Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK8

Lypd3, Ly6/PLAUR domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lypd3Q91YK8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Lypd3Q91YK8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Lypd3Q91YK8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Lypd3Q91YK8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Lypd3Q91YK8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
Lypd3Q91YK8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Lypd3Q91YK8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Lypd3Q91YK8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Lypd3Q91YK8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Lypd3Q91YK8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Lypd3Q91YK8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Lypd3Q91YK8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Lypd3Q91YK8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Lypd3Q91YK8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Lypd3Q91YK8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Lypd3Q91YK8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lypd3Q91YK8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Lypd3Q91YK8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lypd3Q91YK8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lypd3Q91YK8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Lypd3Q91YK8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Lypd3Q91YK8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lypd3Q91YK8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lypd3Q91YK8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lypd3Q91YK8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lypd3Q91YK8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Lypd3Q91YK8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Lypd3Q91YK8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lypd3Q91YK8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lypd3Q91YK8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lypd3Q91YK8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lypd3Q91YK8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lypd3Q91YK8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lypd3Q91YK8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Lypd3Q91YK8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lypd3Q91YK8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lypd3Q91YK8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lypd3Q91YK8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lypd3Q91YK8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lypd3Q91YK8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lypd3Q91YK8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Lypd3Q91YK8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lypd3Q91YK8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Lypd3Q91YK8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Lypd3Q91YK8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lypd3Q91YK8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lypd3Q91YK8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lypd3Q91YK8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lypd3Q91YK8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lypd3Q91YK8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lypd3Q91YK8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lypd3Q91YK8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lypd3Q91YK8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lypd3Q91YK8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lypd3Q91YK8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Lypd3Q91YK8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lypd3Q91YK8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Lypd3Q91YK8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lypd3Q91YK8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lypd3Q91YK8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lypd3Q91YK8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lypd3Q91YK8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lypd3Q91YK8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Lypd3Q91YK8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lypd3Q91YK8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lypd3Q91YK8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lypd3Q91YK8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lypd3Q91YK8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lypd3Q91YK8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lypd3Q91YK8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lypd3Q91YK8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Lypd3Q91YK8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lypd3Q91YK8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lypd3Q91YK8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Lypd3Q91YK8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Lypd3Q91YK8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lypd3Q91YK8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lypd3Q91YK8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lypd3Q91YK8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lypd3Q91YK8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lypd3Q91YK8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lypd3Q91YK8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lypd3Q91YK8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lypd3Q91YK8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Lypd3Q91YK8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lypd3Q91YK8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lypd3Q91YK8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lypd3Q91YK8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lypd3Q91YK8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lypd3Q91YK8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lypd3Q91YK8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lypd3Q91YK8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lypd3Q91YK8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lypd3Q91YK8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lypd3Q91YK8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lypd3Q91YK8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lypd3Q91YK8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lypd3Q91YK8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lypd3Q91YK8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lypd3Q91YK8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms