Protein–RNA interactions for Protein: O35646

Capn6, Calpain-6, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn6O35646 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
Capn6O35646 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Capn6O35646 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Capn6O35646 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Capn6O35646 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Capn6O35646 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Capn6O35646 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Capn6O35646 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Capn6O35646 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Capn6O35646 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Capn6O35646 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Capn6O35646 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Capn6O35646 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Capn6O35646 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
Capn6O35646 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Capn6O35646 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Capn6O35646 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Capn6O35646 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Capn6O35646 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Capn6O35646 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Capn6O35646 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Capn6O35646 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Capn6O35646 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Capn6O35646 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Capn6O35646 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Capn6O35646 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Capn6O35646 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Capn6O35646 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Capn6O35646 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Capn6O35646 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Capn6O35646 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Capn6O35646 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Capn6O35646 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Capn6O35646 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Capn6O35646 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Capn6O35646 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Capn6O35646 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Capn6O35646 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Capn6O35646 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Capn6O35646 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Capn6O35646 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Capn6O35646 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Capn6O35646 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Capn6O35646 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Capn6O35646 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Capn6O35646 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Capn6O35646 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Capn6O35646 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Capn6O35646 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Capn6O35646 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Capn6O35646 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Capn6O35646 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Capn6O35646 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Capn6O35646 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Capn6O35646 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Capn6O35646 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Capn6O35646 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Capn6O35646 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Capn6O35646 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Capn6O35646 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Capn6O35646 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Capn6O35646 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Capn6O35646 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Capn6O35646 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Capn6O35646 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Capn6O35646 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Capn6O35646 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Capn6O35646 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Capn6O35646 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Capn6O35646 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Capn6O35646 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Capn6O35646 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Capn6O35646 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Capn6O35646 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Capn6O35646 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Capn6O35646 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Capn6O35646 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Capn6O35646 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Capn6O35646 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Capn6O35646 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Capn6O35646 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Capn6O35646 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Capn6O35646 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Capn6O35646 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Capn6O35646 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Capn6O35646 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Capn6O35646 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Capn6O35646 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Capn6O35646 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Capn6O35646 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Capn6O35646 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Capn6O35646 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Capn6O35646 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Capn6O35646 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Capn6O35646 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Capn6O35646 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Capn6O35646 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Capn6O35646 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Capn6O35646 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Capn6O35646 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms