Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV76

Ap4b1, AP-4 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4b1Q9WV76 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
Ap4b1Q9WV76 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Ap4b1Q9WV76 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ap4b1Q9WV76 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ap4b1Q9WV76 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Ap4b1Q9WV76 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ap4b1Q9WV76 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Ap4b1Q9WV76 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Ap4b1Q9WV76 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ap4b1Q9WV76 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ap4b1Q9WV76 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
Ap4b1Q9WV76 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ap4b1Q9WV76 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Ap4b1Q9WV76 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ap4b1Q9WV76 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ap4b1Q9WV76 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Ap4b1Q9WV76 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ap4b1Q9WV76 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ap4b1Q9WV76 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ap4b1Q9WV76 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ap4b1Q9WV76 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ap4b1Q9WV76 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ap4b1Q9WV76 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ap4b1Q9WV76 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ap4b1Q9WV76 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ap4b1Q9WV76 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Ap4b1Q9WV76 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ap4b1Q9WV76 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Ap4b1Q9WV76 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ap4b1Q9WV76 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Ap4b1Q9WV76 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ap4b1Q9WV76 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ap4b1Q9WV76 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ap4b1Q9WV76 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ap4b1Q9WV76 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ap4b1Q9WV76 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ap4b1Q9WV76 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ap4b1Q9WV76 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ap4b1Q9WV76 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ap4b1Q9WV76 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ap4b1Q9WV76 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ap4b1Q9WV76 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ap4b1Q9WV76 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ap4b1Q9WV76 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Ap4b1Q9WV76 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Ap4b1Q9WV76 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ap4b1Q9WV76 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ap4b1Q9WV76 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ap4b1Q9WV76 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ap4b1Q9WV76 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ap4b1Q9WV76 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ap4b1Q9WV76 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ap4b1Q9WV76 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ap4b1Q9WV76 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Ap4b1Q9WV76 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ap4b1Q9WV76 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ap4b1Q9WV76 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ap4b1Q9WV76 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ap4b1Q9WV76 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ap4b1Q9WV76 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Ap4b1Q9WV76 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ap4b1Q9WV76 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ap4b1Q9WV76 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ap4b1Q9WV76 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ap4b1Q9WV76 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ap4b1Q9WV76 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ap4b1Q9WV76 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ap4b1Q9WV76 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ap4b1Q9WV76 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ap4b1Q9WV76 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ap4b1Q9WV76 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ap4b1Q9WV76 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ap4b1Q9WV76 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ap4b1Q9WV76 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ap4b1Q9WV76 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ap4b1Q9WV76 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Ap4b1Q9WV76 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ap4b1Q9WV76 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Ap4b1Q9WV76 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ap4b1Q9WV76 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ap4b1Q9WV76 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ap4b1Q9WV76 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ap4b1Q9WV76 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ap4b1Q9WV76 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ap4b1Q9WV76 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ap4b1Q9WV76 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ap4b1Q9WV76 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ap4b1Q9WV76 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ap4b1Q9WV76 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ap4b1Q9WV76 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ap4b1Q9WV76 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ap4b1Q9WV76 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ap4b1Q9WV76 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ap4b1Q9WV76 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ap4b1Q9WV76 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ap4b1Q9WV76 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ap4b1Q9WV76 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ap4b1Q9WV76 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ap4b1Q9WV76 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ap4b1Q9WV76 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms