Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Gpc6Q9R087 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Gpc6Q9R087 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Gpc6Q9R087 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Gpc6Q9R087 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Gpc6Q9R087 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Gpc6Q9R087 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Gpc6Q9R087 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gpc6Q9R087 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Gpc6Q9R087 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Gpc6Q9R087 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gpc6Q9R087 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Gpc6Q9R087 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gpc6Q9R087 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gpc6Q9R087 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Gpc6Q9R087 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Gpc6Q9R087 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gpc6Q9R087 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gpc6Q9R087 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Gpc6Q9R087 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gpc6Q9R087 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gpc6Q9R087 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Gpc6Q9R087 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gpc6Q9R087 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gpc6Q9R087 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gpc6Q9R087 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gpc6Q9R087 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gpc6Q9R087 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gpc6Q9R087 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gpc6Q9R087 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gpc6Q9R087 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gpc6Q9R087 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Gpc6Q9R087 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gpc6Q9R087 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gpc6Q9R087 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gpc6Q9R087 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gpc6Q9R087 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gpc6Q9R087 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Gpc6Q9R087 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gpc6Q9R087 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gpc6Q9R087 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gpc6Q9R087 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gpc6Q9R087 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gpc6Q9R087 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gpc6Q9R087 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gpc6Q9R087 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gpc6Q9R087 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gpc6Q9R087 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Gpc6Q9R087 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gpc6Q9R087 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gpc6Q9R087 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gpc6Q9R087 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Gpc6Q9R087 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Gpc6Q9R087 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gpc6Q9R087 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gpc6Q9R087 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gpc6Q9R087 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gpc6Q9R087 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gpc6Q9R087 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gpc6Q9R087 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gpc6Q9R087 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gpc6Q9R087 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gpc6Q9R087 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gpc6Q9R087 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gpc6Q9R087 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gpc6Q9R087 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gpc6Q9R087 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Gpc6Q9R087 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gpc6Q9R087 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gpc6Q9R087 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gpc6Q9R087 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gpc6Q9R087 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gpc6Q9R087 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gpc6Q9R087 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gpc6Q9R087 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gpc6Q9R087 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gpc6Q9R087 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gpc6Q9R087 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gpc6Q9R087 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gpc6Q9R087 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gpc6Q9R087 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gpc6Q9R087 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gpc6Q9R087 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gpc6Q9R087 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gpc6Q9R087 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gpc6Q9R087 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gpc6Q9R087 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gpc6Q9R087 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gpc6Q9R087 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gpc6Q9R087 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gpc6Q9R087 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gpc6Q9R087 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gpc6Q9R087 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Gpc6Q9R087 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gpc6Q9R087 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gpc6Q9R087 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gpc6Q9R087 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gpc6Q9R087 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gpc6Q9R087 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gpc6Q9R087 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms