Protein–RNA interactions for Protein: Q8K262

Plac9, Placenta-specific protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plac9Q8K262 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Plac9Q8K262 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Plac9Q8K262 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Plac9Q8K262 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Plac9Q8K262 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Plac9Q8K262 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Plac9Q8K262 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Plac9Q8K262 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Plac9Q8K262 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Plac9Q8K262 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Plac9Q8K262 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Plac9Q8K262 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Plac9Q8K262 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Plac9Q8K262 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Plac9Q8K262 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Plac9Q8K262 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Plac9Q8K262 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Plac9Q8K262 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Plac9Q8K262 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Plac9Q8K262 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Plac9Q8K262 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Plac9Q8K262 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Plac9Q8K262 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Plac9Q8K262 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Plac9Q8K262 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Plac9Q8K262 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Plac9Q8K262 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Plac9Q8K262 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Plac9Q8K262 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Plac9Q8K262 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Plac9Q8K262 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Plac9Q8K262 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Plac9Q8K262 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Plac9Q8K262 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Plac9Q8K262 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Plac9Q8K262 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Plac9Q8K262 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Plac9Q8K262 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Plac9Q8K262 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Plac9Q8K262 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Plac9Q8K262 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Plac9Q8K262 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Plac9Q8K262 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Plac9Q8K262 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Plac9Q8K262 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Plac9Q8K262 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Plac9Q8K262 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Plac9Q8K262 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Plac9Q8K262 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Plac9Q8K262 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Plac9Q8K262 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Plac9Q8K262 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Plac9Q8K262 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Plac9Q8K262 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Plac9Q8K262 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Plac9Q8K262 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Plac9Q8K262 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Plac9Q8K262 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Plac9Q8K262 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Plac9Q8K262 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Plac9Q8K262 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Plac9Q8K262 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Plac9Q8K262 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Plac9Q8K262 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Plac9Q8K262 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Plac9Q8K262 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Plac9Q8K262 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Plac9Q8K262 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Plac9Q8K262 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Plac9Q8K262 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Plac9Q8K262 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Plac9Q8K262 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Plac9Q8K262 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Plac9Q8K262 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Plac9Q8K262 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Plac9Q8K262 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Plac9Q8K262 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Plac9Q8K262 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Plac9Q8K262 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Plac9Q8K262 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Plac9Q8K262 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Plac9Q8K262 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Plac9Q8K262 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Plac9Q8K262 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Plac9Q8K262 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Plac9Q8K262 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Plac9Q8K262 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Plac9Q8K262 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Plac9Q8K262 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Plac9Q8K262 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Plac9Q8K262 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Plac9Q8K262 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Plac9Q8K262 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Plac9Q8K262 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Plac9Q8K262 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Plac9Q8K262 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Plac9Q8K262 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Plac9Q8K262 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Plac9Q8K262 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Plac9Q8K262 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.1 ms