Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH7

Mxra7, Matrix-remodeling-associated protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mxra7Q9CZH7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35,76■■■■□ 3,32
Mxra7Q9CZH7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,63■■■■□ 3,14
Mxra7Q9CZH7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,38■■■□□ 2,93
Mxra7Q9CZH7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,37■■■□□ 2,93
Mxra7Q9CZH7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32,82■■■□□ 2,84
Mxra7Q9CZH7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32,44■■■□□ 2,78
Mxra7Q9CZH7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,43■■■□□ 2,78
Mxra7Q9CZH7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,12■■■□□ 2,73
Mxra7Q9CZH7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,75■■■□□ 2,67
Mxra7Q9CZH7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31,73■■■□□ 2,67
Mxra7Q9CZH7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,65■■■□□ 2,66
Mxra7Q9CZH7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,46■■■□□ 2,63
Mxra7Q9CZH7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31,15■■■□□ 2,58
Mxra7Q9CZH7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Mxra7Q9CZH7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Mxra7Q9CZH7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Mxra7Q9CZH7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Mxra7Q9CZH7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30,82■■■□□ 2,52
Mxra7Q9CZH7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30,67■■■□□ 2,5
Mxra7Q9CZH7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Mxra7Q9CZH7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,48■■■□□ 2,47
Mxra7Q9CZH7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Mxra7Q9CZH7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,34■■■□□ 2,45
Mxra7Q9CZH7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Mxra7Q9CZH7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Mxra7Q9CZH7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Mxra7Q9CZH7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30,04■■■□□ 2,4
Mxra7Q9CZH7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Mxra7Q9CZH7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29,94■■■□□ 2,38
Mxra7Q9CZH7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Mxra7Q9CZH7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Mxra7Q9CZH7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Mxra7Q9CZH7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Mxra7Q9CZH7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Mxra7Q9CZH7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Mxra7Q9CZH7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Mxra7Q9CZH7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29,7■■■□□ 2,35
Mxra7Q9CZH7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Mxra7Q9CZH7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29,59■■■□□ 2,33
Mxra7Q9CZH7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29,58■■■□□ 2,33
Mxra7Q9CZH7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Mxra7Q9CZH7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Mxra7Q9CZH7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Mxra7Q9CZH7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Mxra7Q9CZH7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29,33■■■□□ 2,29
Mxra7Q9CZH7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Mxra7Q9CZH7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29,24■■■□□ 2,27
Mxra7Q9CZH7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29,21■■■□□ 2,27
Mxra7Q9CZH7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
Mxra7Q9CZH7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Mxra7Q9CZH7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29,08■■■□□ 2,25
Mxra7Q9CZH7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29,07■■■□□ 2,24
Mxra7Q9CZH7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28,99■■■□□ 2,23
Mxra7Q9CZH7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Mxra7Q9CZH7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Mxra7Q9CZH7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Mxra7Q9CZH7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Mxra7Q9CZH7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Mxra7Q9CZH7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Mxra7Q9CZH7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,72■■■□□ 2,19
Mxra7Q9CZH7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,19
Mxra7Q9CZH7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Mxra7Q9CZH7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Mxra7Q9CZH7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Mxra7Q9CZH7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,55■■■□□ 2,16
Mxra7Q9CZH7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Mxra7Q9CZH7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Mxra7Q9CZH7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Mxra7Q9CZH7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28,44■■■□□ 2,14
Mxra7Q9CZH7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28,41■■■□□ 2,14
Mxra7Q9CZH7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,4■■■□□ 2,14
Mxra7Q9CZH7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Mxra7Q9CZH7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Mxra7Q9CZH7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Mxra7Q9CZH7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Mxra7Q9CZH7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Mxra7Q9CZH7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Mxra7Q9CZH7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Mxra7Q9CZH7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Mxra7Q9CZH7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Mxra7Q9CZH7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Mxra7Q9CZH7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,08■■■□□ 2,09
Mxra7Q9CZH7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28,08■■■□□ 2,09
Mxra7Q9CZH7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Mxra7Q9CZH7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Mxra7Q9CZH7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2,07
Mxra7Q9CZH7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Mxra7Q9CZH7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,94■■■□□ 2,06
Mxra7Q9CZH7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,93■■■□□ 2,06
Mxra7Q9CZH7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27,93■■■□□ 2,06
Mxra7Q9CZH7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Mxra7Q9CZH7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Mxra7Q9CZH7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Mxra7Q9CZH7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,9■■■□□ 2,06
Mxra7Q9CZH7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Mxra7Q9CZH7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27,81■■■□□ 2,04
Mxra7Q9CZH7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Mxra7Q9CZH7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27,74■■■□□ 2,03
Mxra7Q9CZH7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Mxra7Q9CZH7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27,65■■■□□ 2,02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,3 ms