□ 2,77
Sbf2E9PXF8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,37■■■□□ 2,77
Sbf2E9PXF8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,35■■■□□ 2,77
Sbf2E9PXF8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC32,18■■■□□ 2,74
Sbf2E9PXF8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,17■■■□□ 2,74
Sbf2E9PXF8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC32,15■■■□□ 2,74
Sbf2E9PXF8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32,15■■■□□ 2,74
Sbf2E9PXF8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
Sbf2E9PXF8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32,12■■■□□ 2,73
Sbf2E9PXF8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC32,11■■■□□ 2,73
Sbf2E9PXF8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32,1■■■□□ 2,73
Sbf2E9PXF8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,06■■■□□ 2,72
Sbf2E9PXF8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Sbf2E9PXF8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2,71
Sbf2E9PXF8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31,98■■■□□ 2,71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,4 ms