RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001226.9

Sh3bp1-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Acbd6Q9D061 282 aa17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 HnrnpcQ9Z204 313 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Smok3cA0A087WSF2 504 aa17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 NoctO35710 429 aa17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 ChgbP16014 677 aa17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 CblP22682 913 aa17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Crhr1P35347 415 aa17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fen1P39749 378 aa17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Scg3P47867 471 aa17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kcnj6P48542 425 aa17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Morf4l1P60762 362 aa17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfm3P63056 478 aa17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm1587Q3UT80 123 aa17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Icam5Q60625 917 aa17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gigyf2Q6Y7W8 1291 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ahcyl1Q80SW1 530 aa17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Glra3Q91XP5 464 aa17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ndufaf1Q9CWX2 328 aa17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fam90a1bQ9D4F3 419 aa17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Serpinb9bQ9DAV6 377 aa17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ap2b1Q9DBG3 937 aa17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 St6galnac4Q9R2B6 360 aa17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cpxm1Q9Z100 722 aa17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mindy4b-psA0A1W2P7H6 457 aa17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 SprtnG3X912 497 aa17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc1a6O35544 561 aa17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Adam15O88839 864 aa17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lmo2P25801 158 aa17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PolgP54099 1218 aa17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 NrlP54846 237 aa17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dsc2P55292 902 aa17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lpar1P61793 364 aa17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pou2f2Q00196 463 aa17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 RalgdsQ03385 852 aa17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Wee2Q66JT0 555 aa17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sez6lQ6P1D5 963 aa17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pcmtd2Q8BHD8 359 aa17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fbxw21Q8BI38 468 aa17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mettl24Q8CCB5 363 aa17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Q8R1Y2 203 aa17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Clptm1Q8VBZ3 664 aa17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tbc1d20Q9D9I4 402 aa17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Neu2Q9JMH3 379 aa17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tmem115Q9WUH1 350 aa17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tmem131O70472 1877 aa17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mageb4A2A9R3 556 aa17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Adamts6D3Z1A5 1117 aa17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 C87414E9PWI7 475 aa17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm4302E9PX25 294 aa17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ebf3O08791 596 aa17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Abcb1bP06795 1276 aa17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tgfb2P27090 414 aa17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tbxas1P36423 533 aa17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Oaz1P54369 227 aa17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Il6stQ00560 917 aa17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 HmgcrQ01237 887 aa17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 1810049J17RikQ3V2G9 153 aa17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dedd2Q8QZV0 330 aa17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc23a1Q9Z2J0 605 aa17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Daw1D3Z7A5 415 aa17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Atp5bP56480 529 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Grid2ipQ0QWG9 1203 aa17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lrrc74bQ14BP6 391 aa17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Meaf6Q2VPQ9 191 aa17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nek10Q3UGM2 1111 aa17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 EfsQ64355 560 aa17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zfp943Q6NZP4 507 aa17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Clec4b1Q7TS58 209 aa17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ephb1Q8CBF3 984 aa17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rasgrp2Q9QUG9 608 aa17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Myo18aQ9JMH9 2050 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fibcd1A2AV25 459 aa17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vmn2r87E9PZX4 848 aa17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gjd2O54851 321 aa17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 AlbP07724 608 aa17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Wnt3aP27467 352 aa17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 LdlrP35951 862 aa17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fermt1P59113 677 aa17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 UtyP79457 1212 aa17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Samd11Q1RNF8 542 aa17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Atxn7l3bQ3UD01 97 aa17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Srbd1Q497V5 1015 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Xkr4Q5GH67 647 aa17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc5a10Q5SWY8 596 aa17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cln3Q61124 438 aa17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Trpv1Q704Y3 839 aa17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Aste1Q8BIR2 672 aa17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Brat1Q8C3R1 822 aa17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rnh1Q91VI7 456 aa17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Snx15Q91WE1 337 aa17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pcdhb4Q91XZ6 784 aa17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pgam1Q9DBJ1 254 aa17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 ThadaA8C756 1938 aa17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Myo16Q5DU14 1919 aa17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zbed6D2EAC2 980 aa17.52■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nedd9O35177 833 aa17.52■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Acot1O55137 419 aa17.52■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccnd3P30282 292 aa17.52■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Emilin3P59900 758 aa17.52■□□□□ 0.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ikzf1Q03267 517 aa17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 38.1 ms