RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001226.9

Sh3bp1-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pcdhb18Q91Y02 792 aa17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pcdhac2Q91Y09 1006 aa17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cog2Q921L5 731 aa17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Trpc5Q9QX29 975 aa17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Map3k14Q9WUL6 942 aa17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pcdh7A0A0A6YY83 1255 aa17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm6657A0A1B0GRJ3 277 aa17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr1160A2AVT0 319 aa17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 ZxdbA2CE44 873 aa17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zfp850J3QPC5 689 aa17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 ChrngP04760 519 aa17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Arl4aP61213 200 aa17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Msx2Q03358 267 aa17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 RnaselQ05921 735 aa17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 N4bp1Q6A037 893 aa17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rxfp1Q6R6I7 758 aa17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PolnQ7TQ07 864 aa17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nat14Q8BVG8 206 aa17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 ItchQ8C863 864 aa17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tex19.1Q99MV2 351 aa17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nde1Q9CZA6 344 aa17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Aldh1b1Q9CZS1 519 aa17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cab39lQ9DB16 337 aa17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ttll8A4Q9F1 832 aa17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 DcxO88809 366 aa17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 IppP28575 584 aa17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc12a1P55014 1095 aa17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Atp6v1b2P62814 511 aa17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fbp2P70695 339 aa17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fbxw2Q60584 422 aa17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Itga3Q62470 1053 aa17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fam107aQ78TU8 144 aa17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tspan18Q80WR1 248 aa17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 CcnyQ8BGU5 341 aa17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pggt1bQ8BUY9 377 aa17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Adamts2Q8C9W3 1213 aa17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cnot6Q8K3P5 557 aa17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lypd3Q91YK8 363 aa17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pacsin3Q99JB8 424 aa17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fam227bQ9D518 532 aa17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nme7Q9QXL8 395 aa17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rab17P35292 214 aa17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hipk4Q3V016 616 aa17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Atp2a3Q64518 1038 aa17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Exoc3l4Q6DIA2 721 aa17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 DstykQ6XUX1 927 aa17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Arhgef33Q8BW86 850 aa17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tlk1Q8C0V0 766 aa17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 CherpQ8CGZ0 936 aaKnown RBP17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Agap3Q8VHH5 910 aa17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Prorsd1Q9D820 169 aa17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dach1Q9QYB2 751 aa17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Twf2Q9Z0P5 349 aaKnown RBP17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ern2Q9Z2E3 911 aa17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pcdh15Q99PJ1 1943 aa17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr652B9EHE6 318 aa17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 C1qbpO35658 278 aa17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Grpel2O88396 224 aa17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Alas2P08680 587 aa17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lamp1P11438 406 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Prim2P33610 505 aa17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tac1P41539 130 aa17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccna2P51943 422 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Snx25Q3ZT31 840 aa17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pdp2Q504M2 532 aa17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Efr3bQ6ZQ18 817 aa17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr293Q7TS10 336 aa17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 SybuQ8BHS8 665 aa17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pyhin1Q8BV49 420 aa17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Wdr59Q8C0M0 992 aa17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dlk2Q8K1E3 382 aa17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nup85Q8R480 656 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gstm4Q8R5I6 218 aa17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zfp64Q99KE8 643 aa17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mrps18aQ99N85 196 aa17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 StambpQ9CQ26 424 aa17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mgrn1Q9D074 532 aa17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lrrc71Q9D3W5 558 aa17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Stk32bQ9JJX8 414 aa17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cul3Q9JLV5 768 aa17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Adgra2Q91ZV8 1336 aa17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 D830030K20RikE9PYQ5 218 aa17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm8444F6XS56 118 aa17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm3043K7N693 218 aa17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm16440K7N6G6 218 aa17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm2244L7N2A3 218 aa17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm3278L7N2D2 218 aa17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm8271L7N2E2 218 aa17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 MttpO08601 894 aa17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rpl5P47962 297 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 CstaP56567 97 aa17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Arhgap10Q6Y5D8 786 aa17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kcns3Q8BQZ8 491 aa17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PigwQ8C398 503 aa17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Glis2Q8VDL9 521 aa17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Stk33Q924X7 491 aa17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Taf11Q99JX1 211 aa17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Paip2Q9D6V8 124 aa17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dcaf6Q9DC22 876 aa17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zfp946F6VWU8 523 aa17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 37 ms