RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418601.1

GTPBP1-202, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 810 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-202ENST00000418601 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa29.04■■■□□ 2.24
GTPBP1-202ENST00000418601 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa29.04■■■□□ 2.24
GTPBP1-202ENST00000418601 SPON1Q9HCB6 807 aa29.03■■■□□ 2.24
GTPBP1-202ENST00000418601 ANKARQ7Z5J8 1434 aa29.03■■■□□ 2.24
GTPBP1-202ENST00000418601 NBPF8Q3BBV2 869 aa29.02■■■□□ 2.24
GTPBP1-202ENST00000418601 NBPF14Q5TI25 921 aa29.02■■■□□ 2.24
GTPBP1-202ENST00000418601 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
GTPBP1-202ENST00000418601 RGL3Q3MIN7 710 aa29■■■□□ 2.23
GTPBP1-202ENST00000418601 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29■■■□□ 2.23
GTPBP1-202ENST00000418601 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa28.99■■■□□ 2.23
GTPBP1-202ENST00000418601 PRDM11Q9NQV5 511 aa28.98■■■□□ 2.23
GTPBP1-202ENST00000418601 KCNQ2O43526 872 aa28.97■■■□□ 2.23
GTPBP1-202ENST00000418601 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP28.97■■■□□ 2.23
GTPBP1-202ENST00000418601 SIRT1Q96EB6 747 aa28.97■■■□□ 2.23
GTPBP1-202ENST00000418601 GPRASP1Q5JY77 1395 aa28.96■■■□□ 2.23
GTPBP1-202ENST00000418601 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa28.94■■■□□ 2.22
GTPBP1-202ENST00000418601 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
GTPBP1-202ENST00000418601 NRKQ7Z2Y5 1582 aa28.93■■■□□ 2.22
GTPBP1-202ENST00000418601 PRAM1Q96QH2 718 aa28.92■■■□□ 2.22
GTPBP1-202ENST00000418601 STRN4Q9NRL3 753 aa28.92■■■□□ 2.22
GTPBP1-202ENST00000418601 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
GTPBP1-202ENST00000418601 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
GTPBP1-202ENST00000418601 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
GTPBP1-202ENST00000418601 KIAA0232Q92628 1395 aa28.89■■■□□ 2.22
GTPBP1-202ENST00000418601 PDE3BQ13370 1112 aa28.88■■■□□ 2.21
GTPBP1-202ENST00000418601 USP35Q9P2H5 1018 aa28.88■■■□□ 2.21
GTPBP1-202ENST00000418601 CASZ1Q86V15 1759 aa28.88■■■□□ 2.21
GTPBP1-202ENST00000418601 CHRNA2Q15822 529 aa28.87■■■□□ 2.21
GTPBP1-202ENST00000418601 DLC1Q96QB1 1528 aa28.87■■■□□ 2.21
GTPBP1-202ENST00000418601 MYOM1P52179 1685 aa28.86■■■□□ 2.21
GTPBP1-202ENST00000418601 TULP4Q9NRJ4 1543 aa28.85■■■□□ 2.21
GTPBP1-202ENST00000418601 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
GTPBP1-202ENST00000418601 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
GTPBP1-202ENST00000418601 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa28.85■■■□□ 2.21
GTPBP1-202ENST00000418601 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
GTPBP1-202ENST00000418601 IFFO2Q5TF58 517 aa28.84■■■□□ 2.21
GTPBP1-202ENST00000418601 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
GTPBP1-202ENST00000418601 POGKQ9P215 609 aa28.83■■■□□ 2.21
GTPBP1-202ENST00000418601 SSH2Q76I76 1423 aa28.83■■■□□ 2.21
GTPBP1-202ENST00000418601 PRR36Q9H6K5 1346 aa28.82■■■□□ 2.2
GTPBP1-202ENST00000418601 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
GTPBP1-202ENST00000418601 BARGINQ6ZT62 677 aa28.81■■■□□ 2.2
GTPBP1-202ENST00000418601 CFAP70Q5T0N1 1121 aa28.8■■■□□ 2.2
GTPBP1-202ENST00000418601 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
GTPBP1-202ENST00000418601 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
GTPBP1-202ENST00000418601 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
GTPBP1-202ENST00000418601 C1QTNF8P60827 252 aa28.76■■■□□ 2.19
GTPBP1-202ENST00000418601 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
GTPBP1-202ENST00000418601 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
GTPBP1-202ENST00000418601 ITSN1Q15811 1721 aa28.76■■■□□ 2.19
GTPBP1-202ENST00000418601 ATP7BP35670 1465 aa28.75■■■□□ 2.19
GTPBP1-202ENST00000418601 EVA1CP58658 441 aa28.74■■■□□ 2.19
GTPBP1-202ENST00000418601 LMO7Q8WWI1 1683 aa28.74■■■□□ 2.19
GTPBP1-202ENST00000418601 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
GTPBP1-202ENST00000418601 PEAK1Q9H792 1746 aa28.73■■■□□ 2.19
GTPBP1-202ENST00000418601 TCP11L2Q8N4U5 519 aa28.72■■■□□ 2.19
GTPBP1-202ENST00000418601 CHD4Q14839 1912 aa28.71■■■□□ 2.19
GTPBP1-202ENST00000418601 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa28.71■■■□□ 2.19
GTPBP1-202ENST00000418601 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa28.71■■■□□ 2.19
GTPBP1-202ENST00000418601 OVOS2Q6IE36 1432 aa28.71■■■□□ 2.19
GTPBP1-202ENST00000418601 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
GTPBP1-202ENST00000418601 ADGRB1O14514 1584 aa28.7■■■□□ 2.18
GTPBP1-202ENST00000418601 UTRNP46939 3433 aa28.69■■■□□ 2.18
GTPBP1-202ENST00000418601 ZBTB7AO95365 584 aa28.69■■■□□ 2.18
GTPBP1-202ENST00000418601 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
GTPBP1-202ENST00000418601 SBF2Q86WG5 1849 aa28.69■■■□□ 2.18
GTPBP1-202ENST00000418601 LRRC37A3O60309 1634 aa28.68■■■□□ 2.18
GTPBP1-202ENST00000418601 NUTM2GQ5VZR2 741 aa28.67■■■□□ 2.18
GTPBP1-202ENST00000418601 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
GTPBP1-202ENST00000418601 WASLO00401 505 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
GTPBP1-202ENST00000418601 PTGER2P43116 358 aa28.65■■■□□ 2.18
GTPBP1-202ENST00000418601 TRAK1Q9UPV9 953 aa28.65■■■□□ 2.18
GTPBP1-202ENST00000418601 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
GTPBP1-202ENST00000418601 PLSCR1O15162 318 aa28.63■■■□□ 2.17
GTPBP1-202ENST00000418601 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
GTPBP1-202ENST00000418601 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
GTPBP1-202ENST00000418601 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
GTPBP1-202ENST00000418601 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
GTPBP1-202ENST00000418601 SYT17Q9BSW7 474 aa28.6■■■□□ 2.17
GTPBP1-202ENST00000418601 CPDO75976 1380 aa28.6■■■□□ 2.17
GTPBP1-202ENST00000418601 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.59■■■□□ 2.17
GTPBP1-202ENST00000418601 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa28.58■■■□□ 2.17
GTPBP1-202ENST00000418601 CRB1P82279 1406 aa28.57■■■□□ 2.16
GTPBP1-202ENST00000418601 WNK3Q9BYP7 1800 aa28.56■■■□□ 2.16
GTPBP1-202ENST00000418601 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
GTPBP1-202ENST00000418601 PTF1AQ7RTS3 328 aa28.54■■■□□ 2.16
GTPBP1-202ENST00000418601 AKAP12Q02952 1782 aa28.54■■■□□ 2.16
GTPBP1-202ENST00000418601 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
GTPBP1-202ENST00000418601 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
GTPBP1-202ENST00000418601 USP19O94966 1318 aa28.52■■■□□ 2.16
GTPBP1-202ENST00000418601 STK32BQ9NY57 414 aa28.52■■■□□ 2.16
GTPBP1-202ENST00000418601 PROM2Q8N271 834 aa28.51■■■□□ 2.15
GTPBP1-202ENST00000418601 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
GTPBP1-202ENST00000418601 MTFR1LQ9H019 292 aa28.5■■■□□ 2.15
GTPBP1-202ENST00000418601 DDB1Q16531 1140 aa28.49■■■□□ 2.15
GTPBP1-202ENST00000418601 ABTB2Q8N961 1025 aa28.48■■■□□ 2.15
GTPBP1-202ENST00000418601 ACEP12821 1306 aa28.47■■■□□ 2.15
GTPBP1-202ENST00000418601 SLC15A2Q16348 729 aa28.47■■■□□ 2.15
GTPBP1-202ENST00000418601 SGIP1Q9BQI5 828 aa28.47■■■□□ 2.15
GTPBP1-202ENST00000418601 TXNRD1Q16881 649 aa28.44■■■□□ 2.14
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