Protein–RNA interactions for Protein: O54851

Gjd2, Gap junction delta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd2O54851 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC44.79■■■■■ 4.76
Gjd2O54851 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
Gjd2O54851 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
Gjd2O54851 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
Gjd2O54851 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
Gjd2O54851 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC38■■■■□ 3.67
Gjd2O54851 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Gjd2O54851 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Gjd2O54851 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Gjd2O54851 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
Gjd2O54851 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Gjd2O54851 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Gjd2O54851 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Gjd2O54851 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
Gjd2O54851 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Gjd2O54851 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Gjd2O54851 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Gjd2O54851 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Gjd2O54851 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Gjd2O54851 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Gjd2O54851 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Gjd2O54851 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Gjd2O54851 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Gjd2O54851 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Gjd2O54851 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
Gjd2O54851 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Gjd2O54851 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
Gjd2O54851 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Gjd2O54851 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Gjd2O54851 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Gjd2O54851 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Gjd2O54851 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Gjd2O54851 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
Gjd2O54851 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Gjd2O54851 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Gjd2O54851 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Gjd2O54851 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Gjd2O54851 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Gjd2O54851 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Gjd2O54851 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Gjd2O54851 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Gjd2O54851 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Gjd2O54851 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Gjd2O54851 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Gjd2O54851 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Gjd2O54851 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Gjd2O54851 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Gjd2O54851 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Gjd2O54851 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Gjd2O54851 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Gjd2O54851 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Gjd2O54851 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Gjd2O54851 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Gjd2O54851 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Gjd2O54851 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Gjd2O54851 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Gjd2O54851 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Gjd2O54851 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Gjd2O54851 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Gjd2O54851 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Gjd2O54851 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Gjd2O54851 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Gjd2O54851 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Gjd2O54851 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Gjd2O54851 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Gjd2O54851 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Gjd2O54851 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Gjd2O54851 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Gjd2O54851 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Gjd2O54851 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Gjd2O54851 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Gjd2O54851 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Gjd2O54851 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Gjd2O54851 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Gjd2O54851 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Gjd2O54851 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Gjd2O54851 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Gjd2O54851 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Gjd2O54851 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Gjd2O54851 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Gjd2O54851 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Gjd2O54851 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Gjd2O54851 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Gjd2O54851 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Gjd2O54851 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Gjd2O54851 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Gjd2O54851 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Gjd2O54851 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Gjd2O54851 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Gjd2O54851 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Gjd2O54851 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Gjd2O54851 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Gjd2O54851 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Gjd2O54851 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Gjd2O54851 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Gjd2O54851 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Gjd2O54851 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Gjd2O54851 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Gjd2O54851 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Gjd2O54851 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms