Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHH5

Agap3, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Agap3Q8VHH5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37,09■■■■□ 3,53
Agap3Q8VHH5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,86■■■■□ 3,17
Agap3Q8VHH5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Agap3Q8VHH5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Agap3Q8VHH5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,63■■■□□ 2,97
Agap3Q8VHH5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,63■■■□□ 2,97
Agap3Q8VHH5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32,93■■■□□ 2,86
Agap3Q8VHH5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,41■■■□□ 2,78
Agap3Q8VHH5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32,39■■■□□ 2,78
Agap3Q8VHH5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32,3■■■□□ 2,76
Agap3Q8VHH5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31,89■■■□□ 2,7
Agap3Q8VHH5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,84■■■□□ 2,69
Agap3Q8VHH5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,75■■■□□ 2,67
Agap3Q8VHH5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31,74■■■□□ 2,67
Agap3Q8VHH5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,65
Agap3Q8VHH5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,26■■■□□ 2,59
Agap3Q8VHH5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
Agap3Q8VHH5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Agap3Q8VHH5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Agap3Q8VHH5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
Agap3Q8VHH5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
Agap3Q8VHH5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,1■■■□□ 2,57
Agap3Q8VHH5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,07■■■□□ 2,56
Agap3Q8VHH5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31,04■■■□□ 2,56
Agap3Q8VHH5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Agap3Q8VHH5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
Agap3Q8VHH5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30,92■■■□□ 2,54
Agap3Q8VHH5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,54
Agap3Q8VHH5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,85■■■□□ 2,53
Agap3Q8VHH5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30,84■■■□□ 2,53
Agap3Q8VHH5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Agap3Q8VHH5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
Agap3Q8VHH5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30,54■■■□□ 2,48
Agap3Q8VHH5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,53■■■□□ 2,48
Agap3Q8VHH5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,47
Agap3Q8VHH5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Agap3Q8VHH5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30,28■■■□□ 2,44
Agap3Q8VHH5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30,28■■■□□ 2,44
Agap3Q8VHH5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Agap3Q8VHH5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Agap3Q8VHH5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Agap3Q8VHH5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29,96■■■□□ 2,39
Agap3Q8VHH5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Agap3Q8VHH5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29,79■■■□□ 2,36
Agap3Q8VHH5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29,72■■■□□ 2,35
Agap3Q8VHH5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,35
Agap3Q8VHH5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Agap3Q8VHH5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Agap3Q8VHH5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29,6■■■□□ 2,33
Agap3Q8VHH5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29,51■■■□□ 2,31
Agap3Q8VHH5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,3
Agap3Q8VHH5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Agap3Q8VHH5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Agap3Q8VHH5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Agap3Q8VHH5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,28
Agap3Q8VHH5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Agap3Q8VHH5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Agap3Q8VHH5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,15■■■□□ 2,26
Agap3Q8VHH5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29,14■■■□□ 2,26
Agap3Q8VHH5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,25
Agap3Q8VHH5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Agap3Q8VHH5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29,11■■■□□ 2,25
Agap3Q8VHH5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Agap3Q8VHH5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Agap3Q8VHH5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29,02■■■□□ 2,24
Agap3Q8VHH5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,02■■■□□ 2,24
Agap3Q8VHH5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Agap3Q8VHH5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29,01■■■□□ 2,23
Agap3Q8VHH5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,01■■■□□ 2,23
Agap3Q8VHH5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28,99■■■□□ 2,23
Agap3Q8VHH5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28,95■■■□□ 2,23
Agap3Q8VHH5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28,95■■■□□ 2,22
Agap3Q8VHH5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Agap3Q8VHH5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Agap3Q8VHH5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Agap3Q8VHH5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28,75■■■□□ 2,19
Agap3Q8VHH5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Agap3Q8VHH5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,62■■■□□ 2,17
Agap3Q8VHH5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Agap3Q8VHH5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Agap3Q8VHH5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,52■■■□□ 2,16
Agap3Q8VHH5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Agap3Q8VHH5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,51■■■□□ 2,15
Agap3Q8VHH5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Agap3Q8VHH5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Agap3Q8VHH5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Agap3Q8VHH5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Agap3Q8VHH5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Agap3Q8VHH5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Agap3Q8VHH5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Agap3Q8VHH5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28,35■■■□□ 2,13
Agap3Q8VHH5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28,34■■■□□ 2,13
Agap3Q8VHH5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Agap3Q8VHH5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Agap3Q8VHH5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Agap3Q8VHH5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Agap3Q8VHH5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28,25■■■□□ 2,11
Agap3Q8VHH5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,23■■■□□ 2,11
Agap3Q8VHH5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Agap3Q8VHH5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52,4 ms