RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 MIS12Q9H081 205 aa25.86■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa25.86■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 GPSM3Q9Y4H4 160 aa25.86■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa25.85■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 KCNK3O14649 394 aa25.85■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 ASLP04424 464 aa25.85■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 IGHV4-34P06331 123 aa25.85■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 CSKP41240 450 aa25.85■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 RPL34P49207 117 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 ST8SIA6P61647 398 aa25.85■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 RPS24P62847 133 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 NNTQ13423 1086 aa25.85■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 STIM1Q13586 685 aa25.85■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 ARID5BQ14865 1188 aa25.85■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 KCNT1Q5JUK3 1230 aa25.85■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 KDM1BQ8NB78 822 aa25.85■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 SLC39A13Q96H72 371 aa25.85■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 MRGPRX3Q96LB0 322 aa25.85■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 TIGD1Q96MW7 591 aa25.85■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 TLR6Q9Y2C9 796 aa25.85■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 FASNP49327 2511 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 LOC400499M0QZD8 3231 aa25.84■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 P4HA2O15460 535 aa25.84■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 PCDHGA12O60330 932 aa25.84■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 SIN3BO75182 1162 aa25.84■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 CD44P16070 742 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 CTSKP43235 329 aa25.84■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 GRK6P43250 576 aa25.84■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 CETN1Q12798 172 aa25.84■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC40Q4G0X9 1142 aa25.84■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 MS4A13Q5J8X5 152 aa25.84■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 KIAA0895LQ68EN5 471 aa25.84■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 RRAGAQ7L523 313 aa25.84■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 SCUBE3Q8IX30 993 aa25.84■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 SERPINB11Q96P15 392 aa25.84■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 FBXL12Q9NXK8 326 aa25.84■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa25.84■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM131Q92545 1883 aa25.83■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 H0Y8X5 98 aa25.83■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 GPD2P43304 727 aa25.83■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 CCT8P50990 548 aa25.83■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 GCNT1Q02742 428 aa25.83■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 FSCBQ5H9T9 825 aa25.83■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 C9orf64Q5T6V5 341 aa25.83■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 ARHGEF19Q8IW93 802 aa25.83■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 CARNMT1Q8N4J0 409 aa25.83■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 MDM1Q8TC05 714 aa25.83■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 GANCQ8TET4 914 aa25.83■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 SERGEFQ9UGK8 458 aa25.83■■□□□ 1.73
PTPRF-216ENST00000617451 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 TNFSF14O43557 240 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 GALCP54803 685 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 RACK1P63244 317 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 CDH18Q13634 790 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 CST6Q15828 149 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 DCAF6Q58WW2 860 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 ISM2Q6H9L7 571 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 TTI2Q6NXR4 508 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 BEND5Q7L4P6 421 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 CFAP52Q8N1V2 620 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 ERVW-1Q9UQF0 538 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 ADAMTS20P59510 1910 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 A0A1W2PPC4 97 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 FAM47DPA6NHR8 397 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 GOLGA8CPA6NN73 597 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 VILLO15195 856 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 MID1O15344 667 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 SART1O43290 800 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 PPP1R2P41236 205 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 PITRM1Q5JRX3 1037 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 C19orf48Q6RUI8 117 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 EHBP1Q8NDI1 1231 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 ADAM32Q8TC27 787 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 FAM149B1Q96BN6 582 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 KREMEN1Q96MU8 473 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 ST7Q9NRC1 585 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 MAN1B1Q9UKM7 699 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 CNTN6Q9UQ52 1028 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 DFNA5O60443 496 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 SYPL2Q5VXT5 272 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 NCEH1Q6PIU2 408 aa25.8■■□□□ 1.72
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