RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428457.1

TNS3-204, Transcript of tensin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TNS3, Length 5,070 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3-204ENST00000428457 MTTPP55157 894 aa10.2□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 FSTL1Q12841 308 aa10.2□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 BNIP1Q12981 228 aa10.2□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 AMHR2Q16671 573 aa10.2□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa10.2□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 ZNF662Q6ZS27 426 aa10.2□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 LRRC55Q6ZSA7 311 aa10.2□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 CCDC80Q76M96 950 aa10.2□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 ZNF554Q86TJ5 538 aa10.2□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 CLPTM1LQ96KA5 538 aa10.2□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 LRRC40Q9H9A6 602 aa10.2□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 PCYOX1Q9UHG3 505 aa10.2□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 UBR1Q8IWV7 1749 aa10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 A0A1W2PPM1 405 aa10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 EVPLLA8MZ36 301 aa10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 C5orf58C9J3I9 102 aa10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 AGRPO00253 132 aa10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 IRF6O14896 467 aa10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 WFS1O76024 890 aa10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 LCA5LO95447 670 aa10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 ZNF286BP0CG31 522 aa10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 ARP10275 920 aa10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 VDRP11473 427 aa10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 CNTFP26441 200 aa10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 APBB2Q92870 758 aa10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 ZNF333Q96JL9 665 aa10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 FAR2Q96K12 515 aa10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 RNF145Q96MT1 663 aa10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 TSPAN18Q96SJ8 248 aa10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 WDR41Q9HAD4 459 aa10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 AP4B1Q9Y6B7 739 aa10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 AK5Q9Y6K8 562 aa10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 MYOM1P52179 1685 aa10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 TRIM13O60858 407 aa10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 EDF1O60869 148 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 NPTX2P47972 431 aa10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 CASP5P51878 434 aa10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 LSM3P62310 102 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 MGAT5Q09328 741 aa10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 TMEM63BQ5T3F8 832 aa10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 GPR107Q5VW38 600 aa10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 TTC30BQ8N4P2 665 aa10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 UBASH3BQ8TF42 649 aa10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 ERVK-5Q9HDB9 667 aa10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 KANSL1LA0AUZ9 987 aa10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 CHRM3P20309 590 aa10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 POU1F1P28069 291 aa10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 CTNNB1P35222 781 aa10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 USP4Q13107 963 aa10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 CRY2Q49AN0 593 aa10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 ARPINQ7Z6K5 226 aa10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 STX19Q8N4C7 294 aa10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 DNAJB3Q8WWF6 145 aa10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 RORBQ92753 470 aa10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 HMG20AQ9NP66 347 aa10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 MAN1C1Q9NR34 630 aa10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 EURLQ9NYK6 297 aa10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 SLIT3O75094 1523 aa10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 RIC1Q4ADV7 1423 aa10.19□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 SLCO1B7G3V0H7 640 aa10.18□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 LSM1O15116 133 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP10.18□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 ALDH1A2O94788 518 aa10.18□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 LDLRP01130 860 aa10.18□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 VTNP04004 478 aa10.18□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 PYGLP06737 847 aa10.18□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 FCGR1AP12314 374 aa10.18□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 SOX10P56693 466 aa10.18□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 FBXW4P57775 412 aa10.18□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 VAC14Q08AM6 782 aa10.18□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 MYBPC2Q14324 1141 aa10.18□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 IL17AQ16552 155 aa10.18□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 LIN52Q52LA3 116 aa10.18□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 ARHGAP17Q68EM7 881 aa10.18□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 TRIM69Q86WT6 500 aa10.18□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 ATG16L2Q8NAA4 619 aa10.18□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 ALG3Q92685 438 aa10.18□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 OSMRQ99650 979 aa10.18□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 KLK14Q9P0G3 267 aa10.18□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 A0A096LPK6 155 aa10.18□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa10.18□□□□□ -0.78
TNS3-204ENST00000428457 PDZK1P1A8MUH7 402 aa10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms