RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000167111.5

Rabggtb-202, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Rabggtb, Length 1,418 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ppp6r1Q7TSI3 856 aa16.17■□□□□ 0.18
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Tulp4Q9JIL5 1547 aa16.17■□□□□ 0.18
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 HdgfP51859 237 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 PsdQ5DTT2 1024 aa16.16■□□□□ 0.18
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 PaskQ8CEE6 1383 aa16.15■□□□□ 0.18
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Mink1Q9JM52 1308 aa16.14■□□□□ 0.17
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Cacna1sQ02789 1880 aa16.14■□□□□ 0.17
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Znf316Q6PGE4 1016 aa16.14■□□□□ 0.17
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 En2P09066 324 aa16.13■□□□□ 0.17
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ifit1bl1D3Z6F0 470 aa16.12■□□□□ 0.17
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gm20521D3Z5F7 333 aa16.11■□□□□ 0.17
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Magea1O89006 320 aa16.11■□□□□ 0.17
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Magea5O89009 320 aa16.11■□□□□ 0.17
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Rapgefl1Q68EF8 662 aa16.11■□□□□ 0.17
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Magea2Q9R2A2 320 aa16.11■□□□□ 0.17
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ncapd2Q8K2Z4 1392 aa16.11■□□□□ 0.17
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Dzip1Q8BMD2 852 aa16.11■□□□□ 0.17
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Pm20d1Q8C165 503 aa16.1■□□□□ 0.17
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Pard3Q99NH2 1333 aa16.09■□□□□ 0.17
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Adamts13Q769J6 1426 aa16.09■□□□□ 0.17
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Abca14E9Q8F8 1683 aa16.08■□□□□ 0.16
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Bcl9lQ67FY2 1494 aa16.08■□□□□ 0.16
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 IqubQ8CDK3 788 aa16.08■□□□□ 0.16
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 TimelessQ9R1X4 1197 aa16.08■□□□□ 0.16
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 4930523C07RikE9Q2T4 99 aa16.07■□□□□ 0.16
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gpr150Q8BL07 427 aa16.07■□□□□ 0.16
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Stag3O70576 1240 aa16.06■□□□□ 0.16
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Nid2O88322 1403 aa16.06■□□□□ 0.16
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Rock1P70335 1354 aa16.05■□□□□ 0.16
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Astn2Q80Z10 1352 aa16.05■□□□□ 0.16
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Fer1l6E0CZ42 1862 aa16.04■□□□□ 0.16
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Card11Q8CIS0 1159 aa16.03■□□□□ 0.16
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Rab3gap2Q8BMG7 1366 aa16.03■□□□□ 0.16
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gm21698A0A087WQP8 267 aa16.02■□□□□ 0.16
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gm21671G3UY31 267 aa16.02■□□□□ 0.16
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Sbno1Q689Z5 1390 aa16.02■□□□□ 0.16
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Mug2P28666 1451 aa16.02■□□□□ 0.15
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Rgl3Q3UYI5 709 aa16.02■□□□□ 0.15
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Zeb2Q9R0G7 1215 aa16.02■□□□□ 0.15
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Cdk5rap2Q8K389 1822 aa16.01■□□□□ 0.15
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ppef1O35655 650 aa16.01■□□□□ 0.15
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Cep152A2AUM9 1736 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 GalcP54818 684 aa16■□□□□ 0.15
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Yy1Q00899 414 aa16■□□□□ 0.15
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Cdk19Q8BWD8 501 aa16■□□□□ 0.15
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Mast2Q60592 1734 aa15.99■□□□□ 0.15
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Slx1bQ8BX32 270 aa15.99■□□□□ 0.15
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 GakQ99KY4 1305 aa15.99■□□□□ 0.15
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ccdc85cE9Q6B2 420 aa15.98■□□□□ 0.15
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ubxn2bQ0KL01 331 aa15.98■□□□□ 0.15
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Mon2Q80TL7 1715 aa15.98■□□□□ 0.15
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Vars2Q3U2A8 1060 aa15.97■□□□□ 0.15
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Tet3Q8BG87 1668 aa15.97■□□□□ 0.15
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Zcwpw1Q6IR42 630 aa15.96■□□□□ 0.15
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Usp40Q8BWR4 1235 aa15.96■□□□□ 0.15
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Lrit1Q8K099 624 aa15.96■□□□□ 0.15
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Chrna2Q91X60 512 aa15.96■□□□□ 0.15
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Zcrb1Q9CZ96 217 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Kcnq2Q9Z351 759 aa15.94■□□□□ 0.14
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Snapc4Q8BP86 1333 aa15.94■□□□□ 0.14
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 RalgapbQ8BQZ4 1484 aa15.93■□□□□ 0.14
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Cpsf1Q9EPU4 1441 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Frmpd2A0A140LI67 1392 aa15.92■□□□□ 0.14
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gimap6Q8K349 305 aa15.92■□□□□ 0.14
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 NktrP30415 1453 aa15.92■□□□□ 0.14
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Erbb3Q61526 1339 aa15.91■□□□□ 0.14
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ppfibp2O35711 882 aa15.91■□□□□ 0.14
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Tnrc6bQ8BKI2 1810 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Igf2rQ07113 2483 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ankrd23Q812A3 306 aa15.89■□□□□ 0.13
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Card10P58660 1021 aa15.88■□□□□ 0.13
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Vps33bP59016 617 aa15.88■□□□□ 0.13
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Nckap5lQ6GQX2 1323 aa15.88■□□□□ 0.13
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Sipa1l1Q8C0T5 1782 aa15.87■□□□□ 0.13
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gm16486A0A1D5RMD1 1434 aa15.87■□□□□ 0.13
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ccer2J3QPU5 274 aa15.86■□□□□ 0.13
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ddb1Q3U1J4 1140 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ncoa4Q5U4H9 625 aa15.86■□□□□ 0.13
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Pim2Q62070 370 aa15.86■□□□□ 0.13
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Idi2Q8BFZ6 227 aa15.86■□□□□ 0.13
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Amotl2Q8K371 772 aa15.86■□□□□ 0.13
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 TonslQ6NZL6 1363 aa15.86■□□□□ 0.13
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Zdbf2Q5SS00 2493 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Mdc1Q5PSV9 1707 aa15.86■□□□□ 0.13
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Usp47Q8BY87 1376 aa15.85■□□□□ 0.13
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 CatipB9EKE5 520 aa15.85■□□□□ 0.13
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Nwd2Q6P5U7 1742 aa15.85■□□□□ 0.13
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Lrp5Q91VN0 1614 aa15.84■□□□□ 0.13
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gsto1O09131 240 aa15.84■□□□□ 0.13
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 RgmbQ7TQ33 436 aa15.83■□□□□ 0.12
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Kat6bQ8BRB7 1872 aa15.83■□□□□ 0.12
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Uhrf1bp1lA2RSJ4 1457 aa15.82■□□□□ 0.12
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa15.82■□□□□ 0.12
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 CenpjQ569L8 1344 aa15.82■□□□□ 0.12
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Rnf180Q3U827 592 aa15.81■□□□□ 0.12
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa15.81■□□□□ 0.12
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Dnajc10Q9DC23 793 aa15.81■□□□□ 0.12
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Map3k19E9Q3S4 1311 aa15.81■□□□□ 0.12
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Nphp4P59240 1425 aa15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35.5 ms