RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433137.1

MED28P4-201, Transcript of mediator complex subunit 28 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene MED28P4, Length 572 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28P4-201ENST00000433137 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
MED28P4-201ENST00000433137 STAC3Q96MF2 364 aa10.47□□□□□ -0.73
MED28P4-201ENST00000433137 HPS5Q9UPZ3 1129 aa10.47□□□□□ -0.73
MED28P4-201ENST00000433137 C6orf229H3BNL8 230 aa10.46□□□□□ -0.73
MED28P4-201ENST00000433137 APLP1P51693 650 aa10.46□□□□□ -0.73
MED28P4-201ENST00000433137 WNT2BQ93097 391 aa10.46□□□□□ -0.73
MED28P4-201ENST00000433137 RAD21O60216 631 aa10.45□□□□□ -0.74
MED28P4-201ENST00000433137 CTDSPL2Q05D32 466 aa10.45□□□□□ -0.74
MED28P4-201ENST00000433137 NECTIN2Q92692 538 aa10.45□□□□□ -0.74
MED28P4-201ENST00000433137 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa10.45□□□□□ -0.74
MED28P4-201ENST00000433137 IQGAP2Q13576 1575 aa10.44□□□□□ -0.74
MED28P4-201ENST00000433137 UGGT2Q9NYU1 1516 aa10.44□□□□□ -0.74
MED28P4-201ENST00000433137 APBB1O00213 710 aa10.44□□□□□ -0.74
MED28P4-201ENST00000433137 SOCS7O14512 581 aa10.44□□□□□ -0.74
MED28P4-201ENST00000433137 PPP4CP60510 307 aa10.44□□□□□ -0.74
MED28P4-201ENST00000433137 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
MED28P4-201ENST00000433137 SHROOM2Q13796 1616 aa10.44□□□□□ -0.74
MED28P4-201ENST00000433137 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
MED28P4-201ENST00000433137 GDPD2Q9HCC8 539 aa10.43□□□□□ -0.74
MED28P4-201ENST00000433137 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
MED28P4-201ENST00000433137 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa10.43□□□□□ -0.74
MED28P4-201ENST00000433137 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
MED28P4-201ENST00000433137 TSC1Q92574 1164 aa10.42□□□□□ -0.74
MED28P4-201ENST00000433137 ARXQ96QS3 562 aa10.42□□□□□ -0.74
MED28P4-201ENST00000433137 DISP1Q96F81 1524 aa10.42□□□□□ -0.74
MED28P4-201ENST00000433137 PRR7Q8TB68 274 aa10.41□□□□□ -0.74
MED28P4-201ENST00000433137 LRRN4Q8WUT4 740 aa10.41□□□□□ -0.74
MED28P4-201ENST00000433137 PRR14Q9BWN1 585 aa10.41□□□□□ -0.74
MED28P4-201ENST00000433137 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa10.41□□□□□ -0.74
MED28P4-201ENST00000433137 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
MED28P4-201ENST00000433137 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa10.4□□□□□ -0.74
MED28P4-201ENST00000433137 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa10.4□□□□□ -0.74
MED28P4-201ENST00000433137 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
MED28P4-201ENST00000433137 WBP1LQ9NX94 342 aa10.4□□□□□ -0.74
MED28P4-201ENST00000433137 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
MED28P4-201ENST00000433137 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa10.39□□□□□ -0.75
MED28P4-201ENST00000433137 RETREG3Q86VR2 466 aa10.39□□□□□ -0.75
MED28P4-201ENST00000433137 TRIM34Q9BYJ4 488 aa10.39□□□□□ -0.75
MED28P4-201ENST00000433137 Q3C1V9 767 aa10.38□□□□□ -0.75
MED28P4-201ENST00000433137 ARID3AQ99856 593 aa10.38□□□□□ -0.75
MED28P4-201ENST00000433137 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa10.38□□□□□ -0.75
MED28P4-201ENST00000433137 ERCC6L2Q5T890 1561 aa10.38□□□□□ -0.75
MED28P4-201ENST00000433137 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
MED28P4-201ENST00000433137 GPR37L1O60883 481 aa10.37□□□□□ -0.75
MED28P4-201ENST00000433137 CLIP1P30622 1438 aa10.37□□□□□ -0.75
MED28P4-201ENST00000433137 ABL2P42684 1182 aa10.37□□□□□ -0.75
MED28P4-201ENST00000433137 CEP162Q5TB80 1403 aa10.37□□□□□ -0.75
MED28P4-201ENST00000433137 THSD4Q6ZMP0 1018 aa10.37□□□□□ -0.75
