Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
Itga3Q62470 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Itga3Q62470 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Itga3Q62470 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Itga3Q62470 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Itga3Q62470 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Itga3Q62470 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Itga3Q62470 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Itga3Q62470 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Itga3Q62470 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Itga3Q62470 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Itga3Q62470 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Itga3Q62470 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Itga3Q62470 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Itga3Q62470 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Itga3Q62470 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Itga3Q62470 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
Itga3Q62470 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Itga3Q62470 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Itga3Q62470 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Itga3Q62470 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Itga3Q62470 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Itga3Q62470 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Itga3Q62470 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Itga3Q62470 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Itga3Q62470 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Itga3Q62470 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Itga3Q62470 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Itga3Q62470 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Itga3Q62470 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Itga3Q62470 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Itga3Q62470 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Itga3Q62470 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
Itga3Q62470 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Itga3Q62470 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Itga3Q62470 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Itga3Q62470 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Itga3Q62470 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Itga3Q62470 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Itga3Q62470 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Itga3Q62470 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Itga3Q62470 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Itga3Q62470 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Itga3Q62470 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Itga3Q62470 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Itga3Q62470 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Itga3Q62470 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Itga3Q62470 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Itga3Q62470 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Itga3Q62470 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Itga3Q62470 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Itga3Q62470 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Itga3Q62470 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Itga3Q62470 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Itga3Q62470 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Itga3Q62470 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Itga3Q62470 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Itga3Q62470 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Itga3Q62470 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Itga3Q62470 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Itga3Q62470 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Itga3Q62470 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Itga3Q62470 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Itga3Q62470 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Itga3Q62470 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Itga3Q62470 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Itga3Q62470 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Itga3Q62470 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Itga3Q62470 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Itga3Q62470 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Itga3Q62470 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Itga3Q62470 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Itga3Q62470 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Itga3Q62470 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Itga3Q62470 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Itga3Q62470 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Itga3Q62470 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Itga3Q62470 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Itga3Q62470 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Itga3Q62470 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Itga3Q62470 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Itga3Q62470 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Itga3Q62470 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Itga3Q62470 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Itga3Q62470 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Itga3Q62470 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Itga3Q62470 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Itga3Q62470 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Itga3Q62470 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Itga3Q62470 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Itga3Q62470 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Itga3Q62470 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Itga3Q62470 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Itga3Q62470 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Itga3Q62470 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Itga3Q62470 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Itga3Q62470 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Itga3Q62470 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Itga3Q62470 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Itga3Q62470 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.6 ms