Protein–RNA interactions for Protein: P55292

Dsc2, Desmocollin-2, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsc2P55292 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
Dsc2P55292 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Dsc2P55292 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Dsc2P55292 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Dsc2P55292 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Dsc2P55292 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Dsc2P55292 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Dsc2P55292 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Dsc2P55292 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Dsc2P55292 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Dsc2P55292 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Dsc2P55292 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Dsc2P55292 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Dsc2P55292 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Dsc2P55292 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Dsc2P55292 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Dsc2P55292 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Dsc2P55292 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Dsc2P55292 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Dsc2P55292 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Dsc2P55292 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Dsc2P55292 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Dsc2P55292 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Dsc2P55292 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Dsc2P55292 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Dsc2P55292 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Dsc2P55292 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Dsc2P55292 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Dsc2P55292 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Dsc2P55292 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Dsc2P55292 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Dsc2P55292 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Dsc2P55292 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Dsc2P55292 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Dsc2P55292 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Dsc2P55292 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Dsc2P55292 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Dsc2P55292 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Dsc2P55292 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Dsc2P55292 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Dsc2P55292 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Dsc2P55292 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Dsc2P55292 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Dsc2P55292 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Dsc2P55292 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Dsc2P55292 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Dsc2P55292 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Dsc2P55292 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Dsc2P55292 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Dsc2P55292 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Dsc2P55292 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Dsc2P55292 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Dsc2P55292 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Dsc2P55292 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Dsc2P55292 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Dsc2P55292 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Dsc2P55292 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Dsc2P55292 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Dsc2P55292 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Dsc2P55292 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Dsc2P55292 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Dsc2P55292 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Dsc2P55292 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Dsc2P55292 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Dsc2P55292 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Dsc2P55292 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Dsc2P55292 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Dsc2P55292 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Dsc2P55292 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Dsc2P55292 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Dsc2P55292 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Dsc2P55292 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Dsc2P55292 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Dsc2P55292 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Dsc2P55292 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Dsc2P55292 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Dsc2P55292 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Dsc2P55292 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Dsc2P55292 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Dsc2P55292 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Dsc2P55292 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Dsc2P55292 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Dsc2P55292 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Dsc2P55292 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Dsc2P55292 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Dsc2P55292 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Dsc2P55292 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Dsc2P55292 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Dsc2P55292 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Dsc2P55292 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Dsc2P55292 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Dsc2P55292 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Dsc2P55292 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Dsc2P55292 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Dsc2P55292 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Dsc2P55292 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Dsc2P55292 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Dsc2P55292 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Dsc2P55292 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Dsc2P55292 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 335.8 ms