RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 URB1O60287 2271 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 CTSKP43235 329 aa28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 TKTL1P51854 596 aa28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 ZBTB16Q05516 673 aa28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP3CAQ08209 521 aa28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 AHI1Q8N157 1196 aa28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 RNF139Q8WU17 664 aa28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 PAGE5Q96GU1 130 aa28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 SGK2Q9HBY8 427 aa28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 PRSS16Q9NQE7 514 aa28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 ZBED1O96006 694 aa28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 SLFN14P0C7P3 912 aa28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 NR2F2P24468 414 aa28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNT1Q5JUK3 1230 aa28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 ULBP1Q9BZM6 244 aa28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 RAB41Q5JT25 222 aa28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 MBLAC2Q68D91 279 aa28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 TMPRSS12Q86WS5 348 aa28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM186BQ8IYM0 893 aa28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 GOLGA1Q92805 767 aa28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 NXPE2Q96DL1 559 aa28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM176AQ96HP8 235 aa28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 UBXN6Q9BZV1 441 aa28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 E9PAM4 449 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 DFNA5O60443 496 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 DLDP09622 509 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 JUPP14923 745 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 HNF1BP35680 557 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF445P59923 1031 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 KIAA0895LQ68EN5 471 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 ADIPOR2Q86V24 386 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 GATAD2AQ86YP4 633 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 TTC39CQ8N584 583 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC4A11Q8NBS3 891 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 EDEM1Q92611 657 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRC4Q9HBW1 653 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 CISHQ9NSE2 258 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 SUN2Q9UH99 717 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 CKAP5Q14008 2032 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 MAPK13O15264 365 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 PRB1P04280 392 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 PDE4CQ08493 712 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 C19orf57Q0VDD7 668 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 C6orf118Q5T5N4 469 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 ADAM32Q8TC27 787 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 SKA1Q96BD8 255 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC6A18Q96N87 628 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM8AQ9HCN3 771 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-217ENST00000629983 ENC1O14682 589 aa28.51■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 ABCB4P21439 1286 aa28.51■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 CLDN6P56747 220 aa28.51■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa28.51■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP28.51■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKRD52Q8NB46 1076 aa28.51■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 MTG2Q9H4K7 406 aa28.51■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1B0GTQ1 180 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 MSI1O43347 362 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHV4-34P06331 123 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 ITGAVP06756 1048 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 RAD23BP54727 409 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 ST8SIA6P61647 398 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 RACK1P63244 317 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 SEMG2Q02383 582 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 ADGRF1Q5T601 910 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 ARHGAP17Q68EM7 881 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 KRT39Q6A163 491 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 FBXL12Q9NXK8 326 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 AK5Q9Y6K8 562 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 CBX4O00257 560 aa28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 TULP2O00295 520 aa28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-217ENST00000629983 VILLO15195 856 aa28.49■■■□□ 2.15
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