MED28P4-201ENST00000433137 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa10.37□□□□□ -0.75
MED28P4-201ENST00000433137 SAMD9Q5K651 1589 aa10.36□□□□□ -0.75
MED28P4-201ENST00000433137 BRICD5Q6PL45 260 aa10.36□□□□□ -0.75
MED28P4-201ENST00000433137 SCUBE3Q8IX30 993 aa10.36□□□□□ -0.75
MED28P4-201ENST00000433137 THAP11Q96EK4 314 aa10.36□□□□□ -0.75
MED28P4-201ENST00000433137 ARHGEF11O15085 1522 aa10.35□□□□□ -0.75
MED28P4-201ENST00000433137 EPS8L1Q8TE68 723 aa10.35□□□□□ -0.75
MED28P4-201ENST00000433137 PTPRGP23470 1445 aa10.34□□□□□ -0.75
MED28P4-201ENST00000433137 CCDC82Q8N4S0 544 aa10.34□□□□□ -0.75
MED28P4-201ENST00000433137 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
MED28P4-201ENST00000433137 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
MED28P4-201ENST00000433137 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
MED28P4-201ENST00000433137 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa10.34□□□□□ -0.75
MED28P4-201ENST00000433137 EFCAB5A4FU69 1503 aa10.33□□□□□ -0.76
MED28P4-201ENST00000433137 KIAA0556O60303 1618 aa10.33□□□□□ -0.76
MED28P4-201ENST00000433137 POTEMA6NI47 508 aa10.33□□□□□ -0.76
MED28P4-201ENST00000433137 IRF5Q13568 498 aa10.33□□□□□ -0.76
MED28P4-201ENST00000433137 DESI1Q6ICB0 168 aa10.33□□□□□ -0.76
MED28P4-201ENST00000433137 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
MED28P4-201ENST00000433137 PRM3Q9NNZ6 103 aa10.33□□□□□ -0.76
MED28P4-201ENST00000433137 ARAP1Q96P48 1450 aa10.33□□□□□ -0.76
MED28P4-201ENST00000433137 NR1I2O75469 434 aa10.32□□□□□ -0.76
MED28P4-201ENST00000433137 CYB5RLQ6IPT4 315 aa10.32□□□□□ -0.76
MED28P4-201ENST00000433137 POTEGQ6S5H5 508 aa10.32□□□□□ -0.76
MED28P4-201ENST00000433137 CDAN1Q8IWY9 1227 aa10.32□□□□□ -0.76
MED28P4-201ENST00000433137 HOMEZQ8IX15 550 aa10.32□□□□□ -0.76
MED28P4-201ENST00000433137 FHOD3Q2V2M9 1422 aa10.32□□□□□ -0.76
MED28P4-201ENST00000433137 POM121CA8CG34 1229 aa10.31□□□□□ -0.76
MED28P4-201ENST00000433137 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
MED28P4-201ENST00000433137 NR6A1Q15406 480 aa10.31□□□□□ -0.76
MED28P4-201ENST00000433137 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa10.3□□□□□ -0.76
MED28P4-201ENST00000433137 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa10.3□□□□□ -0.76
MED28P4-201ENST00000433137 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa10.3□□□□□ -0.76
MED28P4-201ENST00000433137 COPS2P61201 443 aa10.3□□□□□ -0.76
MED28P4-201ENST00000433137 LYPD8Q6UX82 237 aa10.3□□□□□ -0.76
MED28P4-201ENST00000433137 PLSCR2Q9NRY7 297 aa10.3□□□□□ -0.76
MED28P4-201ENST00000433137 FMN1Q68DA7 1419 aa10.29□□□□□ -0.76
MED28P4-201ENST00000433137 UACAQ9BZF9 1416 aa10.27□□□□□ -0.77
MED28P4-201ENST00000433137 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
MED28P4-201ENST00000433137 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
MED28P4-201ENST00000433137 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa10.26□□□□□ -0.77
MED28P4-201ENST00000433137 PLB1Q6P1J6 1458 aa10.26□□□□□ -0.77
MED28P4-201ENST00000433137 JUNDP17535 347 aa10.26□□□□□ -0.77
MED28P4-201ENST00000433137 WWC1Q8IX03 1113 aa10.26□□□□□ -0.77
MED28P4-201ENST00000433137 PTPN5P54829 565 aa10.25□□□□□ -0.77
MED28P4-201ENST00000433137 SPSB2Q99619 263 aa10.25□□□□□ -0.77
MED28P4-201ENST00000433137 PRDM9Q9NQV7 894 aa10.25□□□□□ -0.77
MED28P4-201ENST00000433137 ABCA8O94911 1581 aa10.25□□□□□ -0.77
MED28P4-201ENST00000433137 VPS8Q8N3P4 1428 aa10.24□□□□□ -0.77
MED28P4-201ENST00000433137 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa10.24□□□□□ -0.77
MED28P4-201ENST00000433137 TLL1O43897 1013 aa10.24□□□□□ -0.77
MED28P4-201ENST00000433137 F12P00748 615 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms