Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38,87■■■■□ 3,81
Bnc1O35914 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36,04■■■■□ 3,36
Bnc1O35914 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,59■■■■□ 3,29
Bnc1O35914 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33,78■■■■□ 3
Bnc1O35914 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33,74■■■□□ 2,99
Bnc1O35914 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,95■■■□□ 2,87
Bnc1O35914 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32,92■■■□□ 2,86
Bnc1O35914 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,86■■■□□ 2,85
Bnc1O35914 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,85■■■□□ 2,85
Bnc1O35914 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32,83■■■□□ 2,85
Bnc1O35914 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32,48■■■□□ 2,79
Bnc1O35914 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,31■■■□□ 2,76
Bnc1O35914 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,95■■■□□ 2,7
Bnc1O35914 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,76■■■□□ 2,68
Bnc1O35914 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31,58■■■□□ 2,65
Bnc1O35914 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,53■■■□□ 2,64
Bnc1O35914 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,32■■■□□ 2,6
Bnc1O35914 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31,28■■■□□ 2,6
Bnc1O35914 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31,24■■■□□ 2,59
Bnc1O35914 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
Bnc1O35914 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Bnc1O35914 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,54
Bnc1O35914 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,87■■■□□ 2,53
Bnc1O35914 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30,86■■■□□ 2,53
Bnc1O35914 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30,74■■■□□ 2,51
Bnc1O35914 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Bnc1O35914 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30,64■■■□□ 2,5
Bnc1O35914 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Bnc1O35914 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Bnc1O35914 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30,48■■■□□ 2,47
Bnc1O35914 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
Bnc1O35914 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30,25■■■□□ 2,43
Bnc1O35914 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Bnc1O35914 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Bnc1O35914 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Bnc1O35914 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Bnc1O35914 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30■■■□□ 2,39
Bnc1O35914 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,96■■■□□ 2,39
Bnc1O35914 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Bnc1O35914 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29,88■■■□□ 2,37
Bnc1O35914 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29,87■■■□□ 2,37
Bnc1O35914 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Bnc1O35914 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Bnc1O35914 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29,66■■■□□ 2,34
Bnc1O35914 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29,56■■■□□ 2,32
Bnc1O35914 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29,53■■■□□ 2,32
Bnc1O35914 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Bnc1O35914 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Bnc1O35914 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Bnc1O35914 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Bnc1O35914 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Bnc1O35914 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29,31■■■□□ 2,28
Bnc1O35914 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29,29■■■□□ 2,28
Bnc1O35914 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Bnc1O35914 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Bnc1O35914 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29,19■■■□□ 2,26
Bnc1O35914 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29,14■■■□□ 2,26
Bnc1O35914 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Bnc1O35914 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Bnc1O35914 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29,02■■■□□ 2,24
Bnc1O35914 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,97■■■□□ 2,23
Bnc1O35914 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Bnc1O35914 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28,89■■■□□ 2,21
Bnc1O35914 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Bnc1O35914 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Bnc1O35914 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Bnc1O35914 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Bnc1O35914 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28,82■■■□□ 2,2
Bnc1O35914 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,8■■■□□ 2,2
Bnc1O35914 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Bnc1O35914 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28,75■■■□□ 2,19
Bnc1O35914 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28,75■■■□□ 2,19
Bnc1O35914 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28,67■■■□□ 2,18
Bnc1O35914 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Bnc1O35914 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Bnc1O35914 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Bnc1O35914 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28,57■■■□□ 2,16
Bnc1O35914 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28,56■■■□□ 2,16
Bnc1O35914 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Bnc1O35914 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Bnc1O35914 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,49■■■□□ 2,15
Bnc1O35914 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Bnc1O35914 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Bnc1O35914 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Bnc1O35914 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,42■■■□□ 2,14
Bnc1O35914 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Bnc1O35914 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Bnc1O35914 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Bnc1O35914 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Bnc1O35914 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Bnc1O35914 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28,17■■■□□ 2,1
Bnc1O35914 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28,16■■■□□ 2,1
Bnc1O35914 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28,15■■■□□ 2,1
Bnc1O35914 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28,11■■■□□ 2,09
Bnc1O35914 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28,11■■■□□ 2,09
Bnc1O35914 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Bnc1O35914 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Bnc1O35914 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28,03■■■□□ 2,08
Bnc1O35914 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,02■■■□□ 2,08
Bnc1O35914 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28,01■■■□□ 2,07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,4 ms