RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520489.5

BIN3-208, Transcript of bridging integrator 3, human

TSL 2

Gene BIN3, Length 3,589 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BIN3-208	ENST00000520489	UBAP1	Q9NZ09	502 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	BPTF	Q12830	3046 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	PIR	O00625	290 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	EGFR	P00533	1210 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	RAP1GAP	P47736	663 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	RBP5	P82980	135 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	CUL3	Q13618	768 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	TLR1	Q15399	786 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	NIM1K	Q8IY84	436 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	LSMEM2	Q8N112	164 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	NPY6R	Q99463	290 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	CD300A	Q9UGN4	299 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	SCN1A	P35498	2009 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	CXCL8	P10145	99 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	HOXC13	P31276	330 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	NDST1	P52848	882 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	AQP4	P55087	323 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	CCDC6	Q16204	474 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	CARM1	Q86X55	608 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	EPAS1	Q99814	870 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	THTPA	Q9BU02	230 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	CDH7	Q9ULB5	785 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489		M0QYV0	167 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	NPHS1	O60500	1241 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	AP2A1	O95782	977 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	ZBED1	O96006	694 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	C7	P10643	843 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	GJC1	P36383	396 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	ACADSB	P45954	432 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	SERPINB8	P50452	374 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	DYNLT1	P63172	113 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	TUBA4A	P68366	448 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	PLCB3	Q01970	1234 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	PDK3	Q15120	406 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	SEZ6	Q53EL9	994 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	FSCB	Q5H9T9	825 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	STYX	Q8WUJ0	223 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	HSPH1	Q92598	858 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	SNX27	Q96L92	541 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	FAM210A	Q96ND0	272 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	KIFC1	Q9BW19	673 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	TMEM216	Q9P0N5	145 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	RGSL1	A5PLK6	1076 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	AP3B1	O00203	1094 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	B4GALT5	O43286	388 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	CYP2B6	P20813	491 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	CDH8	P55286	799 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	POLE2	P56282	527 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	MYBPC1	Q00872	1141 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	GBE1	Q04446	702 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	DLG1	Q12959	904 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	HPDL	Q96IR7	371 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	LRGUK	Q96M69	825 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	SESN3	P58005	492 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	RAB41	Q5JT25	222 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	CERS2	Q96G23	380 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	MAML3	Q96JK9	1138 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BIN3-208	ENST00000520489	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68

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