Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
Pggt1bQ8BUY9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Pggt1bQ8BUY9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Pggt1bQ8BUY9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Pggt1bQ8BUY9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Pggt1bQ8BUY9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Pggt1bQ8BUY9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
Pggt1bQ8BUY9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
Pggt1bQ8BUY9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Pggt1bQ8BUY9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Pggt1bQ8BUY9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Pggt1bQ8BUY9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Pggt1bQ8BUY9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
Pggt1bQ8BUY9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Pggt1bQ8BUY9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Pggt1bQ8BUY9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Pggt1bQ8BUY9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Pggt1bQ8BUY9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Pggt1bQ8BUY9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Pggt1bQ8BUY9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Pggt1bQ8BUY9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Pggt1bQ8BUY9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Pggt1bQ8BUY9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Pggt1bQ8BUY9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Pggt1bQ8BUY9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Pggt1bQ8BUY9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Pggt1bQ8BUY9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Pggt1bQ8BUY9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Pggt1bQ8BUY9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Pggt1bQ8BUY9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Pggt1bQ8BUY9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Pggt1bQ8BUY9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Pggt1bQ8BUY9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Pggt1bQ8BUY9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Pggt1bQ8BUY9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pggt1bQ8BUY9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pggt1bQ8BUY9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pggt1bQ8BUY9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pggt1bQ8BUY9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pggt1bQ8BUY9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pggt1bQ8BUY9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pggt1bQ8BUY9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Pggt1bQ8BUY9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pggt1bQ8BUY9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pggt1bQ8BUY9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pggt1bQ8BUY9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pggt1bQ8BUY9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Pggt1bQ8BUY9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pggt1bQ8BUY9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pggt1bQ8BUY9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pggt1bQ8BUY9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pggt1bQ8BUY9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pggt1bQ8BUY9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pggt1bQ8BUY9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pggt1bQ8BUY9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pggt1bQ8BUY9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pggt1bQ8BUY9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Pggt1bQ8BUY9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pggt1bQ8BUY9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Pggt1bQ8BUY9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pggt1bQ8BUY9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pggt1bQ8BUY9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pggt1bQ8BUY9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pggt1bQ8BUY9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pggt1bQ8BUY9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pggt1bQ8BUY9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pggt1bQ8BUY9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pggt1bQ8BUY9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pggt1bQ8BUY9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Pggt1bQ8BUY9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pggt1bQ8BUY9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pggt1bQ8BUY9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pggt1bQ8BUY9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pggt1bQ8BUY9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pggt1bQ8BUY9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pggt1bQ8BUY9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Pggt1bQ8BUY9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pggt1bQ8BUY9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pggt1bQ8BUY9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pggt1bQ8BUY9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pggt1bQ8BUY9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pggt1bQ8BUY9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pggt1bQ8BUY9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pggt1bQ8BUY9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pggt1bQ8BUY9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pggt1bQ8BUY9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pggt1bQ8BUY9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pggt1bQ8BUY9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pggt1bQ8BUY9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pggt1bQ8BUY9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pggt1bQ8BUY9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pggt1bQ8BUY9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pggt1bQ8BUY9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pggt1bQ8BUY9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pggt1bQ8BUY9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pggt1bQ8BUY9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pggt1bQ8BUY9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
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