RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559257.5

USP3-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 5

Gene USP3, Length 2,217 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-211ENST00000559257 GANCQ8TET4 914 aa8.7□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 C7orf43Q8WVR3 580 aa8.7□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 TANKQ92844 425 aa8.7□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 NCLNQ969V3 563 aa8.7□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 C18orf8Q96DM3 657 aa8.7□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 APOPT1Q96IL0 206 aa8.7□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 C8orf37Q96NL8 207 aa8.7□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 CYP4F11Q9HBI6 524 aa8.7□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 PKD2L2Q9NZM6 624 aa8.7□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 TINAGQ9UJW2 476 aa8.7□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 DNMT3LQ9UJW3 386 aa8.7□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 CTNND2Q9UQB3 1225 aa8.7□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 RTL9Q8NET4 1388 aa8.7□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 A2ML1A8K2U0 1454 aa8.7□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa8.7□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 BTNL10A8MVZ5 291 aa8.7□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 H3BMQ9 156 aa8.7□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 GAS7O60861 476 aa8.7□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 NADKO95544 446 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 STAU1O95793 577 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 P4HBP07237 508 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 POLR2MP0CAP2 368 aa8.7□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 DLATP10515 647 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 SLC2A3P11169 496 aa8.7□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 RPS2P15880 293 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 SERPINB5P36952 375 aa8.7□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 CAP1Q01518 475 aa8.7□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 PAK1Q13153 545 aa8.7□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 HERC3Q15034 1050 aa8.7□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 CEP55Q53EZ4 464 aa8.7□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 EFHC1Q5JVL4 640 aa8.7□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 LDLRAD1Q5T700 205 aa8.7□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 ARSKQ6UWY0 536 aa8.7□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa8.7□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 HID1Q8IV36 788 aa8.7□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 ANKRD35Q8N283 1001 aa8.7□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 POMGNT1Q8WZA1 660 aa8.7□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 HMG20AQ9NP66 347 aa8.7□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa8.7□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 TAF6LQ9Y6J9 622 aa8.7□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 NALCNQ8IZF0 1738 aa8.7□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 CACNA1FO60840 1977 aa8.69□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 FAM47DPA6NHR8 397 aa8.69□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 H0YJX3 145 aa8.69□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 H3BNH8 94 aa8.69□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 WASLO00401 505 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 GIPC1O14908 333 aa8.69□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 ZBTB39O15060 712 aa8.69□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 CLPXO76031 633 aa8.69□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 NR3C2P08235 984 aa8.69□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 L1CAMP32004 1257 aa8.69□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 CASP3P42574 277 aa8.69□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 ALDH1A3P47895 512 aa8.69□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 GPLD1P80108 840 aa8.69□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 GRAMD1BQ3KR37 738 aa8.69□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 ZNF568Q3ZCX4 644 aa8.69□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 ARHGEF16Q5VV41 709 aa8.69□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 GPR142Q7Z601 462 aa8.69□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 ADGRF2Q8IZF7 708 aa8.69□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa8.69□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 POU5F2Q8N7G0 328 aa8.69□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 ADCY4Q8NFM4 1077 aa8.69□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 S100ZQ8WXG8 99 aa8.69□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 FEM1CQ96JP0 617 aa8.69□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 ART5Q96L15 291 aa8.69□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 MKNK1Q9BUB5 465 aa8.69□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 LGR6Q9HBX8 967 aa8.69□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 PKD2L1Q9P0L9 805 aa8.69□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa8.69□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 GINS2Q9Y248 185 aa8.69□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 GOLGA8SH3BPF8 625 aa8.69□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 I3L4J1 428 aa8.69□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 GAS2O43903 313 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 IMPDH1P20839 514 aa8.69□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 PTPREP23469 700 aa8.69□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 CASP1P29466 404 aa8.69□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 HLA-FP30511 346 aa8.69□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
USP3-211ENST00000559257 SSPNQ14714 243 aa8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms