Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK8

Lypd3, Ly6/PLAUR domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lypd3Q91YK8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,37■■■□□ 2,93
Lypd3Q91YK8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32,14■■■□□ 2,74
Lypd3Q91YK8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,08■■■□□ 2,73
Lypd3Q91YK8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,01■■■□□ 2,71
Lypd3Q91YK8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31,38■■■□□ 2,61
Lypd3Q91YK8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Lypd3Q91YK8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,96■■■□□ 2,55
Lypd3Q91YK8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Lypd3Q91YK8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Lypd3Q91YK8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Lypd3Q91YK8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Lypd3Q91YK8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Lypd3Q91YK8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Lypd3Q91YK8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Lypd3Q91YK8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Lypd3Q91YK8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Lypd3Q91YK8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29,31■■■□□ 2,28
Lypd3Q91YK8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Lypd3Q91YK8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29,25■■■□□ 2,27
Lypd3Q91YK8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Lypd3Q91YK8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29,01■■■□□ 2,23
Lypd3Q91YK8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Lypd3Q91YK8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Lypd3Q91YK8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Lypd3Q91YK8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Lypd3Q91YK8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28,66■■■□□ 2,18
Lypd3Q91YK8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Lypd3Q91YK8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Lypd3Q91YK8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Lypd3Q91YK8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Lypd3Q91YK8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,49■■■□□ 2,15
Lypd3Q91YK8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Lypd3Q91YK8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Lypd3Q91YK8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28,33■■■□□ 2,13
Lypd3Q91YK8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Lypd3Q91YK8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Lypd3Q91YK8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,21■■■□□ 2,11
Lypd3Q91YK8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Lypd3Q91YK8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Lypd3Q91YK8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Lypd3Q91YK8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28,1■■■□□ 2,09
Lypd3Q91YK8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Lypd3Q91YK8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28■■■□□ 2,07
Lypd3Q91YK8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,07
Lypd3Q91YK8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Lypd3Q91YK8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Lypd3Q91YK8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Lypd3Q91YK8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Lypd3Q91YK8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Lypd3Q91YK8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Lypd3Q91YK8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Lypd3Q91YK8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,65■■■□□ 2,02
Lypd3Q91YK8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,63■■■□□ 2,01
Lypd3Q91YK8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Lypd3Q91YK8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27,49■■□□□ 1,99
Lypd3Q91YK8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,46■■□□□ 1,99
Lypd3Q91YK8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,99
Lypd3Q91YK8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Lypd3Q91YK8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Lypd3Q91YK8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Lypd3Q91YK8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Lypd3Q91YK8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Lypd3Q91YK8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,15■■□□□ 1,94
Lypd3Q91YK8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Lypd3Q91YK8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Lypd3Q91YK8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Lypd3Q91YK8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27,02■■□□□ 1,92
Lypd3Q91YK8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Lypd3Q91YK8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Lypd3Q91YK8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Lypd3Q91YK8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,91
Lypd3Q91YK8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,93■■□□□ 1,9
Lypd3Q91YK8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Lypd3Q91YK8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,89
Lypd3Q91YK8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26,86■■□□□ 1,89
Lypd3Q91YK8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Lypd3Q91YK8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26,81■■□□□ 1,88
Lypd3Q91YK8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Lypd3Q91YK8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Lypd3Q91YK8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Lypd3Q91YK8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Lypd3Q91YK8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Lypd3Q91YK8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Lypd3Q91YK8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26,7■■□□□ 1,86
Lypd3Q91YK8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Lypd3Q91YK8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Lypd3Q91YK8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26,57■■□□□ 1,84
Lypd3Q91YK8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Lypd3Q91YK8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26,54■■□□□ 1,84
Lypd3Q91YK8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26,52■■□□□ 1,84
Lypd3Q91YK8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26,49■■□□□ 1,83
Lypd3Q91YK8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Lypd3Q91YK8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,48■■□□□ 1,83
Lypd3Q91YK8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Lypd3Q91YK8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Lypd3Q91YK8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Lypd3Q91YK8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Lypd3Q91YK8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,38■■□□□ 1,81
Lypd3Q91YK8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Lypd3Q91YK8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38,2 ms