RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 LDLRP01130 860 aa21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 SLC2A4P14672 509 aa21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 AXLP30530 894 aa21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 MLH1P40692 756 aa21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 GRIK4Q16099 956 aa21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF470Q6ECI4 717 aa21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 FAM45BPQ6NSW5 357 aa21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 SLC30A10Q6XR72 485 aa21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 SMARCD1Q96GM5 515 aa21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 GGA2Q9UJY4 613 aa21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 MT-CO1P00395 513 aa21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 TFRCP02786 760 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 IRGCQ6NXR0 463 aa21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 MIER2Q8N344 545 aa21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 SERPINB11Q96P15 392 aa21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 CEP41Q9BYV8 373 aa21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 CBX6O95503 412 aa21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 POU1F1P28069 291 aa21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 ARMCX4Q5H9R4 360 aa21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 EDEM1Q92611 657 aa21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa21.6■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 VAPBO95292 243 aa21.59■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 KDELR1P24390 212 aa21.59■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 DEFB106AQ8N104 65 aa21.59■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 OR6Y1Q8NGX8 325 aa21.59■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 RAD51BO15315 384 aa21.59■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 DRG2P55039 364 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 TBX4P57082 545 aa21.59■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 TTMPQ5BVD1 217 aa21.59■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 TNS2Q63HR2 1409 aa21.59■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 RAG1P15918 1043 aa21.59■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 GRK3P35626 688 aa21.59■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 C1DQ13901 141 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF410Q86VK4 478 aa21.59■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 OR56A4Q8NGH8 313 aa21.59■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 CYP39A1Q9NYL5 469 aa21.59■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 CHADO15335 359 aa21.59■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 CLOCKO15516 846 aa21.59■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 VCLP18206 1134 aa21.59■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGAP17Q68EM7 881 aa21.59■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC55Q6ZSA7 311 aa21.59■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM48Q8IWZ4 208 aa21.59■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 SCUBE3Q8IX30 993 aa21.59■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 SNX3O60493 162 aa21.58■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 IL5RAQ01344 420 aa21.58■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 SNX32Q86XE0 403 aa21.58■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 SH3GL2Q99962 352 aa21.58■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 KCNMB3Q9NPA1 279 aa21.58■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 SETD4Q9NVD3 440 aa21.58■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 KANSL3Q9P2N6 904 aa21.58■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 LACTBL1A8MY62 500 aa21.58■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 KCNK1O00180 336 aa21.58■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 INPP4BO15327 924 aa21.58■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 CXCL9Q07325 125 aa21.58■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 BFSP2Q13515 415 aa21.58■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 LY6KQ17RY6 165 aa21.58■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 POU5F2Q8N7G0 328 aa21.58■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 MID1IP1Q9NPA3 183 aa21.58■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa21.58■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 F8VP50 259 aa21.58■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 DCXO43602 365 aa21.58■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 CYP1A2P05177 515 aa21.58■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 TSHRP16473 764 aa21.58■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 RBL1P28749 1068 aa21.58■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 PARP6Q2NL67 630 aa21.58■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 LPCAT1Q8NF37 534 aa21.58■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 SEPHS2Q99611 448 aa21.58■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 VTA1Q9NP79 307 aa21.58■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 ARMCX1Q9P291 453 aa21.58■■□□□ 1.05
CCSAP-201ENST00000284617 ENDOD1O94919 500 aa21.58■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 TUBP50607 506 aa21.58■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 PPP3CAQ08209 521 aa21.58■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 EID3Q8N140 333 aa21.58■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 DLG3Q92796 817 aa21.58■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 CASTOR2A6NHX0 329 aa21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 CDH8P55286 799 aa21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM134Q9H6X4 195 aa21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD63C9JTQ0 380 aa21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 KLRC4O43908 158 aa21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 URODP06132 367 aa21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 MIIPQ5JXC2 388 aa21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 TMC7Q7Z402 723 aa21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 C11orf74Q86VG3 221 aa21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 SVOPQ8N4V2 548 aa21.57■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 FNDC5Q8NAU1 212 aa21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms