Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULJ0

Gpd1l, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase 1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpd1lQ3ULJ0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
Gpd1lQ3ULJ0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Gpd1lQ3ULJ0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Gpd1lQ3ULJ0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Gpd1lQ3ULJ0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Gpd1lQ3ULJ0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Gpd1lQ3ULJ0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Gpd1lQ3ULJ0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Gpd1lQ3ULJ0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Gpd1lQ3ULJ0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Gpd1lQ3ULJ0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Gpd1lQ3ULJ0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Gpd1lQ3ULJ0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
Gpd1lQ3ULJ0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Gpd1lQ3ULJ0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Gpd1lQ3ULJ0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Gpd1lQ3ULJ0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Gpd1lQ3ULJ0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Gpd1lQ3ULJ0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Gpd1lQ3ULJ0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Gpd1lQ3ULJ0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Gpd1lQ3ULJ0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Gpd1lQ3ULJ0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Gpd1lQ3ULJ0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Gpd1lQ3ULJ0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Gpd1lQ3ULJ0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Gpd1lQ3ULJ0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Gpd1lQ3ULJ0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Gpd1lQ3ULJ0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Gpd1lQ3ULJ0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Gpd1lQ3ULJ0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Gpd1lQ3ULJ0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Gpd1lQ3ULJ0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Gpd1lQ3ULJ0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Gpd1lQ3ULJ0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Gpd1lQ3ULJ0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Gpd1lQ3ULJ0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Gpd1lQ3ULJ0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Gpd1lQ3ULJ0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Gpd1lQ3ULJ0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Gpd1lQ3ULJ0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Gpd1lQ3ULJ0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Gpd1lQ3ULJ0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Gpd1lQ3ULJ0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Gpd1lQ3ULJ0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Gpd1lQ3ULJ0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Gpd1lQ3ULJ0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Gpd1lQ3ULJ0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Gpd1lQ3ULJ0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Gpd1lQ3ULJ0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gpd1lQ3ULJ0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Gpd1lQ3ULJ0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Gpd1lQ3ULJ0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Gpd1lQ3ULJ0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Gpd1lQ3ULJ0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gpd1lQ3ULJ0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gpd1lQ3ULJ0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Gpd1lQ3ULJ0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Gpd1lQ3ULJ0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Gpd1lQ3ULJ0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gpd1lQ3ULJ0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Gpd1lQ3ULJ0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gpd1lQ3ULJ0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gpd1lQ3ULJ0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gpd1lQ3ULJ0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gpd1lQ3ULJ0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gpd1lQ3ULJ0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gpd1lQ3ULJ0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gpd1lQ3ULJ0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gpd1lQ3ULJ0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gpd1lQ3ULJ0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gpd1lQ3ULJ0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Gpd1lQ3ULJ0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gpd1lQ3ULJ0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gpd1lQ3ULJ0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gpd1lQ3ULJ0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gpd1lQ3ULJ0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Gpd1lQ3ULJ0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gpd1lQ3ULJ0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gpd1lQ3ULJ0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gpd1lQ3ULJ0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gpd1lQ3ULJ0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gpd1lQ3ULJ0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gpd1lQ3ULJ0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gpd1lQ3ULJ0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gpd1lQ3ULJ0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gpd1lQ3ULJ0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gpd1lQ3ULJ0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gpd1lQ3ULJ0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gpd1lQ3ULJ0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gpd1lQ3ULJ0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gpd1lQ3ULJ0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gpd1lQ3ULJ0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gpd1lQ3ULJ0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gpd1lQ3ULJ0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gpd1lQ3ULJ0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Gpd1lQ3ULJ0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gpd1lQ3ULJ0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gpd1lQ3ULJ0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gpd1lQ3ULJ0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms