RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000039559.8

Thbs1-201, Transcript of Thrombospondin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Thbs1, Length 5,848 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Akr1clQ3UXL1 322 aa9.5□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 2900092C05RikQ5I0V9 184 aa9.5□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Smarcd1Q61466 515 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 TsnQ62348 228 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Cep78Q6IRU7 790 aa9.5□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Foxo6Q70KY4 559 aa9.5□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 RragdQ7TT45 449 aa9.5□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 R3hdm2Q80TM6 1044 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Enpp4Q8BTJ4 456 aa9.5□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Rab36Q8CAM5 267 aa9.5□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Asb11Q9CQ31 323 aa9.5□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 2010005H15RikQ9D8D6 97 aa9.5□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tmem86aQ9D8N3 241 aa9.5□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Kif1aP33173 1695 aa9.5□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Vmn2r31L7N1Z4 861 aa9.5□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 YwhazP63101 245 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Dnal1Q05A62 190 aa9.5□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Mtnr1aQ61184 353 aa9.5□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Fam149b1Q6NSV7 578 aa9.5□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Rexo4Q6PAQ4 432 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Rrm2bQ6PEE3 351 aa9.5□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gja6Q6S5G4 283 aa9.5□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Aldh4a1Q8CHT0 562 aa9.5□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Rpp40Q8R1F9 363 aa9.5□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Mtg1Q8R2R6 326 aa9.5□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Fam45aQ9D8N2 357 aa9.5□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Borcs5Q9D920 195 aa9.5□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 PllpQ9DCU2 182 aa9.5□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Thap11Q9JJD0 305 aa9.5□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Zfp277E9Q6D6 583 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Bnc1O35914 961 aa9.5□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Hmox2O70252 315 aa9.5□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 TnfP06804 235 aa9.5□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Sfmbt2Q5DTW2 938 aa9.5□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Traf3Q60803 567 aa9.5□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 HadhQ61425 314 aa9.5□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gba2Q69ZF3 918 aa9.5□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Fam126aQ6P9N1 521 aa9.5□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tas2r125Q7M710 311 aa9.5□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Spon2Q8BMS2 330 aa9.5□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 RadxQ8C779 850 aa9.5□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Vmn1r64Q8R2B8 320 aa9.5□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Arhgef10Q8C033 1345 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Cps1Q8C196 1500 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Lgr4A2ARI4 951 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Capn6O35646 641 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Itgb5O70309 798 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Defa8P50706 81 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 4930502E18RikQ14BQ3 236 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm11437Q5QR91 290 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Nr1h2Q60644 446 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Coq8aQ60936 645 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Mief1Q8BGV8 463 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 GaleQ8R059 347 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Pgm3Q9CYR6 542 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Nek2O35942 443 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 LeprP48356 1162 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Scrn3Q3TMH2 418 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Hat1Q8BY71 416 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Znf451Q8C0P7 1056 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Zdhhc3Q8R173 299 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Vwa1Q8R2Z5 415 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Plbd1Q8VCI0 550 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tmco1Q921L3 188 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gprc5bQ923Z0 410 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ak1Q9R0Y5 194 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Umodl1Q5DID3 1319 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm21149A0A0G2JFY7 255 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 A930018M24RikB7ZMY3 218 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tcp10cE9Q046 482 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 PtgisO35074 501 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tap1P21958 724 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Usp39Q3TIX9 564 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Lrrc14bQ3UJB3 510 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Cdc14aQ6GQT0 603 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Mrps26Q80ZS3 200 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm9758Q80ZT2 255 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Trim50Q810I2 483 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Mapkap1Q8BKH7 522 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Pcyox1lQ8C7K6 495 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gsdmc3Q8CB12 480 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Mboat7Q8CHK3 473 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Pkn3Q8K045 878 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Plac9Q8K262 108 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Trpv3Q8K424 791 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Rtfdc1Q99K95 307 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gtf2ird2Q99NI3 936 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Chaf1bQ9D0N7 572 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Serpini2Q9JK88 405 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Sfmbt1Q9JMD1 863 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm36210A0A1B0GS00 229 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Reps1O54916 795 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 LtfP08071 707 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gbx2P48031 348 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Etv6P97360 485 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 PamP97467 979 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Vsx2Q61412 361 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Rsbn1Q80T69 795 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Zswim6Q80TB7 1207 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tmem169Q8BG50 297 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 46.8 ms