RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438005.1

MTND5P28-201, Transcript of MT-ND5 pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene MTND5P28, Length 1,594 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTND5P28-201ENST00000438005 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa4.51□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 PDE7BQ9NP56 450 aa4.51□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa4.51□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 SERTAD3Q9UJW9 196 aa4.51□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 SNX5Q9Y5X3 404 aa4.51□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 UBE2CO00762 179 aa4.5□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 FFAR3O14843 346 aa4.5□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 VNN1O95497 513 aa4.5□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 URODP06132 367 aa4.5□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 ITGALP20701 1170 aa4.5□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 HMGA2P52926 109 aa4.5□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 PPP5CP53041 499 aa4.5□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 RPL15P61313 204 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 UFM1P61960 85 aa4.5□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 BFSP2Q13515 415 aa4.5□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 SCARB2Q14108 478 aa4.5□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 ASIC2Q16515 512 aa4.5□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 ZNF766Q5HY98 468 aa4.5□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 C1orf141Q5JVX7 400 aa4.5□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 METRNLQ641Q3 311 aa4.5□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa4.5□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 ULK2Q8IYT8 1036 aa4.5□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 ABRAQ8N0Z2 381 aa4.5□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 SCML4Q8N228 414 aa4.5□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 KLHL36Q8N4N3 616 aa4.5□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 CLEC4CQ8WTT0 213 aa4.5□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 ATRIPQ8WXE1 791 aa4.5□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 RNFT2Q96EX2 444 aa4.5□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 PNKPQ96T60 521 aa4.5□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 EYA3Q99504 573 aa4.5□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 HTATIP2Q9BUP3 242 aa4.5□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa4.5□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 NDST4Q9H3R1 872 aa4.5□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa4.5□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 KCND2Q9NZV8 630 aa4.5□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 SLC12A4Q9UP95 1085 aa4.5□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa4.5□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 UNC13AQ9UPW8 1703 aa4.5□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa4.5□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa4.49□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa4.49□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 TBC1D3EA0A087X179 549 aa4.49□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa4.49□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 TBC1D3BA6NDS4 549 aa4.49□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 LIPT2A6NK58 231 aa4.49□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 ZAR1LA6NP61 321 aa4.49□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 TBC1D3LB9A6J9 549 aa4.49□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 OVOL3O00110 214 aa4.49□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 WDR47O94967 919 aa4.49□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 CCNDBP1O95273 360 aa4.49□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 TBC1D3HP0C7X1 549 aa4.49□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 LYL1P12980 280 aa4.49□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 TNFRSF1AP19438 455 aa4.49□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 EPHA3P29320 983 aa4.49□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 PPIFP30405 207 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 BSGP35613 385 aa4.49□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 PSMB10P40306 273 aa4.49□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 RCAN1P53805 252 aa4.49□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 TIRAPP58753 221 aa4.49□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 PLIN5Q00G26 463 aa4.49□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 SEMA3BQ13214 749 aa4.49□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 PPP2R5CQ13362 524 aa4.49□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 NAA25Q14CX7 972 aa4.49□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa4.49□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa4.49□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 GRHL2Q6ISB3 625 aa4.49□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 C16orf89Q6UX73 402 aa4.49□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 MON1AQ86VX9 555 aa4.49□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 Q8NFD4 153 aa4.49□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 RFWD2Q8NHY2 731 aa4.49□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 ST8SIA2Q92186 375 aa4.49□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 VN1R3Q9BXE9 311 aa4.49□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 CTDSP1Q9GZU7 261 aa4.49□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 GRPEL1Q9HAV7 217 aa4.49□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 FBXO28Q9NVF7 368 aa4.49□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 ALKBH4Q9NXW9 302 aa4.49□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 CD207Q9UJ71 328 aa4.49□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 KCNE2Q9Y6J6 123 aa4.49□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 PMS2P1A4D2B8 440 aa4.48□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 GAGE10A6NGK3 116 aa4.48□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 SMTNL1A8MU46 457 aa4.48□□□□□ -1.69
MTND5P28-201ENST00000438005 TMEM232C9JQI7 657 aa4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms