Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32,13■■■□□ 2,73
Gpc6Q9R087 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Gpc6Q9R087 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Gpc6Q9R087 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,38
Gpc6Q9R087 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,82■■■□□ 2,36
Gpc6Q9R087 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Gpc6Q9R087 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Gpc6Q9R087 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Gpc6Q9R087 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28,72■■■□□ 2,19
Gpc6Q9R087 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28,71■■■□□ 2,19
Gpc6Q9R087 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Gpc6Q9R087 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28,17■■■□□ 2,1
Gpc6Q9R087 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Gpc6Q9R087 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Gpc6Q9R087 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27,92■■■□□ 2,06
Gpc6Q9R087 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,03
Gpc6Q9R087 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Gpc6Q9R087 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Gpc6Q9R087 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27,55■■■□□ 2
Gpc6Q9R087 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Gpc6Q9R087 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Gpc6Q9R087 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,99
Gpc6Q9R087 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Gpc6Q9R087 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Gpc6Q9R087 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,29■■□□□ 1,96
Gpc6Q9R087 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Gpc6Q9R087 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Gpc6Q9R087 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Gpc6Q9R087 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Gpc6Q9R087 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Gpc6Q9R087 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Gpc6Q9R087 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27,17■■□□□ 1,94
Gpc6Q9R087 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Gpc6Q9R087 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Gpc6Q9R087 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Gpc6Q9R087 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Gpc6Q9R087 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Gpc6Q9R087 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26,95■■□□□ 1,9
Gpc6Q9R087 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26,95■■□□□ 1,9
Gpc6Q9R087 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Gpc6Q9R087 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Gpc6Q9R087 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Gpc6Q9R087 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Gpc6Q9R087 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Gpc6Q9R087 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Gpc6Q9R087 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Gpc6Q9R087 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Gpc6Q9R087 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26,58■■□□□ 1,85
Gpc6Q9R087 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26,5■■□□□ 1,83
Gpc6Q9R087 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26,4■■□□□ 1,82
Gpc6Q9R087 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26,39■■□□□ 1,82
Gpc6Q9R087 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26,35■■□□□ 1,81
Gpc6Q9R087 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26,34■■□□□ 1,81
Gpc6Q9R087 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Gpc6Q9R087 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Gpc6Q9R087 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Gpc6Q9R087 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Gpc6Q9R087 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Gpc6Q9R087 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26,14■■□□□ 1,77
Gpc6Q9R087 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,07■■□□□ 1,76
Gpc6Q9R087 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Gpc6Q9R087 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Gpc6Q9R087 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Gpc6Q9R087 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,87■■□□□ 1,73
Gpc6Q9R087 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,83■■□□□ 1,73
Gpc6Q9R087 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Gpc6Q9R087 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25,7■■□□□ 1,7
Gpc6Q9R087 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Gpc6Q9R087 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Gpc6Q9R087 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Gpc6Q9R087 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Gpc6Q9R087 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Gpc6Q9R087 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Gpc6Q9R087 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Gpc6Q9R087 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Gpc6Q9R087 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Gpc6Q9R087 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,51■■□□□ 1,67
Gpc6Q9R087 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Gpc6Q9R087 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,5■■□□□ 1,67
Gpc6Q9R087 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Gpc6Q9R087 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25,43■■□□□ 1,66
Gpc6Q9R087 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,43■■□□□ 1,66
Gpc6Q9R087 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Gpc6Q9R087 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Gpc6Q9R087 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Gpc6Q9R087 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Gpc6Q9R087 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Gpc6Q9R087 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Gpc6Q9R087 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25,35■■□□□ 1,65
Gpc6Q9R087 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25,34■■□□□ 1,65
Gpc6Q9R087 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Gpc6Q9R087 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Gpc6Q9R087 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25,28■■□□□ 1,64
Gpc6Q9R087 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Gpc6Q9R087 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Gpc6Q9R087 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Gpc6Q9R087 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Gpc6Q9R087 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Gpc6Q9R087 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Gpc6Q9R087 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
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