RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 SELENOOQ9BVL4 669 aa21.65■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 TPSD1Q9BZJ3 242 aa21.65■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 RAB6CQ9H0N0 254 aa21.65■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa21.65■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 RAD54BQ9Y620 910 aa21.65■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 USP34Q70CQ2 3546 aa21.64■■□□□ 1.06
ACTB-211ENST00000480301 TMCO5BA8MYB1 307 aa21.64■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 CBFA2T2O43439 604 aa21.64■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 ALDH1A2O94788 518 aa21.64■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 TPM3P06753 285 aa21.64■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 GZMAP12544 262 aa21.64■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 RRM1P23921 792 aa21.64■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 SDC4P31431 198 aa21.64■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 CDH18Q13634 790 aa21.64■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 ZNF234Q14588 700 aa21.64■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 C5orf22Q49AR2 442 aa21.64■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa21.64■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa21.64■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa21.64■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 PRR23BQ6ZRT6 265 aa21.64■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 HMGB4Q8WW32 186 aa21.64■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 VCPIP1Q96JH7 1222 aa21.64■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 SIK2Q9H0K1 926 aa21.64■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 VANGL2Q9ULK5 521 aa21.64■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 SNX10Q9Y5X0 201 aa21.64■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa21.63■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 H0Y626 953 aa21.63■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 RPP40O75818 363 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 CASP14P31944 242 aa21.63■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 IRAK1P51617 712 aa21.63■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 LPAL2Q16609 132 aa21.63■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 PTPRNQ16849 979 aa21.63■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 FUT11Q495W5 492 aa21.63■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 RABGAP1LQ5R372 815 aa21.63■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 DNAJC24Q6P3W2 148 aa21.63■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 FAM131BQ86XD5 332 aa21.63■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 DNAAF5Q86Y56 855 aa21.63■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 ZNF683Q8IZ20 524 aa21.63■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa21.63■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 TTC17Q96AE7 1141 aa21.63■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 C1orf74Q96LT6 269 aa21.63■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP21.63■■□□□ 1.053e-23■□□□□ 10.8
ACTB-211ENST00000480301 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 FAM186AA6NE01 2351 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 DCLK1O15075 740 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 GABRG2P18507 467 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 GPD1P21695 349 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 E2F5Q15329 346 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 CDO1Q16878 200 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 ARTNQ5T4W7 220 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 CEP68Q76N32 757 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 STRADAQ7RTN6 431 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 ERLEC1Q96DZ1 483 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 HAPLN3Q96S86 360 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 VPS13AQ96RL7 3174 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 A0A1B0GVM2 712 aa21.61■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 TCAF2A6NFQ2 919 aa21.61■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 DRGXA6NNA5 263 aa21.61■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 RTN2O75298 545 aa21.61■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 FTLP02792 175 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 SERPING1P05155 500 aa21.61■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 DLDP09622 509 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 PRKCHP24723 683 aa21.61■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 CSKP41240 450 aa21.61■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 PITRM1Q5JRX3 1037 aa21.61■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa21.61■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 VSTM4Q8IW00 320 aa21.61■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 MCEEQ96PE7 176 aa21.61■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP21.61■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 INVSQ9Y283 1065 aa21.61■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 CNTN5O94779 1100 aa21.6■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 HLA-EP13747 358 aa21.6■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 HDAC4P56524 1084 aa21.6■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 MAMLD1Q13495 774 aa21.6■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 PLEKHG6Q3KR16 790 aa21.6■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa21.6■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 KBTBD6Q86V97 674 aa21.6■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 APCDD1Q8J025 514 aa21.6■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 PGBD3Q8N328 593 aa21.6■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 DCLK2Q8N568 766 aa21.6■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 FAM172AQ8WUF8 416 aa21.6■■□□□ 1.05
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