RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597234.5

LINC01435-208, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1435, humanhuman

TSL 5

Gene LINC01435, Length 487 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01435-208ENST00000597234 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
LINC01435-208ENST00000597234 AP1G2O75843 785 aa9.56□□□□□ -0.88
LINC01435-208ENST00000597234 CTDSPL2Q05D32 466 aa9.56□□□□□ -0.88
LINC01435-208ENST00000597234 KCNH2Q12809 1159 aa9.56□□□□□ -0.88
LINC01435-208ENST00000597234 F12P00748 615 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
LINC01435-208ENST00000597234 SPRYD7Q5W111 196 aa9.55□□□□□ -0.88
LINC01435-208ENST00000597234 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
LINC01435-208ENST00000597234 BANK1Q8NDB2 785 aa9.54□□□□□ -0.88
LINC01435-208ENST00000597234 USP17L8P0C7I0 530 aa9.53□□□□□ -0.88
LINC01435-208ENST00000597234 CTHP32929 405 aa9.53□□□□□ -0.88
LINC01435-208ENST00000597234 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
LINC01435-208ENST00000597234 CFTRP13569 1480 aa9.53□□□□□ -0.88
LINC01435-208ENST00000597234 TRIM32Q13049 653 aa9.52□□□□□ -0.89
LINC01435-208ENST00000597234 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
LINC01435-208ENST00000597234 UNC93B1Q9H1C4 597 aa9.52□□□□□ -0.89
LINC01435-208ENST00000597234 CADPSQ9ULU8 1353 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC01435-208ENST00000597234 MAP10Q9P2G4 905 aa9.51□□□□□ -0.89
LINC01435-208ENST00000597234 ZNF697Q5TEC3 545 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC01435-208ENST00000597234 LRRN4Q8WUT4 740 aa9.5□□□□□ -0.89
LINC01435-208ENST00000597234 SOCS7O14512 581 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC01435-208ENST00000597234 WNT7BP56706 349 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC01435-208ENST00000597234 ARMC2Q8NEN0 867 aa9.49□□□□□ -0.89
LINC01435-208ENST00000597234 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP9.48□□□□□ -0.89
LINC01435-208ENST00000597234 APBB1O00213 710 aa9.45□□□□□ -0.9
LINC01435-208ENST00000597234 NR6A1Q15406 480 aa9.45□□□□□ -0.9
LINC01435-208ENST00000597234 NBPF14Q5TI25 921 aa9.45□□□□□ -0.9
LINC01435-208ENST00000597234 PNMA1Q8ND90 353 aa9.45□□□□□ -0.9
LINC01435-208ENST00000597234 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP9.45□□□□□ -0.9
LINC01435-208ENST00000597234 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
LINC01435-208ENST00000597234 SKOR1P84550 965 aa9.44□□□□□ -0.9
LINC01435-208ENST00000597234 PRR20EP86478 221 aa9.44□□□□□ -0.9
LINC01435-208ENST00000597234 PRR20CP86479 221 aa9.44□□□□□ -0.9
LINC01435-208ENST00000597234 PRR20DP86480 221 aa9.44□□□□□ -0.9
LINC01435-208ENST00000597234 PRR20BP86481 221 aa9.44□□□□□ -0.9
LINC01435-208ENST00000597234 PRR20AP86496 221 aa9.44□□□□□ -0.9
LINC01435-208ENST00000597234 ZNF511Q8NB15 262 aa9.44□□□□□ -0.9
LINC01435-208ENST00000597234 BAP1Q92560 729 aa9.44□□□□□ -0.9
LINC01435-208ENST00000597234 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
LINC01435-208ENST00000597234 PRDM2Q13029 1718 aa9.44□□□□□ -0.9
LINC01435-208ENST00000597234 EEA1Q15075 1411 aa9.43□□□□□ -0.9
LINC01435-208ENST00000597234 WNT7AO00755 349 aa9.43□□□□□ -0.9
LINC01435-208ENST00000597234 GDF9O60383 454 aa9.43□□□□□ -0.9
LINC01435-208ENST00000597234 SH3BP2P78314 561 aa9.43□□□□□ -0.9
LINC01435-208ENST00000597234 FKBPLQ9UIM3 349 aa9.43□□□□□ -0.9
LINC01435-208ENST00000597234 ABCC8Q09428 1581 aa9.42□□□□□ -0.9
LINC01435-208ENST00000597234 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa9.42□□□□□ -0.9
LINC01435-208ENST00000597234 LINC01559Q495D7 138 aa9.42□□□□□ -0.9
LINC01435-208ENST00000597234 TRIM34Q9BYJ4 488 aa9.42□□□□□ -0.9
LINC01435-208ENST00000597234 PKD2L1Q9P0L9 805 aa9.42□□□□□ -0.9
LINC01435-208ENST00000597234 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
LINC01435-208ENST00000597234 TRIM67Q6ZTA4 783 aa9.41□□□□□ -0.9
LINC01435-208ENST00000597234 MTMR14Q8NCE2 650 aa9.41□□□□□ -0.9
LINC01435-208ENST00000597234 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
LINC01435-208ENST00000597234 SNRKQ9NRH2 765 aa9.41□□□□□ -0.9
LINC01435-208ENST00000597234 FOXC1Q12948 553 aa9.4□□□□□ -0.9
LINC01435-208ENST00000597234 EPS8L1Q8TE68 723 aa9.4□□□□□ -0.9
LINC01435-208ENST00000597234 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa9.4□□□□□ -0.9
LINC01435-208ENST00000597234 LAPTM4AQ15012 233 aa9.39□□□□□ -0.91
LINC01435-208ENST00000597234 PDXDC2PQ6P474 469 aa9.39□□□□□ -0.91
LINC01435-208ENST00000597234 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
LINC01435-208ENST00000597234 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
LINC01435-208ENST00000597234 PDS5BQ9NTI5 1447 aa9.39□□□□□ -0.91
LINC01435-208ENST00000597234 VARSP26640 1264 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
LINC01435-208ENST00000597234 MCM6Q14566 821 aa9.38□□□□□ -0.91
LINC01435-208ENST00000597234 EHBP1Q8NDI1 1231 aa9.38□□□□□ -0.91
LINC01435-208ENST00000597234 MRGPRX2Q96LB1 330 aa9.38□□□□□ -0.91
LINC01435-208ENST00000597234 TOP2BQ02880 1626 aa9.38□□□□□ -0.91
LINC01435-208ENST00000597234 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
LINC01435-208ENST00000597234 FLIIQ13045 1269 aa9.37□□□□□ -0.91
LINC01435-208ENST00000597234 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa9.37□□□□□ -0.91
LINC01435-208ENST00000597234 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa9.37□□□□□ -0.91
LINC01435-208ENST00000597234 FOXJ1Q92949 421 aa9.37□□□□□ -0.91
LINC01435-208ENST00000597234 PRM3Q9NNZ6 103 aa9.37□□□□□ -0.91
LINC01435-208ENST00000597234 GPSM3Q9Y4H4 160 aa9.37□□□□□ -0.91
LINC01435-208ENST00000597234 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa9.37□□□□□ -0.91
LINC01435-208ENST00000597234 FANCD2Q9BXW9 1451 aa9.36□□□□□ -0.91
LINC01435-208ENST00000597234 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa9.36□□□□□ -0.91
LINC01435-208ENST00000597234 TNFRSF10AO00220 468 aa9.36□□□□□ -0.91
LINC01435-208ENST00000597234 GFRA3O60609 400 aa9.36□□□□□ -0.91
LINC01435-208ENST00000597234 AGERQ15109 404 aa9.36□□□□□ -0.91
LINC01435-208ENST00000597234 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
LINC01435-208ENST00000597234 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa9.35□□□□□ -0.91
LINC01435-208ENST00000597234 CYP4X1Q8N118 509 aa9.35□□□□□ -0.91
LINC01435-208ENST00000597234 TOR4AQ9NXH8 423 aa9.35□□□□□ -0.91
LINC01435-208ENST00000597234 SYNJ1O43426 1573 aa9.34□□□□□ -0.91
LINC01435-208ENST00000597234 SIAH2O43255 324 aa9.34□□□□□ -0.91
LINC01435-208ENST00000597234 PTK2Q05397 1052 aa9.34□□□□□ -0.91
LINC01435-208ENST00000597234 MPNDQ8N594 471 aa9.34□□□□□ -0.91
LINC01435-208ENST00000597234 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
LINC01435-208ENST00000597234 FAM174AQ8TBP5 190 aa9.34□□□□□ -0.91
LINC01435-208ENST00000597234 C4orf48Q5BLP8 95 aa9.33□□□□□ -0.92
LINC01435-208ENST00000597234 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa9.33□□□□□ -0.92
LINC01435-208ENST00000597234 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa9.33□□□□□ -0.92
LINC01435-208ENST00000597234 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
LINC01435-208ENST00000597234 CUX1P39880 1505 aa9.31□□□□□ -0.92
LINC01435-208ENST00000597234 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa9.31□□□□□ -0.92
LINC01435-208ENST00000597234 ZBTB33Q86T24 672 aa9.31□□□□□ -0.92
LINC01435-208ENST00000597234 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
LINC01435-208ENST00000597234 CEP164Q9UPV0 1460 aa9.31□□□□□ -0.92
LINC01435-208ENST00000597234 NESP48681 1621 aa9.31□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.7 ms