Protein–RNA interactions for Protein: O54851

Gjd2, Gap junction delta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd2O54851 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC44,79■■■■■ 4,76
Gjd2O54851 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC41,52■■■■■ 4,24
Gjd2O54851 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,9■■■■■ 4,14
Gjd2O54851 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38,97■■■■□ 3,83
Gjd2O54851 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38,84■■■■□ 3,81
Gjd2O54851 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC38■■■■□ 3,67
Gjd2O54851 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,84■■■■□ 3,65
Gjd2O54851 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,76■■■■□ 3,64
Gjd2O54851 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37,58■■■■□ 3,61
Gjd2O54851 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37,32■■■■□ 3,56
Gjd2O54851 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,18■■■■□ 3,54
Gjd2O54851 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3,51
Gjd2O54851 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,57■■■■□ 3,44
Gjd2O54851 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36,41■■■■□ 3,42
Gjd2O54851 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,35■■■■□ 3,41
Gjd2O54851 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36,12■■■■□ 3,37
Gjd2O54851 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35,99■■■■□ 3,35
Gjd2O54851 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35,96■■■■□ 3,35
Gjd2O54851 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,93■■■■□ 3,34
Gjd2O54851 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,88■■■■□ 3,33
Gjd2O54851 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,62■■■■□ 3,29
Gjd2O54851 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,59■■■■□ 3,29
Gjd2O54851 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,56■■■■□ 3,28
Gjd2O54851 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,51■■■■□ 3,28
Gjd2O54851 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC35,49■■■■□ 3,27
Gjd2O54851 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC35,41■■■■□ 3,26
Gjd2O54851 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35,38■■■■□ 3,25
Gjd2O54851 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,38■■■■□ 3,25
Gjd2O54851 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,31■■■■□ 3,24
Gjd2O54851 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,14■■■■□ 3,22
Gjd2O54851 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3,19
Gjd2O54851 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,96■■■■□ 3,19
Gjd2O54851 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34,76■■■■□ 3,15
Gjd2O54851 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34,71■■■■□ 3,15
Gjd2O54851 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,56■■■■□ 3,12
Gjd2O54851 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34,48■■■■□ 3,11
Gjd2O54851 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,4■■■■□ 3,1
Gjd2O54851 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,38■■■■□ 3,09
Gjd2O54851 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34,38■■■■□ 3,09
Gjd2O54851 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,31■■■■□ 3,08
Gjd2O54851 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34,29■■■■□ 3,08
Gjd2O54851 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,21■■■■□ 3,07
Gjd2O54851 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34,05■■■■□ 3,04
Gjd2O54851 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34,05■■■■□ 3,04
Gjd2O54851 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33,99■■■■□ 3,03
Gjd2O54851 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33,96■■■■□ 3,03
Gjd2O54851 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33,91■■■■□ 3,02
Gjd2O54851 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
Gjd2O54851 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,67■■■□□ 2,98
Gjd2O54851 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,57■■■□□ 2,97
Gjd2O54851 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33,56■■■□□ 2,96
Gjd2O54851 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC33,54■■■□□ 2,96
Gjd2O54851 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33,49■■■□□ 2,95
Gjd2O54851 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,47■■■□□ 2,95
Gjd2O54851 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,46■■■□□ 2,95
Gjd2O54851 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC33,39■■■□□ 2,94
Gjd2O54851 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33,34■■■□□ 2,93
Gjd2O54851 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33,31■■■□□ 2,92
Gjd2O54851 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33,3■■■□□ 2,92
Gjd2O54851 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33,3■■■□□ 2,92
Gjd2O54851 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33,26■■■□□ 2,91
Gjd2O54851 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33,19■■■□□ 2,9
Gjd2O54851 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33,18■■■□□ 2,9
Gjd2O54851 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,17■■■□□ 2,9
Gjd2O54851 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33,16■■■□□ 2,9
Gjd2O54851 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33,12■■■□□ 2,89
Gjd2O54851 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,1■■■□□ 2,89
Gjd2O54851 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC33,1■■■□□ 2,89
Gjd2O54851 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,1■■■□□ 2,89
Gjd2O54851 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,04■■■□□ 2,88
Gjd2O54851 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,01■■■□□ 2,88
Gjd2O54851 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33,01■■■□□ 2,87
Gjd2O54851 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32,96■■■□□ 2,87
Gjd2O54851 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32,93■■■□□ 2,86
Gjd2O54851 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,9■■■□□ 2,86
Gjd2O54851 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,87■■■□□ 2,85
Gjd2O54851 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,82■■■□□ 2,85
Gjd2O54851 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32,82■■■□□ 2,84
Gjd2O54851 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,73■■■□□ 2,83
Gjd2O54851 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,71■■■□□ 2,83
Gjd2O54851 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,65■■■□□ 2,82
Gjd2O54851 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,64■■■□□ 2,82
Gjd2O54851 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32,62■■■□□ 2,81
Gjd2O54851 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
Gjd2O54851 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32,58■■■□□ 2,81
Gjd2O54851 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32,55■■■□□ 2,8
Gjd2O54851 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Gjd2O54851 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,52■■■□□ 2,8
Gjd2O54851 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32,42■■■□□ 2,78
Gjd2O54851 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,36■■■□□ 2,77
Gjd2O54851 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,34■■■□□ 2,77
Gjd2O54851 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32,34■■■□□ 2,77
Gjd2O54851 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC32,32■■■□□ 2,76
Gjd2O54851 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,31■■■□□ 2,76
Gjd2O54851 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,31■■■□□ 2,76
Gjd2O54851 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,22■■■□□ 2,75
Gjd2O54851 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,21■■■□□ 2,75
Gjd2O54851 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC32,21■■■□□ 2,75
Gjd2O54851 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,19■■■□□ 2,74
Gjd2O54851 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32,16■■■□□ 2,74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40,4 ms