Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42.85■■■■■ 4.45
Gja6Q6S5G4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Gja6Q6S5G4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Gja6Q6S5G4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
Gja6Q6S5G4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
Gja6Q6S5G4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
Gja6Q6S5G4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Gja6Q6S5G4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Gja6Q6S5G4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Gja6Q6S5G4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Gja6Q6S5G4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
Gja6Q6S5G4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Gja6Q6S5G4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Gja6Q6S5G4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Gja6Q6S5G4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Gja6Q6S5G4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Gja6Q6S5G4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Gja6Q6S5G4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Gja6Q6S5G4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Gja6Q6S5G4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Gja6Q6S5G4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Gja6Q6S5G4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Gja6Q6S5G4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Gja6Q6S5G4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Gja6Q6S5G4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Gja6Q6S5G4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Gja6Q6S5G4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Gja6Q6S5G4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Gja6Q6S5G4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Gja6Q6S5G4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Gja6Q6S5G4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Gja6Q6S5G4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Gja6Q6S5G4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Gja6Q6S5G4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Gja6Q6S5G4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Gja6Q6S5G4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Gja6Q6S5G4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Gja6Q6S5G4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Gja6Q6S5G4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Gja6Q6S5G4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Gja6Q6S5G4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Gja6Q6S5G4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Gja6Q6S5G4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Gja6Q6S5G4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Gja6Q6S5G4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
Gja6Q6S5G4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Gja6Q6S5G4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Gja6Q6S5G4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Gja6Q6S5G4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
Gja6Q6S5G4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Gja6Q6S5G4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Gja6Q6S5G4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Gja6Q6S5G4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Gja6Q6S5G4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Gja6Q6S5G4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Gja6Q6S5G4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Gja6Q6S5G4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Gja6Q6S5G4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Gja6Q6S5G4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Gja6Q6S5G4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
Gja6Q6S5G4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Gja6Q6S5G4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Gja6Q6S5G4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Gja6Q6S5G4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Gja6Q6S5G4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Gja6Q6S5G4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Gja6Q6S5G4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Gja6Q6S5G4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Gja6Q6S5G4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Gja6Q6S5G4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Gja6Q6S5G4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Gja6Q6S5G4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
Gja6Q6S5G4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Gja6Q6S5G4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Gja6Q6S5G4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Gja6Q6S5G4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Gja6Q6S5G4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Gja6Q6S5G4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Gja6Q6S5G4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Gja6Q6S5G4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Gja6Q6S5G4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
Gja6Q6S5G4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Gja6Q6S5G4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Gja6Q6S5G4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Gja6Q6S5G4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Gja6Q6S5G4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Gja6Q6S5G4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Gja6Q6S5G4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Gja6Q6S5G4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Gja6Q6S5G4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Gja6Q6S5G4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Gja6Q6S5G4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Gja6Q6S5G4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
Gja6Q6S5G4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Gja6Q6S5G4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Gja6Q6S5G4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Gja6Q6S5G4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Gja6Q6S5G4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Gja6Q6S5G4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Gja6Q6S5G4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms