RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498517.5

ARHGEF3-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF3, Length 787 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-215ENST00000498517 SIX4Q9UIU6 781 aa5.82□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 DSEQ9UL01 958 aa5.82□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP5.82□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa5.82□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 CACNA1GO43497 2377 aa5.82□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa5.81□□□□□ -1.48
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ARHGEF3-215ENST00000498517 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa5.81□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa5.81□□□□□ -1.48
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ARHGEF3-215ENST00000498517 DBX1A6NMT0 343 aa5.81□□□□□ -1.48
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ARHGEF3-215ENST00000498517 NRP1O14786 923 aa5.81□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 INPPL1O15357 1258 aa5.81□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 RIPK2O43353 540 aa5.81□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 PROSCO94903 275 aa5.81□□□□□ -1.48
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ARHGEF3-215ENST00000498517 CHN1P15882 459 aa5.81□□□□□ -1.48
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ARHGEF3-215ENST00000498517 MMP13P45452 471 aa5.81□□□□□ -1.48
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ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa5.81□□□□□ -1.48
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ARHGEF3-215ENST00000498517 IFT88Q13099 833 aa5.81□□□□□ -1.48
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ARHGEF3-215ENST00000498517 TAOK1Q7L7X3 1001 aa5.81□□□□□ -1.48
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ARHGEF3-215ENST00000498517 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 ATF2P15336 505 aa5.8□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 ACO1P21399 889 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 ITGB8P26012 769 aa5.8□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 PCSK1P29120 753 aa5.8□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 ATP5DP30049 168 aa5.8□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
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