RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559787.1

MESTP2-201, Transcript of mesoderm specific transcript pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene MESTP2, Length 889 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESTP2-201ENST00000559787 RGL3Q3MIN7 710 aa16.18■□□□□ 0.18
MESTP2-201ENST00000559787 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
MESTP2-201ENST00000559787 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa16.18■□□□□ 0.18
MESTP2-201ENST00000559787 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
MESTP2-201ENST00000559787 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa16.17■□□□□ 0.18
MESTP2-201ENST00000559787 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa16.16■□□□□ 0.18
MESTP2-201ENST00000559787 TRIM37O94972 964 aa16.16■□□□□ 0.18
MESTP2-201ENST00000559787 FAM196AQ6ZSG2 479 aa16.15■□□□□ 0.18
MESTP2-201ENST00000559787 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
MESTP2-201ENST00000559787 PRAM1Q96QH2 718 aa16.15■□□□□ 0.18
MESTP2-201ENST00000559787 PRR36Q9H6K5 1346 aa16.15■□□□□ 0.18
MESTP2-201ENST00000559787 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
MESTP2-201ENST00000559787 TULP4Q9NRJ4 1543 aa16.14■□□□□ 0.18
MESTP2-201ENST00000559787 ADGRB1O14514 1584 aa16.14■□□□□ 0.17
MESTP2-201ENST00000559787 NINLQ9Y2I6 1382 aa16.13■□□□□ 0.17
MESTP2-201ENST00000559787 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
MESTP2-201ENST00000559787 APBA3O96018 575 aa16.12■□□□□ 0.17
MESTP2-201ENST00000559787 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP16.12■□□□□ 0.17
MESTP2-201ENST00000559787 CFAP70Q5T0N1 1121 aa16.12■□□□□ 0.17
MESTP2-201ENST00000559787 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
MESTP2-201ENST00000559787 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa16.12■□□□□ 0.17
MESTP2-201ENST00000559787 CASZ1Q86V15 1759 aa16.12■□□□□ 0.17
MESTP2-201ENST00000559787 PRDM11Q9NQV5 511 aa16.11■□□□□ 0.17
MESTP2-201ENST00000559787 GPRASP1Q5JY77 1395 aa16.11■□□□□ 0.17
MESTP2-201ENST00000559787 KIAA0232Q92628 1395 aa16.11■□□□□ 0.17
MESTP2-201ENST00000559787 LMO7Q8WWI1 1683 aa16.1■□□□□ 0.17
MESTP2-201ENST00000559787 PEAK1Q9H792 1746 aa16.09■□□□□ 0.17
MESTP2-201ENST00000559787 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
MESTP2-201ENST00000559787 BARGINQ6ZT62 677 aa16.08■□□□□ 0.16
MESTP2-201ENST00000559787 SSH2Q76I76 1423 aa16.08■□□□□ 0.16
MESTP2-201ENST00000559787 NRKQ7Z2Y5 1582 aa16.08■□□□□ 0.16
MESTP2-201ENST00000559787 ITSN1Q15811 1721 aa16.08■□□□□ 0.16
MESTP2-201ENST00000559787 KCNQ2O43526 872 aa16.07■□□□□ 0.16
MESTP2-201ENST00000559787 SPON1Q9HCB6 807 aa16.07■□□□□ 0.16
MESTP2-201ENST00000559787 SBF2Q86WG5 1849 aa16.07■□□□□ 0.16
MESTP2-201ENST00000559787 CEP350Q5VT06 3117 aa16.06■□□□□ 0.16
MESTP2-201ENST00000559787 ATP7BP35670 1465 aa16.06■□□□□ 0.16
MESTP2-201ENST00000559787 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
MESTP2-201ENST00000559787 CHRNA2Q15822 529 aa16.06■□□□□ 0.16
MESTP2-201ENST00000559787 NBPF8Q3BBV2 869 aa16.05■□□□□ 0.16
MESTP2-201ENST00000559787 NBPF14Q5TI25 921 aa16.05■□□□□ 0.16
MESTP2-201ENST00000559787 MPHOSPH9Q99550 1183 aa16.05■□□□□ 0.16
MESTP2-201ENST00000559787 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
MESTP2-201ENST00000559787 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
MESTP2-201ENST00000559787 STRN4Q9NRL3 753 aa16.04■□□□□ 0.16
MESTP2-201ENST00000559787 POGKQ9P215 609 aa16.04■□□□□ 0.16
MESTP2-201ENST00000559787 MYOM1P52179 1685 aa16.04■□□□□ 0.16
MESTP2-201ENST00000559787 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa16.04■□□□□ 0.16
MESTP2-201ENST00000559787 WASLO00401 505 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
MESTP2-201ENST00000559787 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
MESTP2-201ENST00000559787 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
MESTP2-201ENST00000559787 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
MESTP2-201ENST00000559787 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
MESTP2-201ENST00000559787 PDE3BQ13370 1112 aa16.01■□□□□ 0.15
MESTP2-201ENST00000559787 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
MESTP2-201ENST00000559787 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
MESTP2-201ENST00000559787 USP35Q9P2H5 1018 aa16.01■□□□□ 0.15
MESTP2-201ENST00000559787 LRRC37A3O60309 1634 aa16.01■□□□□ 0.15
MESTP2-201ENST00000559787 CPDO75976 1380 aa16■□□□□ 0.15
MESTP2-201ENST00000559787 CHD4Q14839 1912 aa16■□□□□ 0.15
MESTP2-201ENST00000559787 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
MESTP2-201ENST00000559787 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
MESTP2-201ENST00000559787 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
MESTP2-201ENST00000559787 TCP11L2Q8N4U5 519 aa15.99■□□□□ 0.15
MESTP2-201ENST00000559787 TRAK1Q9UPV9 953 aa15.99■□□□□ 0.15
MESTP2-201ENST00000559787 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
MESTP2-201ENST00000559787 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
MESTP2-201ENST00000559787 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
MESTP2-201ENST00000559787 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa15.97■□□□□ 0.15
MESTP2-201ENST00000559787 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa15.97■□□□□ 0.15
MESTP2-201ENST00000559787 OVOS2Q6IE36 1432 aa15.97■□□□□ 0.15
MESTP2-201ENST00000559787 WNK3Q9BYP7 1800 aa15.97■□□□□ 0.15
MESTP2-201ENST00000559787 PTGER2P43116 358 aa15.97■□□□□ 0.15
MESTP2-201ENST00000559787 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
MESTP2-201ENST00000559787 USP19O94966 1318 aa15.96■□□□□ 0.15
MESTP2-201ENST00000559787 DCAF8L1A6NGE4 600 aa15.96■□□□□ 0.15
MESTP2-201ENST00000559787 PLSCR1O15162 318 aa15.96■□□□□ 0.15
MESTP2-201ENST00000559787 NUTM2GQ5VZR2 741 aa15.95■□□□□ 0.14
MESTP2-201ENST00000559787 PTF1AQ7RTS3 328 aa15.94■□□□□ 0.14
MESTP2-201ENST00000559787 PROM2Q8N271 834 aa15.94■□□□□ 0.14
MESTP2-201ENST00000559787 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
MESTP2-201ENST00000559787 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
MESTP2-201ENST00000559787 EVA1CP58658 441 aa15.93■□□□□ 0.14
MESTP2-201ENST00000559787 BCL9O00512 1426 aa15.93■□□□□ 0.14
MESTP2-201ENST00000559787 CRB1P82279 1406 aa15.93■□□□□ 0.14
MESTP2-201ENST00000559787 COL18A1P39060 1754 aa15.91■□□□□ 0.14
MESTP2-201ENST00000559787 AKAP12Q02952 1782 aa15.91■□□□□ 0.14
MESTP2-201ENST00000559787 ACEP12821 1306 aa15.91■□□□□ 0.14
MESTP2-201ENST00000559787 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa15.9■□□□□ 0.14
MESTP2-201ENST00000559787 ZBTB7AO95365 584 aa15.9■□□□□ 0.14
MESTP2-201ENST00000559787 C1QTNF8P60827 252 aa15.9■□□□□ 0.14
MESTP2-201ENST00000559787 SGIP1Q9BQI5 828 aa15.9■□□□□ 0.14
MESTP2-201ENST00000559787 IFFO2Q5TF58 517 aa15.89■□□□□ 0.13
MESTP2-201ENST00000559787 SYT17Q9BSW7 474 aa15.89■□□□□ 0.13
MESTP2-201ENST00000559787 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
MESTP2-201ENST00000559787 PLEKHG3A1L390 1219 aa15.88■□□□□ 0.13
MESTP2-201ENST00000559787 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
MESTP2-201ENST00000559787 SLIT3O75094 1523 aa15.88■□□□□ 0.13
MESTP2-201ENST00000559787 AATKQ6ZMQ8 1374 aa15.87■□□□□ 0.13
MESTP2-201ENST00000559787 PAPPAQ13219 1627 aa15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms