Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU31

Rap2c, Ras-related protein Rap-2c, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rap2cQ8BU31 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Rap2cQ8BU31 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
Rap2cQ8BU31 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Rap2cQ8BU31 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Rap2cQ8BU31 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
Rap2cQ8BU31 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Rap2cQ8BU31 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Rap2cQ8BU31 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Rap2cQ8BU31 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Rap2cQ8BU31 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Rap2cQ8BU31 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Rap2cQ8BU31 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Rap2cQ8BU31 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Rap2cQ8BU31 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Rap2cQ8BU31 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rap2cQ8BU31 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rap2cQ8BU31 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
Rap2cQ8BU31 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Rap2cQ8BU31 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Rap2cQ8BU31 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rap2cQ8BU31 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rap2cQ8BU31 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rap2cQ8BU31 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rap2cQ8BU31 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rap2cQ8BU31 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rap2cQ8BU31 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Rap2cQ8BU31 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rap2cQ8BU31 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rap2cQ8BU31 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rap2cQ8BU31 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rap2cQ8BU31 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rap2cQ8BU31 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rap2cQ8BU31 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rap2cQ8BU31 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rap2cQ8BU31 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rap2cQ8BU31 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rap2cQ8BU31 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rap2cQ8BU31 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Rap2cQ8BU31 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Rap2cQ8BU31 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rap2cQ8BU31 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rap2cQ8BU31 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rap2cQ8BU31 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rap2cQ8BU31 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Rap2cQ8BU31 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rap2cQ8BU31 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Rap2cQ8BU31 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rap2cQ8BU31 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rap2cQ8BU31 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rap2cQ8BU31 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Rap2cQ8BU31 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rap2cQ8BU31 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rap2cQ8BU31 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rap2cQ8BU31 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rap2cQ8BU31 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rap2cQ8BU31 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rap2cQ8BU31 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rap2cQ8BU31 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rap2cQ8BU31 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rap2cQ8BU31 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Rap2cQ8BU31 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rap2cQ8BU31 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rap2cQ8BU31 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rap2cQ8BU31 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Rap2cQ8BU31 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rap2cQ8BU31 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rap2cQ8BU31 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rap2cQ8BU31 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rap2cQ8BU31 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rap2cQ8BU31 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rap2cQ8BU31 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rap2cQ8BU31 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rap2cQ8BU31 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rap2cQ8BU31 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rap2cQ8BU31 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rap2cQ8BU31 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rap2cQ8BU31 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rap2cQ8BU31 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rap2cQ8BU31 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rap2cQ8BU31 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rap2cQ8BU31 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rap2cQ8BU31 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rap2cQ8BU31 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rap2cQ8BU31 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rap2cQ8BU31 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rap2cQ8BU31 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rap2cQ8BU31 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rap2cQ8BU31 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rap2cQ8BU31 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rap2cQ8BU31 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rap2cQ8BU31 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rap2cQ8BU31 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rap2cQ8BU31 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rap2cQ8BU31 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rap2cQ8BU31 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rap2cQ8BU31 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rap2cQ8BU31 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Rap2cQ8BU31 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rap2cQ8BU31 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rap2cQ8BU31 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms