RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000008088.8

Ttc9b-201, Transcript of Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ttc9b, Length 2,052 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Nup54Q8BTS4 510 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Adnp2Q8CHC8 1165 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Stk33Q924X7 491 aa20.25■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 AadacQ99PG0 398 aa20.25■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Atad1Q9D5T0 361 aa20.25■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pak1ip1Q9DCE5 382 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Adrm1Q9JKV1 407 aa20.25■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Atg2aQ6P4T0 1914 aa20.24■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Dnase1l3O55070 310 aa20.24■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Asgr1P34927 284 aa20.24■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 FpgsP48760 587 aa20.24■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rcn1Q05186 325 aa20.24■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 E330034G19RikQ3UWX6 351 aa20.24■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Abi1Q8CBW3 481 aa20.24■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm13941A2AJ38 245 aa20.23■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm5483B2RV77 97 aa20.23■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Smok3aC0HKC8 504 aa20.23■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Smok3bC0HKC9 504 aa20.23■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Vmn2r72D3Z4N8 856 aa20.23■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm13128L7MU96 475 aa20.23■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pbx3O35317 434 aa20.23■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Hes2O54792 157 aa20.23■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 SykP48025 629 aa20.23■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ccna2P51943 422 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Dpf3P58269 378 aa20.23■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Dact3Q0PHV7 610 aa20.23■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Serac1Q3U213 654 aa20.23■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Znf148Q61624 794 aa20.23■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Crtc1Q68ED7 630 aa20.23■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rtl3Q6P1Y1 553 aa20.23■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 GnasQ6R0H7 1133 aa20.23■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Sytl5Q80T23 753 aa20.23■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tmem202Q80W35 275 aa20.23■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fam155aQ8CCS2 467 aa20.23■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pglyrp2Q8VCS0 530 aa20.23■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Nle1Q8VEJ4 485 aa20.23■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Sike1Q9CPR7 207 aa20.23■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mxra7Q9CZH7 178 aa20.23■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Itga9B8JK39 1036 aa20.23■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kctd18E0CZ26 429 aa20.23■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 BC049352E9Q2Z6 85 aa20.23■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Myl4P09541 193 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 GzmgP13366 248 aa20.23■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Atxn10P28658 475 aa20.23■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rab21P35282 222 aa20.23■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Scg3P47867 471 aa20.23■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 March5Q3KNM2 278 aa20.23■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Lsmem1Q3UQS2 128 aa20.23■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 AcrbpQ3V140 540 aa20.23■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 KrtdapQ3V2T4 102 aa20.23■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rd3Q8BRE0 195 aa20.23■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Klhl38Q8BSF5 581 aa20.23■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pcdhb11Q91UZ8 797 aa20.23■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Oser1Q9D722 291 aa20.23■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Atp11cQ9QZW0 1129 aa20.23■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Syngr1O55100 234 aa20.22■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 P01641 117 aa20.22■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Krt26Q3TRJ4 462 aa20.22■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 B020004J07RikQ3UTC0 476 aa20.22■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Garnl3Q3V0G7 1038 aa20.22■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Spag6Q3V0U9 509 aa20.22■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Afg1lQ3V384 480 aa20.22■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Sh3rf1Q69ZI1 892 aa20.22■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kctd13Q8BGV7 329 aa20.22■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tmtc3Q8BRH0 920 aa20.22■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Sept10Q8C650 452 aa20.22■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rab44Q8CB87 725 aa20.22■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pacs1Q8K212 961 aa20.22■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 D8Ertd738eQ8R1F0 94 aa20.22■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Eml3Q8VC03 897 aa20.22■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Vangl2Q91ZD4 521 aa20.22■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 GhdcQ99J23 532 aa20.22■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rpl34Q9D1R9 117 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Q9D979 236 aa20.22■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Krt7Q9DCV7 457 aa20.22■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 GghQ9Z0L8 317 aa20.22■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mtm1Q9Z2C5 603 aa20.22■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Akap17bA2A3V1 959 aa20.22■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tmem265E9Q8G3 109 aa20.22■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Chrna4O70174 629 aa20.22■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Snx3O70492 162 aa20.22■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Hcn2O88703 863 aa20.22■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Bpifa6Q0VGU8 367 aa20.22■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Otol1Q4ZJM7 482 aa20.22■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Foxd4Q60688 444 aa20.22■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ksr1Q61097 873 aa20.22■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Six4Q61321 775 aa20.22■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 RadilQ69Z89 1099 aa20.22■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tas2r129Q7M709 320 aa20.22■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ccnt2Q7TQK0 723 aa20.22■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr1128Q7TR47 311 aa20.22■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Znf879Q8BI99 563 aa20.22■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Sik2Q8CFH6 931 aa20.22■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Syn3Q8JZP2 579 aa20.22■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mrps18aQ99N85 196 aa20.22■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fam227bQ9D518 532 aa20.22■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Eef1akmt2Q9D853 244 aa20.22■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 MrgbpQ9DAT2 204 aa20.22■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kdelc1Q9JHP7 502 aa20.22■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Nfs1Q9Z1J3 459 aa20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.9 ms