Protein–RNA interactions for Protein: P47867

Scg3, Secretogranin-3, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg3P47867 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
Scg3P47867 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Scg3P47867 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Scg3P47867 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Scg3P47867 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Scg3P47867 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Scg3P47867 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Scg3P47867 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Scg3P47867 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
Scg3P47867 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Scg3P47867 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Scg3P47867 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Scg3P47867 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
Scg3P47867 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
Scg3P47867 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Scg3P47867 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Scg3P47867 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Scg3P47867 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Scg3P47867 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Scg3P47867 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Scg3P47867 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Scg3P47867 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Scg3P47867 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Scg3P47867 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Scg3P47867 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Scg3P47867 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Scg3P47867 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Scg3P47867 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Scg3P47867 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Scg3P47867 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Scg3P47867 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Scg3P47867 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Scg3P47867 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Scg3P47867 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Scg3P47867 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Scg3P47867 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Scg3P47867 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Scg3P47867 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Scg3P47867 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Scg3P47867 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Scg3P47867 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Scg3P47867 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Scg3P47867 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Scg3P47867 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Scg3P47867 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Scg3P47867 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Scg3P47867 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Scg3P47867 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Scg3P47867 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Scg3P47867 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Scg3P47867 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Scg3P47867 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Scg3P47867 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Scg3P47867 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Scg3P47867 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Scg3P47867 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Scg3P47867 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Scg3P47867 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Scg3P47867 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Scg3P47867 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Scg3P47867 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Scg3P47867 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Scg3P47867 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Scg3P47867 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Scg3P47867 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Scg3P47867 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Scg3P47867 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Scg3P47867 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Scg3P47867 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Scg3P47867 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Scg3P47867 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Scg3P47867 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Scg3P47867 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Scg3P47867 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Scg3P47867 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Scg3P47867 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Scg3P47867 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Scg3P47867 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Scg3P47867 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Scg3P47867 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Scg3P47867 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Scg3P47867 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Scg3P47867 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Scg3P47867 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Scg3P47867 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Scg3P47867 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Scg3P47867 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Scg3P47867 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Scg3P47867 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Scg3P47867 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Scg3P47867 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Scg3P47867 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Scg3P47867 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Scg3P47867 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Scg3P47867 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Scg3P47867 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Scg3P47867 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Scg3P47867 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Scg3P47867 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Scg3P47867 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms