RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324685.10

RNF40-201, Transcript of ring finger protein 40, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RNF40, Length 5,634 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40-201ENST00000324685 PDE9AO76083 593 aa21.48■■□□□ 1.03
RNF40-201ENST00000324685 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
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RNF40-201ENST00000324685 RPL21P46778 160 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
RNF40-201ENST00000324685 CDK16Q00536 496 aa21.48■■□□□ 1.03
RNF40-201ENST00000324685 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
RNF40-201ENST00000324685 C16orf62Q7Z3J2 963 aa21.48■■□□□ 1.03
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RNF40-201ENST00000324685 TAS2R13Q9NYV9 303 aa21.48■■□□□ 1.03
RNF40-201ENST00000324685 SH3BP4Q9P0V3 963 aa21.48■■□□□ 1.03
RNF40-201ENST00000324685 ABCA6Q8N139 1617 aa21.48■■□□□ 1.03
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RNF40-201ENST00000324685 ARMC3Q5W041 872 aa21.48■■□□□ 1.03
RNF40-201ENST00000324685 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa21.48■■□□□ 1.03
RNF40-201ENST00000324685 FBXO44Q9H4M3 255 aa21.48■■□□□ 1.03
RNF40-201ENST00000324685 GDF3Q9NR23 364 aa21.48■■□□□ 1.03
RNF40-201ENST00000324685 HS6ST1O60243 411 aa21.48■■□□□ 1.03
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RNF40-201ENST00000324685 MGAT1P26572 445 aa21.48■■□□□ 1.03
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RNF40-201ENST00000324685 CBWD5Q5RIA9 395 aa21.48■■□□□ 1.03
RNF40-201ENST00000324685 TXNRD3Q86VQ6 643 aa21.48■■□□□ 1.03
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RNF40-201ENST00000324685 PIK3CGP48736 1102 aa21.47■■□□□ 1.03
RNF40-201ENST00000324685 XRCC4Q13426 336 aa21.47■■□□□ 1.03
RNF40-201ENST00000324685 MED8Q96G25 268 aa21.47■■□□□ 1.03
RNF40-201ENST00000324685 SYT15Q9BQS2 421 aa21.47■■□□□ 1.03
RNF40-201ENST00000324685 A0A096LPK6 155 aa21.47■■□□□ 1.03
RNF40-201ENST00000324685 KPNA6O60684 536 aa21.47■■□□□ 1.03
RNF40-201ENST00000324685 MYL12AP19105 171 aa21.47■■□□□ 1.03
RNF40-201ENST00000324685 BACE1P56817 501 aa21.47■■□□□ 1.03
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RNF40-201ENST00000324685 KRT77Q7Z794 578 aa21.47■■□□□ 1.03
RNF40-201ENST00000324685 NT5DC3Q86UY8 548 aa21.47■■□□□ 1.03
RNF40-201ENST00000324685 SLC25A23Q9BV35 468 aa21.47■■□□□ 1.03
RNF40-201ENST00000324685 TSPAN16Q9UKR8 245 aa21.47■■□□□ 1.03
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RNF40-201ENST00000324685 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.032e-6■■■■■ 90.2
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RNF40-201ENST00000324685 ZNF844Q08AG5 666 aa21.47■■□□□ 1.03
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RNF40-201ENST00000324685 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa21.47■■□□□ 1.03
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RNF40-201ENST00000324685 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
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RNF40-201ENST00000324685 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
RNF40-201ENST00000324685 DNERQ8NFT8 737 aa21.46■■□□□ 1.03
RNF40-201ENST00000324685 ZDHHC15Q96MV8 337 aa21.46■■□□□ 1.03
RNF40-201ENST00000324685 H7C0S8 307 aa21.46■■□□□ 1.03
RNF40-201ENST00000324685 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
RNF40-201ENST00000324685 PARNO95453 639 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
RNF40-201ENST00000324685 HPCAL1P37235 193 aa21.46■■□□□ 1.03
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