RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512611.5

RAPGEF6-211, Transcript of Rap guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RAPGEF6, Length 3,683 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF6-211ENST00000512611 GABBR2O75899 941 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 JUNP05412 331 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 CXCL8P10145 99 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 ERVK-10P10266 1014 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 GPD2P43304 727 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 MYBPC1Q00872 1141 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 IRF9Q00978 393 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 WASHC5Q12768 1159 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 SNAPC2Q13487 334 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 TRPC3Q13507 836 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 CCDC14Q49A88 953 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 EEF1DP3Q658K8 133 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 TMEM198Q66K66 360 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 PDPK2PQ6A1A2 396 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 CASC4Q6P4E1 433 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 KBTBD6Q86V97 674 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 PYROXD2Q8N2H3 581 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 TTC13Q8NBP0 860 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 CLEC4CQ8WTT0 213 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 ADPGKQ9BRR6 497 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 CENPKQ9BS16 269 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 MINDY3Q9H8M7 445 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 PNPLA8Q9NP80 782 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 TMOD2Q9NZR1 351 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 LZTS1Q9Y250 596 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP7.05□□□□□ -1.283e-6■■■■■ 137.9
RAPGEF6-211ENST00000512611 FAM159BA6NKW6 160 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 NEMP1O14524 444 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 AIM2O14862 343 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 CHADO15335 359 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 ENDOD1O94919 500 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 FBXO21O94952 628 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 NFICP08651 508 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 ALDH1A3P47895 512 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 CHN2P52757 468 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 C6orf163Q5TEZ5 329 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 BRSK2Q8IWQ3 736 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 CPNE9Q8IYJ1 553 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 HIC2Q96JB3 615 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 LGMNQ99538 433 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 COG4Q9H9E3 785 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 GPAMQ9HCL2 828 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
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RAPGEF6-211ENST00000512611 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 GOLGA8TH3BQL2 631 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 WNT10BO00744 389 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 ADCY3O60266 1144 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 CHRNGP07510 517 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 ASNSP08243 561 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 CCND2P30279 289 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 MLH1P40692 756 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 TMEM132BQ14DG7 1078 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 DUOXA2Q1HG44 320 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 XKR3Q5GH77 459 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 FBXW8Q8N3Y1 598 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 SNX31Q8N9S9 440 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 FAM110BQ8TC76 370 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 ACTRT2Q8TDY3 377 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 IFT122Q9HBG6 1241 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF302Q9NR11 478 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 EFR3BQ9Y2G0 817 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa7.05□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 C2CD4BA6NLJ0 364 aa7.04□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 PLIN3O60664 434 aa7.04□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 USP12O75317 370 aa7.04□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 FKBP6O75344 327 aa7.04□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZBED1O96006 694 aa7.04□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 LTFP02788 710 aa7.04□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 OATP04181 439 aa7.04□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 ITGA2BP08514 1039 aa7.04□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa7.04□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 NAMPTP43490 491 aa7.04□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 BCAR1P56945 870 aa7.04□□□□□ -1.28
RAPGEF6-211ENST00000512611 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
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