Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Msx2Q03358 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Msx2Q03358 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Msx2Q03358 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Msx2Q03358 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
Msx2Q03358 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Msx2Q03358 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Msx2Q03358 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Msx2Q03358 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Msx2Q03358 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Msx2Q03358 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Msx2Q03358 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Msx2Q03358 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Msx2Q03358 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Msx2Q03358 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Msx2Q03358 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Msx2Q03358 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Msx2Q03358 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Msx2Q03358 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Msx2Q03358 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Msx2Q03358 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Msx2Q03358 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Msx2Q03358 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Msx2Q03358 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Msx2Q03358 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Msx2Q03358 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Msx2Q03358 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Msx2Q03358 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Msx2Q03358 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Msx2Q03358 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Msx2Q03358 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Msx2Q03358 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Msx2Q03358 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Msx2Q03358 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Msx2Q03358 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Msx2Q03358 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Msx2Q03358 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Msx2Q03358 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Msx2Q03358 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Msx2Q03358 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Msx2Q03358 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Msx2Q03358 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Msx2Q03358 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Msx2Q03358 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Msx2Q03358 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Msx2Q03358 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Msx2Q03358 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Msx2Q03358 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Msx2Q03358 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Msx2Q03358 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Msx2Q03358 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Msx2Q03358 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Msx2Q03358 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Msx2Q03358 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Msx2Q03358 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Msx2Q03358 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Msx2Q03358 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Msx2Q03358 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Msx2Q03358 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Msx2Q03358 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Msx2Q03358 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Msx2Q03358 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Msx2Q03358 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Msx2Q03358 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Msx2Q03358 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Msx2Q03358 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Msx2Q03358 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Msx2Q03358 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Msx2Q03358 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Msx2Q03358 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Msx2Q03358 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Msx2Q03358 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Msx2Q03358 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Msx2Q03358 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Msx2Q03358 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Msx2Q03358 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Msx2Q03358 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Msx2Q03358 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Msx2Q03358 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Msx2Q03358 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Msx2Q03358 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Msx2Q03358 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Msx2Q03358 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Msx2Q03358 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Msx2Q03358 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Msx2Q03358 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Msx2Q03358 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Msx2Q03358 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Msx2Q03358 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Msx2Q03358 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Msx2Q03358 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Msx2Q03358 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Msx2Q03358 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Msx2Q03358 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Msx2Q03358 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Msx2Q03358 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Msx2Q03358 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Msx2Q03358 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Msx2Q03358 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Msx2Q03358 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 160.4 ms