RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533897.1

CTSC-208, Transcript of cathepsin C, human

TSL 2

Gene CTSC, Length 4,344 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSC-208	ENST00000533897	SOX13	Q9UN79	622 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	COPE	O14579	308 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	FYN	P06241	537 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	GMPR	P36959	345 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	NDST1	P52848	882 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	DSG1	Q02413	1049 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	RCN2	Q14257	317 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	BOLA3	Q53S33	107 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	PIGG	Q5H8A4	983 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	PLD6	Q8N2A8	252 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	PELI3	Q8N2H9	469 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	NME8	Q8N427	588 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	CCDC185	Q8N715	623 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	RNF169	Q8NCN4	708 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ACVR1C	Q8NER5	493 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	HSPH1	Q92598	858 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	COPG2	Q9UBF2	871 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	POMP	Q9Y244	141 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	TPP1	O14773	563 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	CLGN	O14967	610 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	KCNN4	O15554	427 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	TSPAN1	O60635	241 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ITGB3	P05106	788 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	STAG3L1	P0CL83	205 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	SETSIP	P0DME0	302 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	SERPINB9	P50453	376 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	CDH6	P55285	790 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	DEUP1	Q05D60	604 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ARHGAP1	Q07960	439 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	TNFAIP1	Q13829	316 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	TFDP2	Q14188	446 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	TRIM50	Q86XT4	487 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	LILRA2	Q8N149	483 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	C12orf29	Q8N999	325 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	FAM167A	Q96KS9	214 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	MRM3	Q9HC36	420 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	TMEM216	Q9P0N5	145 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	DERA	Q9Y315	318 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	COL1A2	P08123	1366 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ENO4	A6NNW6	628 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	HACD1	B0YJ81	288 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	APOL1	O14791	398 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	PPEF2	O14830	753 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	SLC22A2	O15244	555 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	GRID2	O43424	1007 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	TFAP2A	P05549	437 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	NEFH	P12036	1026 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	UQCRB	P14927	111 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	CYP2F1	P24903	491 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	CPA2	P48052	419 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	SLC1A6	P48664	564 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	SLC26A2	P50443	739 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	AQP4	P55087	323 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	DLG1	Q12959	904 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	PTK2B	Q14289	1009 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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